Job Description P14081 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:33:54 GMT 2012 Rank 33 Aligned Residues 253 % Identity 26% Template c3b8hA_ PDB info PDB header:biosynthetic protein/transferase Chain: A: PDB Molecule:elongation factor 2; PDBTitle: structure of the eef2-exoa(e546a)-nad+ complex Resolution 2.50 Å

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		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20															.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	A	T	A	G	H	V	D	H	G	K	T	T	L	L	Q	A	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	G	V	N	A	D	R	L	P	E	E	K	K	R	G	M	T	I	D	L	G	Y	A	Y	W	P	Q	P	D	G	R	V	P	G	F	I	D	V	P	G	H	E	K	F	L	S	N	M
Query Conservation																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.
Template Conservation																																																								.	.	.	.
Template Sequence		M	S	V	I	A	H	V	D	H	G	K	S	T	L	T	D	S	L	V	Q	R	A	G	I	I	S	A	G	I	T	I	K	S	T	A	I	S	L	Y	S	E	M	S	D	E	D	V	K	E	I	K	Q	K	T	.	.	.	.	D	G	N	S	F	L	I	N	L	I	D	S	P	G	H	V	D	F	S	S	E	V
Template Known Secondary structure								G	G	G	T													B								B																				S	S			.	.	.	.		S	S											S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																								.	.	.	.
Template SS confidence
		22	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.					.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.
		69	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	A	G	V	G	G	I	D	H	A	L	L	V	V	A	C	D	D	G	V	M	A	Q	T	R	E	H	L	A	I	L	Q	L	T	G	N	P	M	L	T	V	A	L	T	K	A	D	R	V	D	E	A	R	V	D	E	V	E	R	Q	V	K	E	V	L	R	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																							.															.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																							.															.
Template Sequence		T	A	A	L	R	V	T	D	G	A	L	V	V	V	D	T	I	E	G	V	C	V	Q	T	E	T	V	L	R	Q	A	L	G	E	R	I	K	.	P	V	V	V	I	N	K	V	D	R	A	L	L	E	.	L	Q	V	S	K	E	D	L	Y	Q	T	F	A	R	T	V	E	S	V	N	V	I	V	S	T	Y	A
Template Known Secondary structure							T		S								T	T	T	B	S														T	T			.														T	.	S																										S
Template Predicted Secondary structure																																							.															.
Template SS confidence
		116	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.		.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.		.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.
										136	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	Y	G	F	A	E	A	K	L	F	I	T	A	A	T	E	G	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	E	V	L	G	D	V	Q	V	Y	P	A	R	G	T	V	A	F	G	S	G	L	H	G	W	A	F	T	I	R	Q	F	A	T	R	Y	A	K	K	F	G	V	D	K	A	K	M	M	D	R	L	W	G	D	S	F	F	N	P	K	T	K	K	W	T	N	K	D	T	D	A	E	G	K	P	L	E	R	A	F
Template Known Secondary structure			G	G	G							G	G	G	T							T	T	T	T													T	T	T	T	T										S	S	S	S					T	T	T	T				S		S	B		T	T	S		B			B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		194	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.
																																																										153	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	M	D	A	L	R	E	H	L	L	Q	L	P	E	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	M	F	I	L	D	P	I	F	R	L	F	T	A	I	M	N	F	K	K	D	E	I	P	V	L	L	E	K	L	E	I	V	L	K	G	D	E	K	D	L	E	G	K	A	L	L	K	V	V	M	R	K	F	L	P	A	A	D	A	L	L	E	M	I	V	L	H	L	P	S	P	V	T	A	Q	A	Y	R	A
Template Known Secondary structure					T													T	T		T	T									T	T					G	G	G	G	G															S	B													S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		274	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.
																			168	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190		.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.										.	.	.	.	.	.	220
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	H	A	S	Q	H	S	F	R	L	A	I	D	R	A	F	T	V	K	G	A	G	L	.	V	V	T	G	T	A	L	S	G	E	V	K	V	G	D	S	L	W	L	T	G	V	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	P	M	R	V	R	A
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	Q	L	Y	E	G	P	A	D	D	A	N	C	I	A	I	K	N	C	D	P	K	A	D	L	M	L	Y	V	S	K	M	V	P	T	S	D	K	G	R	F	Y	A	F	G	R	V	F	A	G	T	V	K	S	G	Q	K	V	R	I	Q	G	P	N	Y	V	P	G	K	K	D	D	L	F	I	K	A	I	Q	R
Template Known Secondary structure					B	S	S		T	T	S								T	T		S	S	S	S											B	S	S	T	T											S				T	T								T	T			S	S	S		T	T							S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		354	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.
		221	.	.	.	.					.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure							.	.	.	.
Query SS confidence							.	.	.	.
Query Sequence		L	H	A	Q	N	.	.	.	.	Q	P	T	E	T	A	N	A	G	Q	R	I	A	L	N	I	A	G	D	A	E	K	E	Q	I	N	R	G	D	W	L	L	A	D	V	P	P	E	P	F
Query Conservation							.	.	.	.
Alig confidence							.	.	.	.																.	.	.			.
Template Conservation																										.	.	.			.
Template Sequence		V	V	L	M	M	G	R	F	V	E	P	I	D	D	C	P	A	G	N	I	I	G	L	V	.	.	.	G	I	.	D	Q	F	L	L	K	T	G	T	L	T	T	S	E	T	A	H	N	M
Template Known Secondary structure							T	T						S				T	T							.	.	.	S		.	T	T	T		S	S						S		T	T				B
Template Predicted Secondary structure																										.	.	.			.
Template SS confidence
		434	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.				.	.		460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low