Job Description P28629 Confidence 99.41% Date Wed Jan 25 15:20:47 GMT 2012 Rank 221 Aligned Residues 375 % Identity 15% Template c3eleB_ PDB info PDB header:transferase Chain: B: PDB Molecule:amino transferase; PDBTitle: crystal structure of amino transferase (rer070207001803) from2 eubacterium rectale at 2.10 a resolution Resolution 2.10 Å

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		131	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.		.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																	.
Query SS confidence																																	.
Query Sequence		M	T	R	Y	R	Q	Q	L	L	P	P	L	F	S	A	L	M	K	Y	S	D	I	H	E	Y	S	W	A	A	P	G	.	H	Q	G	G	V	G	F	T	K	T	P	A	G	R	F	Y	H	D	Y	Y	G	E	N	L	F	R	T	D	M	G	I	E	R	T	S	L	G	S	L	L	D	H	T	G	A	F	G	E
Query Conservation																																	.
Alig confidence																																	.																															.
Template Conservation																																																																.
Template Sequence		E	S	X	Y	Q	L	G	S	V	R	S	A	I	R	E	L	F	E	Y	G	K	K	R	A	A	I	V	G	K	E	N	V	Y	D	F	S	I	G	N	P	S	I	P	A	P	Q	I	V	N	D	T	I	K	E	L	V	T	D	Y	D	S	V	.	A	L	H	G	Y	T	S	A	Q	G	D	V	E	T	R	A	A
Template Known Secondary structure										S																				G	G	G											S																	S				.				S				T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																.
Template SS confidence
		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.		.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.
		210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.				.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.		.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.																					.
Query SS confidence																.	.	.																					.
Query Sequence		S	E	K	Y	A	A	R	V	F	G	A	D	R	S	.	.	.	W	S	V	V	V	G	T	S	G	S	N	R	T	I	M	Q	A	C	M	T	.	D	N	D	V	V	V	V	D	R	N	C	H	K	S	I	E	Q	G	L	M	L	T	G	A	K	P	V	Y	M	V	P	S	R	N	R	Y	G	I	I	G	P	I
Query Conservation																.	.	.																					.
Alig confidence																.	.	.																					.																																							.	.	.	.
Template Conservation																																																																														.	.	.	.
Template Sequence		I	A	E	F	L	N	N	T	H	G	T	H	F	N	A	D	N	L	Y	X	T	X	G	A	A	A	S	L	S	I	C	F	R	A	L	T	S	D	A	Y	D	E	F	I	T	I	A	P	Y	F	P	E	Y	K	V	F	V	N	A	A	G	A	R	L	V	E	V	P	A	D	T	E	H	F	Q	I	.	.	.	.
Template Known Secondary structure																G	G	G					S	S															S	T	T							S	S			T	T								T	T										T	T	T	S	S		.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																														.	.	.	.
Template SS confidence
		84	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		286	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.		.	.	.	.	.				330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.							.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																									.						.	.	.													.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																									.						.	.	.													.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	P	Q	E	M	Q	P	E	T	L	Q	K	K	I	S	E	S	P	L	T	K	D	K	A	G	Q	K	P	S	Y	C	V	V	T	N	C	T	Y	D	.	G	V	C	Y	N	.	.	.	A	K	E	A	Q	D	L	L	E	K	T	S	.	.	.	.	.	.	D	R	L	H	F	D	E	A	W	Y	G	Y	A	R
Query Conservation																																									.						.	.	.													.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.						.	.	.													.	.	.	.	.	.											.
Template Conservation		.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	D	F	D	A	L	E	E	R	I	N	A	H	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	G	V	I	I	N	S	P	N	N	P	S	G	T	V	Y	S	E	E	T	I	K	K	L	S	D	L	L	E	K	K	S	K	E	I	G	R	P	I	F	I	I	A	D	E	P	Y	R	.	E	I	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.								T			T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							S	S		T	T	T																								T	S									T	T	T	.	T		B
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.
Template SS confidence
							160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.											.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220		.	.	.
		356	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.		390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																				.
Query SS confidence																																				.
Query Sequence		F	N	P	I	Y	A	D	H	Y	A	M	R	G	E	P	G	D	H	N	G	P	T	V	F	A	T	H	S	T	H	K	L	L	N	.	A	L	S	Q	A	S	Y	I	H	V	R	E	G	R	G	A	I	N	F	S	R	F	N	Q	A	Y	M	M	H	A	T	T	S	P	L	Y	A	I	C	A	S	N	D	V	A
Query Conservation																																				.
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.												.															.	.
Template Conservation																		.	.	.	.	.	.	.																											.	.
Template Sequence		Y	D	G	I	K	V	P	F	V	T	K	Y	Y	D	N	T	.	.	.	.	.	.	.	L	V	C	Y	S	Y	S	K	S	L	S	L	P	G	E	R	I	G	Y	V	L	V	P	D	E	V	.	.	Y	D	K	A	E	L	Y	A	A	V	C	G	A	G	R	A	L	G	Y	V	C	A	P	S	L	F	Q	K	X
Template Known Secondary structure			T	T						G	G	G	T		S	S		.	.	.	.	.	.	.						S	T	T	T	S	S		G	G	G									T	T	S	.	.	T	T															T	T				S
Template Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.																											.	.
Template SS confidence
		224	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.								240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.			.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.
		435	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	S	M	M	D	G	N	S	G	L	S	L	T	Q	E	V	I	D	E	A	V	D	F	R	Q	A	M	A	R	L	Y	K	E	F	T	A	D	G	S	W	F	F	K	P	W	N	K	E	V	V	T	D	P	Q	T	G	K	T	Y	D	F	A	D	A	P	T	K	L	L	T	T	V	Q	D	C	W	V	M	H	P
Query Conservation
Alig confidence									.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation									.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	V	K	C	Q	G	A	.	.	T	G	D	I	N	A	Y	K	E	N	R	D	L	L	Y	E	G	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			T	T		T	T		.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure									.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		295	.	.	.	.	300	.			.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		515	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.			.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.
Predicted Secondary structure																																																																		.	.
Query SS confidence																																																																		.	.
Query Sequence		G	E	S	W	H	G	F	K	D	I	P	D	N	W	S	M	L	D	P	I	K	V	S	I	L	A	P	G	M	G	E	D	G	E	L	E	E	T	G	V	P	A	A	L	V	T	A	W	L	G	R	H	G	I	V	P	T	R	T	T	D	F	Q	I	.	.	M	F	L	F	S	M	G	V	T	R	G	K	W	G
Query Conservation																																																																		.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	R	I	G	Y	H	C	F	K	P	D	G	A	F	Y	X	F	V	K	A	L	E	D	D	S	N	A	F	C	E	K	A	K	E	E	D	V	L	I	V	A	A	D	G	F	G	C	P	G	W	V	R	I	S	Y	C	V	D	R	E	X	I	K
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T							S	B	S	S							S	S	S												T	T						G	G	G	G	T		T	T								S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																			320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.
		593	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	L	V	N	T	L	C	S	F	K	R	H	Y	D	A
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		H	S	X	P	A	F	E	K	I	Y	K	K	Y	N	K
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		383	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.