Job Description P28629 Confidence 99.30% Date Wed Jan 25 15:20:47 GMT 2012 Rank 225 Aligned Residues 309 % Identity 12% Template c2zy3A_ PDB info PDB header:lyase Chain: A: PDB Molecule:l-aspartate beta-decarboxylase; PDBTitle: dodecameric l-aspartate beta-decarboxylase Resolution 2.50 Å

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		198	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.											.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.						.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.
Query Sequence		G	S	L	L	D	H	T	G	A	F	G	E	S	E	K	Y	A	A	R	V	F	G	A	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	S	W	S	V	V	V	G	T	S	G	S	N	R	T	I	M	Q	A	C	.	.	.	.	.	M	T	D	N	D	V	V	V	V	D	R	N	C	H	K	S	I	E	Q	G	L
Query Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		C	N	Y	P	V	P	P	R	M	L	N	I	S	E	K	I	V	R	Q	Y	I	I	R	E	M	G	A	D	A	I	P	S	E	S	V	N	L	F	A	V	E	G	G	T	A	A	M	A	Y	I	F	E	S	L	K	L	N	G	L	L	K	A	G	D	K	V	A	I	G	M	P	V	F	T	P	Y	I	E	I	P
Template Known Secondary structure			S			S	S	T	T																	T	T		T	T	S		G	G	G							S																T	T	S	S		T	T								S			T					S	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		132	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.
		263	.			.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.		.	.	.	.				.	.	330	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.	.																																																												.					.	.	.
Query SS confidence				.	.																																																												.					.	.	.
Query Sequence		M	L	.	.	T	G	A	K	P	V	Y	M	V	P	S	R	N	R	Y	G	I	I	G	P	I	Y	P	Q	E	M	Q	P	E	T	L	Q	K	K	I	S	E	S	P	L	T	K	D	K	A	G	Q	K	P	S	Y	C	V	V	T	N	C	T	Y	.	D	G	V	C	.	.	.	Y	N	A	K	E	A	Q	D	L
Query Conservation				.	.																																																												.					.	.	.
Alig confidence				.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.					.	.	.
Template Conservation																								.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	L	A	Q	Y	A	L	E	E	V	A	I	N	A	D	P	S	L	N	W	Q	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	P	D	S	E	L	D	K	L	K	D	P	A	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	I	F	F	C	V	N	P	S	N	P	P	S	V	K	M	D	Q	R	S	L	E	R	V	R	N	I
Template Known Secondary structure		T	S	T	T	T										B	G	G	G	T	S	B		.	.	.	.	.	.	.	.						G	G	G	G		T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							S	S		S	S	S		B
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		212	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.									.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.											.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.
		337	.	.	340	.			.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.			.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.
Predicted Secondary structure							.	.																																																.	.
Query SS confidence							.	.																																																.	.
Query Sequence		L	E	K	T	S	.	.	D	R	L	H	F	D	E	A	W	Y	G	Y	A	R	F	N	P	I	Y	A	D	H	Y	A	M	R	G	E	P	G	D	H	N	G	P	T	V	F	A	T	H	S	T	H	K	L	L	.	.	N	A	L	S	Q	A	S	Y	I	H	V	R	E	G	R	G	A	I	N	F	S	R	F	N
Query Conservation							.	.																																																.	.
Alig confidence							.	.									.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.											.	.															.	.	.
Template Conservation																	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.
Template Sequence		V	A	E	H	R	P	D	L	M	I	L	T	D	D	V	.	.	.	Y	G	T	F	A	D	D	F	Q	S	L	F	A	I	C	P	E	N	T	.	.	.	.	.	.	.	L	L	V	Y	S	F	S	K	Y	F	G	A	T	G	W	R	L	G	V	V	A	A	H	Q	Q	N	.	.	.	V	F	D	L	A	L	D
Template Known Secondary structure					T		T	T								T	.	.	.	T	G	G	G	S	S	S									G	G	G		.	.	.	.	.	.	.						S	T	T	T	T	T		G	G	G									S	S		.	.	.
Template Predicted Secondary structure																	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.
Template SS confidence
		274	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.				.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.								.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.				.	.	.	.	.	.	340
																																				413	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	A	Y	M	M	H	A	T	T	S	P	L	Y	A	I	C	A	S	N	D	V	A	V	S	M	M	D	G	N	S	G	L	S	L	T	Q	E	V	I	D	E	A	V	D	F	R
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	L	Q	E	S	E	K	V	A	L	D	H	R	Y	R	S	L	L	P	D	V	R	S	L	K	F	I	D	R	L	V	A	D	S	R	A	V	A	L	N	H	T	A	G	L	S	T	P	Q	Q	V	Q	M	A	L	F	S	L	F	A	L	M	D	E	A	D	E	Y	K	H	T	L	K	Q	L	I	R	R	R	E
Template Known Secondary structure		S	S												T	T	T	T		S		G	G	G											T	T	T	T	T	T	G	G	G		S	S																			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		341	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
		459	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	A	M	A	R	L	Y	K	E	F	T	A	D	G	S	W	F	F	K	P	W	N	K	E	V	V	T	D	P	Q	T	G	K	T	Y	D	F	A	D	A	P	T	K	L	L	T	T	V	Q	D	C	W	V	M	H	P	G	E	S	W	H	G	F	K	D	I	P	D	N	W	S	M	L	D	P	I	K	V	S	I
Query Conservation
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	T	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	R	E	L	G	M	P	P
Template Known Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		421	.	.																																																																						.	.	.	.	.	.	430	.
		539	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.						.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.
Query SS confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.
Query Sequence		L	A	P	G	M	G	E	D	G	E	L	E	E	T	G	V	P	A	A	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	T	A	W	L	G	R	H	G	I	V	P	T	R	.	.	.	.	.	T	T	D	F	Q	I	M	F	L	F	S	M	G	V	T	R	G	K	W	G
Query Conservation																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.
Alig confidence								.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.												.
Template Conservation								.																																																																	.
Template Sequence		L	R	D	E	N	A	.	V	D	Y	Y	T	L	I	D	L	Q	D	V	T	A	K	L	Y	G	E	A	F	S	E	W	A	V	K	Q	S	S	T	G	D	M	L	F	R	I	A	D	E	T	G	I	V	L	L	P	G	R	G	F	G	S	N	R	P	S	G	R	A	S	L	A	.	N	L	N	E	Y	E	Y	A
Template Known Secondary structure					T	T	B	.			S																																								S								S	S		T	T	S							S	S	.	S	S
Template Predicted Secondary structure								.																																																																	.
Template SS confidence
		432	.	.	.	.	.		.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.		.	.	.	.	.	.	.	.
		593	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	L	V	N	T	L	C	S	F	K	R	H	Y	D	A	N
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		A	I	G	R	A	L	R	K	M	A	D	E	L	Y	A	E
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.