Job Description P28629 Confidence 99.90% Date Wed Jan 25 15:20:47 GMT 2012 Rank 31 Aligned Residues 315 % Identity 14% Template c2z9wA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:aspartate aminotransferase; PDBTitle: crystal structure of pyridoxamine-pyruvate aminotransferase complexed2 with pyridoxal Resolution 1.70 Å

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		206	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.		.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.
Query SS confidence																				.
Query Sequence		A	F	G	E	S	E	K	Y	A	A	R	V	F	G	A	D	R	S	.	W	S	V	V	V	G	T	S	G	S	N	R	T	I	M	Q	A	C	M	T	D	N	D	V	V	V	V	D	R	N	C	H	K	S	I	E	Q	G	L	M	L	T	G	A	K	P	V	Y	M	V	P	S	R	N	R	Y	G	I	I	G	P
Query Conservation																				.
Alig confidence																				.																																																												.	.
Template Conservation																																																																																.	.
Template Sequence		L	Y	E	K	V	V	D	K	A	Q	K	A	M	R	L	S	N	K	P	V	I	L	H	G	E	P	V	L	G	L	E	A	A	A	A	S	L	I	S	P	D	D	V	V	L	N	L	A	S	G	V	Y	G	K	G	F	G	Y	W	A	K	R	Y	S	P	H	L	L	E	I	E	V	P	Y	N	E	A	I	.	.
Template Known Secondary structure														T	T		S	S						S	S		T														T	T								S	S															S									T	T	S			.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																																.	.
Template SS confidence
		44	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.
		285	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.		.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.
Predicted Secondary structure																																									.
Query SS confidence																																									.
Query Sequence		I	Y	P	Q	E	M	Q	P	E	T	L	Q	K	K	I	S	E	S	P	L	T	K	D	K	A	G	Q	K	P	S	Y	C	V	V	T	N	C	T	Y	.	D	G	V	C	Y	N	A	K	E	A	Q	D	L	L	E	K	T	S	D	R	L	H	F	D	E	A	W	Y	G	Y	A	R	F	N	P	I	Y	A	D	H
Query Conservation																																									.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.													.																																						.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.																																																			.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	D	P	Q	A	V	A	D	M	L	K	A	H	P	.	.	.	.	.	.	.	.	E	I	T	V	V	S	V	C	H	H	D	T	P	S	G	T	I	N	P	I	D	A	I	G	A	L	V	S	A	H	G	A	Y	L	I	V	D	A	V	S	S	F	G	G	M	K	T	H	P	E	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.													T	.	.	.	.	.	.	.	.	T								S			G	G	G	T															T	T								T	T	T	B	T	T	B	S			G	G	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.																																																			.	.	.
Template SS confidence
								122	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.									.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.
		364	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							420	.
Predicted Secondary structure																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	A	M	R	G	E	P	G	D	H	N	G	P	T	V	F	A	T	H	S	T	H	K	L	L	N	A	L	S	Q	A	S	Y	I	H	V	R	E	G	R	G	A	I	N	F	S	R	F	N	Q	A	Y	M	M	H	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T
Query Conservation																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.						.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.						.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	D	C	K	A	D	.	.	.	.	.	.	.	I	Y	V	T	G	P	N	K	C	L	G	A	P	P	G	L	T	M	M	G	.	.	.	.	.	.	.	V	S	E	R	A	W	A	K	M	K	A	N	P	L	A	P	R	A	S	M	L	S	I	V	D	W	E	N	A	W	S	R	D	K	P	F	P	F
Template Known Secondary structure		.	.	.	G	T	T		S	.	.	.	.	.	.	.						S	S	S	T	T				S							.	.	.	.	.	.	.											T		T	T	S			S	S	T	T		S	G	G	G	T	T	T	T	S	T	T	S			S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.						.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
					185	.	.	.	.								190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.								210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.
		422	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	P	L	Y	A	I	C	A	S	N	D	V	A	V	S	M	M	D	G	N	S	G	L	S	L	T	Q	E	V	I	D	E	A	V	D	F	R	Q	A	M	A	R	L	Y	K	E	F	T	A	D	G	S	W	F	F	K	P	W	N	K	E	V	V	T	D	P	Q	T	G	K	T	Y	D	F	A	D	A	P	T	K
Query Conservation
Alig confidence																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	P	S	V	S	E	I	N	G	L	D	V	A	L	D	L	Y	L	N	E	G	P	E	A	V	W	A	R	H	A	L	T	A	K	A	M	R	A	G	V	T	A	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		248	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290
		502	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570						.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																							.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																							.	.	.	.	.
Query Sequence		L	L	T	T	V	Q	D	C	W	V	M	H	P	G	E	S	W	H	G	F	K	D	I	P	D	N	W	S	M	L	D	P	I	K	V	S	I	L	A	P	G	M	G	E	D	G	E	L	E	E	T	G	V	P	A	A	L	V	T	A	W	L	G	R	H	G	I	V	P	.	.	.	.	.	T	R	T	T	D	F
Query Conservation																																																																							.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.							.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.							.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	L	S	V	W	A	A	S	D	S	I	A	S	P	T	T	T	A	V	R	T	P	D	.	G	V	D	E	K	A	.	.	.	.	.	.	.	.	L	R	Q	A	A	R	A	R	Y	G	V	V	F	S	S	G	R	G	E	T	L	G	K	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T			B	S	S	S	S	G	G	G	B		S	S								T	.	T						.	.	.	.	.	.	.	.														B				G	G	G	T	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.							.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																				291	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.		.	.	.	.	.	.									320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.
		577	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	I	M	F	L	F	S	M	G	V	T	R	G	K	W	G	T	L	V	N	T	L	C	S	F	K	R	H	Y	D	A	N	T	P	L	A	Q	V	M	P	E	L	V	E
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		T	R	I	G	H	M	G	P	T	A	Q	P	I	Y	A	I	A	A	L	T	A	L	G	G	A	M	N	A	A	G	R	K	L	A	I	G	K	G	I	E	A	A	L	A
Template Known Secondary structure								G	G	G		S																		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		344	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.