Job Description P28629 Confidence 99.83% Date Wed Jan 25 15:20:47 GMT 2012 Rank 69 Aligned Residues 292 % Identity 16% Template c2cb1A_ PDB info PDB header:lyase Chain: A: PDB Molecule:o-acetyl homoserine sulfhydrylase; PDBTitle: crystal structure of o-actetyl homoserine sulfhydrylase2 from thermus thermophilus hb8,oah2. Resolution 2.0 Å

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		208	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.					.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																											.	.	.	.
Query SS confidence																																																											.	.	.	.
Query Sequence		G	E	S	E	K	Y	A	A	R	V	F	G	A	D	R	S	W	S	V	V	V	G	T	S	G	S	N	R	T	I	M	Q	A	C	M	T	D	N	D	V	V	V	V	D	R	N	C	H	K	S	I	E	Q	G	L	M	L	.	.	.	.	T	G	A	K	P	V	Y	M	V	P	S	R	N	R	Y	G	I	I	G
Query Conservation																																																											.	.	.	.
Alig confidence																								.																																			.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																								.																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	A	L	E	E	R	L	K	A	L	E	G	A	L	E	A	V	V	L	A	S	G	.	Q	A	A	T	F	A	A	L	L	A	L	L	R	P	G	D	E	V	V	A	A	K	G	L	F	G	Q	T	I	G	L	F	G	Q	V	L	S	L	M	G	V	T	V	R	Y	V	D	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure													T		S						S	S		.										T	T			T	T							T	T												T	T	T	T	T	T								S	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																								.																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		59	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80		.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.
		284	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.		.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.
Predicted Secondary structure																																									.
Query SS confidence																																									.
Query Sequence		P	I	Y	P	Q	E	M	Q	P	E	T	L	Q	K	K	I	S	E	S	P	L	T	K	D	K	A	G	Q	K	P	S	Y	C	V	V	T	N	C	T	.	Y	D	G	V	C	Y	N	A	K	E	A	Q	D	L	L	E	K	T	S	D	R	L	H	F	D	E	A	W	Y	G	Y	A	R	F	N	P	I	Y	A	D
Query Conservation																																									.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.																																		.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	E	P	E	A	V	R	E	A	L	S	A	K	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	A	V	F	V	E	T	V	A	N	P	A	L	L	V	P	D	L	E	A	L	A	T	L	A	E	E	A	G	V	A	L	V	V	D	N	T	F	G	A	A	G	A	.	.	.	.	.	.	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	S										T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							S	S		T	T	T																	T								G	G	G	T	T	T	T	.	.	.	.	.	.	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
									129	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.											.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.							.
		363	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		H	Y	A	M	R	G	E	P	G	D	H	N	G	P	T	V	F	A	T	H	S	T	H	K	L	L	N	A	L	S	Q	A	S	Y	I	H	V	R	E	G	R	G	A	I	N	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	R	F	N	Q	A	Y	M	M	H	A	T	T	S	P	L	Y
Query Conservation																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation											.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		C	R	P	L	A	W	G	A	H	.	.	.	.	.	.	.	V	V	V	E	S	L	T	W	A	S	G	H	G	S	V	L	G	G	A	V	L	S	R	E	T	E	L	W	R	N	Y	P	Q	F	L	Q	P	W	E	A	L	R	A	R	C	F	P	E	R	V	R	T	L	G	L	S	L	C	G	M	A	L	S	P
Template Known Secondary structure				G	G	G	G	T		S	.	.	.	.	.	.	.										S		S	S													S	G	G	G	G	S	G	G	G	G							G	G	G											T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		186	.	.	.	190	.	.	.	.								.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.
		426	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	I	C	A	S	N	D	V	A	V	S	M	M	D	G	N	S	G	L	S	L	T	Q	E	V	I	D	E	A	V	D	F	R	Q	A	M	A	R	L	Y	K	E	F	T	A	D	G	S	W	F	F	K	P	W	N	K	E	V	V	T	D	P	Q	T	G	K	T	Y	D	F	A	D	A	P	T	K	L	L	T	T
Query Conservation
Alig confidence																		.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																		.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	N	A	Y	L	L	F	Q	G	L	E	T	V	A	L	R	.	.	.	.	.	V	A	R	M	S	E	T	A	R	F	L	A	E	R	L	Q	G	H	P	K	V	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure											G	G	G					.	.	.	.	.																	T		T	T		S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		267	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.						.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.
		506	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	Q	D	C	W	V	M	H	P	G	E	S	W	H	G	F	K	D	I	P	D	N	W	S	M	L	D	P	I	K	V	S	I	L	A	P	G	M	G	E	D	G	E	L	E	E	T	G	V	P	A	A	L	V	T	A	W	L	G	R	H	G	I	V	P	T	R	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.
Template Sequence		.	.	.	.	A	L	R	Y	P	G	L	P	E	D	P	A	H	R	N	A	R	K	Y	L	A	S	G	G	P	I	L	T	L	D	L	G	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	E	R	A	S	R	F	L	G	A	I	R	L	L	K	.	A	A	N	L	G	D	A	R	T	L	L	V	H	P
Template Known Secondary structure		.	.	.	.					T	T	S	T	T		T	T									S	S	S		S							S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												S	S			.		S			S		S	S						T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.
Template SS confidence
						305	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.														.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.		.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.
																					575	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	F	Q	I	M	F	L	F	S	M	G	V	T	R	G	K	W	G	T	L	V	N	T	L	C
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		W	T	T	T	H	S	R	L	K	E	E	A	R	L	Q	A	G	V	T	P	G	L	V	R	V	S	V	G	L	E	D	P	L	D	L	L	A	L	F	E	E	A	L	E
Template Known Secondary structure		T	T	T	T	T	T	T	S								T	T			T	T								S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		367	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410