Job Description P28629 Confidence 99.53% Date Wed Jan 25 15:20:47 GMT 2012 Rank 203 Aligned Residues 318 % Identity 15% Template c3a8uX_ PDB info PDB header:transferase Chain: X: PDB Molecule:omega-amino acid--pyruvate aminotransferase; PDBTitle: crystal structure of omega-amino acid:pyruvate aminotransferase Resolution 1.40 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		199	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.			.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.									.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																						.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	L	L	D	H	T	G	A	F	G	E	S	E	K	Y	A	A	R	V	F	.	.	G	A	D	R	S	W	S	V	V	V	G	T	S	G	S	N	R	T	I	M	Q	A	C	.	.	.	.	.	.	.	.	M	T	D	N	D	V	V	V	V	D	R	N	C	H	K	S	I	E	Q	G	L	M	L	T	G	A	K
Query Conservation																						.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																						.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	F	Q	Y	G	H	P	L	S	F	Q	L	A	E	K	I	T	D	L	T	P	G	N	L	N	H	V	F	F	T	D	S	G	S	E	C	A	L	T	A	V	K	M	V	R	A	Y	W	R	L	K	G	Q	A	T	K	T	K	M	I	G	R	A	R	G	Y	H	G	V	N	I	A	G	T	S	L	G	G	V	N
Template Known Secondary structure		S	S	S															T	T	S	S	T	T								S	S																			T	T		T	T								T	T					S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		87	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.
		269	270																.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.			.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																						.	.							.	.
Query SS confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																						.	.							.	.
Query Sequence		P	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	M	V	P	S	R	N	R	Y	G	I	I	G	P	I	Y	P	Q	E	M	Q	P	E	T	L	Q	K	K	I	S	E	S	P	L	T	K	D	K	A	G	Q	K	P	S	Y	C	V	V	T	N	C	T	Y	.	.	D	G	V	C	Y	N	.	.
Query Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																						.	.							.	.
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.														.	.							.	.
Template Conservation																																																				.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	N	R	K	L	F	G	Q	P	M	Q	D	V	D	H	L	P	H	T	L	L	A	S	N	A	Y	S	R	G	M	P	K	E	G	G	I	A	L	A	D	E	L	L	K	L	I	E	L	H	D	.	.	.	.	.	.	.	A	S	N	I	A	A	V	F	V	E	P	L	A	G	S	A	G	V	L	V	P	P	E
Template Known Secondary structure					T	T	T				S		S										G	G	G	T	T		S	S	S		S	S	S																	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G								S	S	B	T	T	T	T		B				T
Template Predicted Secondary structure																																																				.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		167	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.								.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.
				330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.
Query SS confidence		.	.
Query Sequence		.	.	A	K	E	A	Q	D	L	L	E	K	T	S	D	R	L	H	F	D	E	A	W	Y	G	Y	A	R	F	N	P	I	Y	A	D	H	Y	A	M	R	G	E	P	G	D	H	N	G	P	T	V	F	A	T	H	S	T	H	K	L	L	N	A	L	S	Q	A	S	Y	I	H	V	R	E	G	R	G	A	I	N
Query Conservation		.	.
Alig confidence		.	.																																.											.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																			.											.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	Y	L	K	R	N	R	E	I	C	N	Q	H	N	I	L	L	V	F	D	E	V	I	T	G	F	G	R	T	G	S	M	F	.	G	A	D	S	F	G	V	T	P	D	.	.	.	.	.	.	.	L	M	C	I	A	K	Q	V	T	N	G	A	I	P	M	G	A	V	I	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T													T								T	T	T	T	T	T	T	T	S	S	S	S	.						T				S	.	.	.	.	.	.	.						G	G	G	G	T	T	S	S								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																			.											.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.		.	.	.	.	.	.	.	280	.	.								.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.
		408	.	410	.	.	.	.	.													.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	S	R	F	N	Q	A	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	M	H	A	T	T	S	P	L	Y	A	I	C	A	S	N	D	V	A	V	S	M	M	D	G	N	S	G	L	S	L	T	Q	E	V	I	D	E	A	V	D	F	R	Q	A	M	A	R	L	Y	K	E	F	T	A	D	G	S	W	F
Query Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.
Template Conservation																																														.	.	.
Template Sequence		S	T	E	I	Y	Q	T	F	M	N	Q	P	T	P	E	Y	A	V	E	F	P	H	G	Y	T	Y	S	A	H	P	V	A	C	A	A	G	L	A	A	L	C	L	L	Q	.	.	.	K	E	N	L	V	Q	S	V	A	E	V	A	P	H	F	E	K	A	L	H	G	I	K	G	A	K	N	V	I	D	I	R	N
Template Known Secondary structure											T		S	S		T	T	S		S	S					T	T	T	T																	.	.	.		T	T																		T	T	T	T	S	T	T
Template Predicted Secondary structure																																														.	.	.
Template SS confidence
		303	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.				.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		476	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	K	P	W	N	K	E	V	V	T	D	P	Q	T	G	K	T	Y	D	F	A	D	A	P	T	K	L	L	T	T	V	Q	D	C	W	V	M	H	P	G	E	S	W	H	G	F	K	D	I	P	D	N	W	S	M	L	D	P	I	K	V	S	I	L	A	P	G	M	G	E	D	G	E	L	E	E	T	G	V	P
Query Conservation
Alig confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	G	L	A	G	A	I	Q	I	A	P	R	D	G	D	A	I	V	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			T	T									B	T	T	B	S	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.
		556	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	A	L	V	T	A	W	L	G	R	H	G	I	V	P	T	R	T	T	D	F	Q	I	M	F	L	F	S	M	G	V	T	R	G	K	W	G	T	L	V	N	T	L	C	S	F	K	R	H	Y
Query Conservation
Alig confidence																	.
Template Conservation																	.
Template Sequence		P	F	E	A	G	M	A	L	W	K	A	G	F	Y	V	.	R	F	G	G	D	T	L	Q	F	G	P	T	F	N	S	K	P	Q	D	L	D	R	L	F	D	A	V	G	E	V	L	N	K	L
Template Known Secondary structure													T				.				T	T								T	T
Template Predicted Secondary structure																	.
Template SS confidence
		399	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.		.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.