Job Description P0A9E0 Confidence 58.20% Date Thu Jan 5 11:09:58 GMT 2012
Rank 452 Aligned Residues 147
% Identity 13% Template c3dv8A_
PDB info
PDB header: transcriptionChain: A: PDB Molecule: transcriptional regulator, crp/fnr family;
PDBTitle: crystal structure of a putative transcriptional regulator of the2 crp/fnr family (eubrec_1222) from eubacterium rectale atcc 33656 at3 2.55 a resolution
Resolution 2.55 Å
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67 . . 70 . . . . . . . . . 80 . . . . . . . . . 90 . . . . . . . .
. 100 . . . . . . . . . 110 . . . . . . . . . 120 . . . . . . . . . 130 . . . . . . . . . 140 . . . . .
Predicted Secondary structure  
.
Query SS confidence  
.
Query Sequence  
R P G D I L L F P P G E I H H Y G R H P E A R E W Y H Q W V Y F .
R P R A Y W H E W L N W P S I F A N T G F F R P D E A H Q P H F S D L F G Q I I N A G Q G E G
Query Conservation  
                                                          .                                                                                            
Alig confidence  
. . . . .
Template Conservation  
                                                                                                                                        . . . .  
Template Sequence  
D C T G L L L V K S G Q L R T Y I L S D E G R E I T L Y R L F D X D X C L L S A S C I X R S I Q F E V T I E A E K D T D L W I I P A E I Y K G I X K D .
.
.
.
S
Template Known Secondary structure  
S T T S T T S G G G G G G T T S S . . . .
Template Predicted Secondary structure  
. . . .
Template SS confidence  
   
42 . . . . . . . 50 . . . . . . . . . 60 . . . . . . . . . 70 . . . . . . . . . 80 . . . . . . . . . 90 . . . . . . . . . 100 . . . . . . . . . 110 . . . . . .
.
 
   
146 . . . 150 . . . . . . . . . 160 . . . . . . . . . 170 . . . . . . . . . 180 . . . . . . . . . 190 . . . .
. . . . . 200 . . . . . . . . . 210 . . . . . . .
Predicted Secondary structure  
. .
Query SS confidence  
.
.
Query Sequence  
R Y S E L L A I N L L E Q L L L R R M E A I N E S L H P P M D N R V R E A C Q Y I S D H L A D S N .
.
F D I A S V A Q H V C L S P S R L S H L F R Q
Query Conservation  
                                                                                          . .                            
Alig confidence  
. .
Template Conservation  
                                                                                                                         
Template Sequence  
A P V A N Y T N E L X A T R F S D V X W L I E Q I X W K S L D K R V A S F L L E E T S I E G T N E L K I T H E T I A N H L G S H R E V I T R X L R Y
Template Known Secondary structure  
S T S S T
Template Predicted Secondary structure  
Template SS confidence  
   
118 . 120 . . . . . . . . . 130 . . . . . . . . . 140 . . . . . . . . . 150 . . . . . . . . . 160 . . . . . . . . . 170 . . . . . . . . . 180 . . . . . . . . . 190 .
 
No model constructed - rank, confidence too low
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Please cite: Protein structure prediction on
the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols
4, 363 - 371 (2009) [pdf ] [Import into BibTeX ]