Job Description P28629 Confidence 99.24% Date Wed Jan 25 15:20:47 GMT 2012 Rank 226 Aligned Residues 328 % Identity 14% Template c3hmuA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:aminotransferase, class iii; PDBTitle: crystal structure of a class iii aminotransferase from2 silicibacter pomeroyi Resolution 2.10 Å

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		198	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.			.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.									.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.
Query SS confidence																										.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.
Query Sequence		G	S	L	L	D	H	T	G	A	F	G	E	S	E	K	Y	A	A	R	V	F	G	A	D	.	.	R	S	W	S	V	V	V	G	T	S	G	S	N	R	T	I	M	Q	A	C	M	.	.	.	.	.	.	.	.	T	D	N	D	V	V	V	V	D	R	N	C	H	K	S	I	E	Q	G	L	M	L	T	.	.
Query Conservation																										.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.
Alig confidence																										.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	F	F	K	T	T	H	V	P	A	I	A	L	A	Q	K	L	A	E	L	A	P	G	D	L	N	H	V	F	F	A	G	G	G	S	E	A	N	D	T	N	I	R	M	V	R	T	Y	W	Q	N	K	G	Q	P	E	K	T	V	I	I	S	R	K	N	A	Y	H	G	S	T	V	A	S	S	A	L	G	G	M
Template Known Secondary structure		S	S	S	S																	S		T	T								S	S																			T	T		T	T								T	T					S	S							S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.
													266	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.		.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.			.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.																							.	.							.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.																							.	.							.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	A	K	P	V	Y	M	V	P	S	R	N	R	Y	G	I	I	G	P	I	Y	P	Q	E	M	Q	P	E	T	L	Q	K	K	I	S	E	.	S	P	L	T	K	D	K	A	G	Q	K	P	S	Y	C	V	V	T	N	C	T	Y	.	.	D	G	V	C	Y	N	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.																							.	.							.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.			.	.	.	.	.	.	.	.													.	.							.	.
Template Conservation																																																				.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	G	M	H	A	Q	S	G	L	I	P	D	V	H	H	I	N	Q	P	N	W	W	A	E	G	G	D	M	D	P	E	E	F	G	L	A	R	A	R	E	L	E	E	A	I	L	E	L	G	E	.	.	.	.	.	.	.	.	N	R	V	A	A	F	I	A	E	P	V	Q	G	A	G	G	V	I	V	A	P	D
Template Known Secondary structure							T	T				S	S														T	T																							G	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G								S	S	B	S	T	T	T		B				T
Template Predicted Secondary structure																																																				.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.									220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.
				330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.		.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.																																																															.
Query SS confidence		.	.																																																															.
Query Sequence		.	.	A	K	E	A	Q	D	L	L	E	K	T	S	D	R	L	H	F	D	E	A	W	Y	G	Y	A	R	F	N	P	I	Y	A	D	H	Y	A	M	R	G	E	P	G	D	H	N	G	P	T	V	F	A	T	H	S	T	H	K	L	L	N	A	L	.	S	Q	A	S	Y	I	H	V	R	E	G	R	G	A	I
Query Conservation		.	.																																																															.
Alig confidence		.	.																																.											.	.	.	.	.	.	.						.	.							.												.	.	.
Template Conservation																																			.											.	.	.	.	.	.	.						.	.																			.	.	.
Template Sequence		S	Y	W	P	E	I	Q	R	I	C	D	K	Y	D	I	L	L	I	A	D	E	V	I	C	G	F	G	R	T	G	N	W	F	.	G	T	Q	T	M	G	I	R	P	H	.	.	.	.	.	.	.	I	M	T	I	A	.	.	K	G	L	S	S	G	Y	A	P	I	G	G	S	I	V	C	D	E	.	.	.	V
Template Known Secondary structure		T												T	T								T	T	T	T	T	T	T	T	S	S	S		.						T				S	.	.	.	.	.	.	.						.	.	G	G	G	T	T	T	S	S											.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																			.											.	.	.	.	.	.	.						.	.																			.	.	.
Template SS confidence
		242	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.		.	.	.	.	.	280	.	.	.	.								.	.	.	.	.			290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.				.
		407	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	F	S	R	F	N	Q	A	Y	M	M	H	A	T	T	S	P	L	Y	A	I	C	A	S	N	D	V	A	V	S	M	M	D	G	N	S	G	L	S	L	T	Q	E	V	I	D	E	A	V	D	F	R	Q	A	M	A	R	L	Y	K	E	F	T	A	D	G	S	W	F	F	K	P	W	N	K	E	V	V	T	D
Query Conservation
Alig confidence																																					.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																					.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	H	V	I	G	K	D	E	F	N	H	G	Y	T	Y	S	G	H	P	V	A	A	A	V	A	L	E	N	L	R	I	L	E	E	E	.	.	.	N	I	L	D	H	V	R	N	V	A	A	P	Y	L	K	E	K	W	E	A	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure						T	T	S							T	T	T	T																		T	.	.	.	T								T											G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																					.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		309	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.				.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.
		487	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.														.	.	550	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	Q	T	G	K	T	Y	D	F	A	D	A	P	T	K	L	L	T	T	V	Q	D	C	W	V	M	H	P	G	E	S	W	H	G	F	K	D	I	P	D	N	W	S	M	L	D	P	I	K	V	S	I	L	A	P	G	M	G	E	D	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	L	E	E	T	G
Query Conservation																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	D	H	P	L	V	G	E	A	K	I	V	G	M	M	A	S	I	A	L	T	P	N	K	A	S	R	A	K	F	A	S	E	P	G
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	S	T	T								T	T								S		G	G	G	T			B	S	S		T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																															365	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		554	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	P	A	A	L	V	T	A	W	L	G	R	H	G	I	V	P	T	R	T	T	D	F	Q	I	M	F	L	F	S	M	G	V	T	R	G	K	W	G	T	L	V	N	T	L	C	S	F	K	R	H	Y	D	A	N	T	P	L	A	Q	V	M	P
Query Conservation
Alig confidence																			.
Template Conservation																			.
Template Sequence		T	I	G	Y	I	C	R	E	R	C	F	A	N	N	L	I	M	.	R	H	V	G	D	R	M	I	I	S	P	P	L	V	I	T	P	A	E	I	D	E	M	F	V	R	I	R	K	S	L	D	E	A	Q	A	E	I	E	K	Q	G	L	M	K
Template Known Secondary structure														T	T	B			.				T	T								T	T																												T
Template Predicted Secondary structure																			.
Template SS confidence
		400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.		.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.