Job Description P0A6K6 Confidence 99.18% Date Wed Jan 25 15:20:15 GMT 2012 Rank 34 Aligned Residues 324 % Identity 19% Template c2w0yB_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:alkaline phosphatase; PDBTitle: h.salinarum alkaline phosphatase Resolution 1.7 Å

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	R	A	F	I	M	V	L	D	S	F	G	I	G	A	T	E	D	A	E	R	F	G	D	V	G	A	D	T	L	G	H	I	A	E	A	C	A	K	G	E	A	D	N	G	R	K	G	P	L	N	L	P	N	L	T	R	L	G	L	A	K	A	H	E	G	S	T	G	F	I	P	A	G	M	D	G	N	A	E
Query Conservation
Alig confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	N	A	I	A	Y	I	V	D	G	M	G	Q	T	Q	I	S	A	A	R	Y	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	A	Y	K	T	A	P	E	R	F	P	L	N	V	S	P	A	E	T	P	T	G	F	D	A	F	S	S	R	G	S	M	T	T	F	P	D	D	P	Y	E	T	T	T	D	S	A	A
Template Known Secondary structure		S								T	T													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							T	T	T	T	T	G	G	G	S	T	T	T	S			T	G	G	G	S	S												S	S		S	S
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		48	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.											70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.
		82	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.
Predicted Secondary structure																																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	I	G	A	Y	A	W	A	H	E	M	S	S	G	K	D	T	P	S	G	H	W	E	I	A	G	V	P	V	L	F	E	W	G	Y	F	S	D	H	E	N	S	F	P	Q	E	L	L	D	K	L	V	E	R	A	N	L	P	G	Y	L	G	N	C	H	S	S	G	T	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	A	T	A	F	A	S	G	V	K	T	Y	N	G	A	I	G	G	V	Q	T	S	G	G	G	F	Q	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	D	T	V	L	E	R	A	S	A	Q	G	Y	A	T	G	L	I	T	T	T	E	A	T	H	A	T	P	A	A	F	A	A	H	V	E	D
Template Known Secondary structure									S					T	T		B	S					T	T	T					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												T											T	T	S										B	S	S
Template Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		118	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.																.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.
												152	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	L	D	Q	L	G	E	E	H	M	K	T	G	K	P	I	F	Y	T	S	A	D	S	V	F	Q	I	A	C	H	E	E	T	F	G	L	D	K	L	Y	E	L	C	E	I	A	R	E	E	L	T	N	G	G	Y	N	I	G	R	V	I	A	R	P	F	I	G	D	K	A
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	G	N	Q	T	E	I	A	R	Q	Y	I	E	E	T	Q	P	D	V	I	L	G	G	Q	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	D	F	E	A	D	A	S	N	G	G	T	L	V	D	A	A	R	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	G
Template Known Secondary structure		T	T												T	T			S							G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G	G	S	B		T	T	S	S	B								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T
Template Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		183	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.												.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.																								.	.
		222	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	N	F	Q	R	T	G	N	R	H	D	L	A	V	E	P	P	A	P	T	V	L	Q	K	L	V	D	E	K	H	G	Q	V	V	S	V	G	K	I	A	D	I	Y	A	N	C	G	I	T	K	K	V	K	A	T	G	L	D	A	L	F	D	A	T	I	K	E	M	K	E	A	G	D	N	T	I	V	F	T	N
Query Conservation
Alig confidence																			.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																			.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	T	I	A	E	T	A	A	E	L	D	A	V	D	D	P	P	.	.	.	V	L	G	L	F	S	Q	E	S	H	L	D	Y	Y	L	D	R	K	N	D	P	E	N	T	Q	P	N	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	A	M	V	D	A	G	V	D	L	L	S	G	D	P	D	K	G	F	F	L	L	V
Template Known Secondary structure							S									S	S		.	.	.							S	S	S												T	T							.	.	.	.	.	.	.	.	.															S	S
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		229	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.				.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.										.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.
		302	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.				.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.
Predicted Secondary structure																																						.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																						.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	V	D	F	D	S	S	W	G	H	R	R	D	V	A	G	Y	A	A	G	L	E	L	F	D	R	R	L	P	E	L	M	S	L	L	R	.	.	.	D	D	D	I	L	I	L	T	A	D	H	G	C	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																						.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																								.														.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																								.
Template Sequence		E	S	G	R	V	D	H	A	G	H	A	N	Y	P	A	Q	V	A	E	Q	Y	E	.	A	T	Q	V	A	G	Q	L	V	E	Y	A	E	T	T	A	E	P	T	F	L	V	S	T	G	D	H	E	C	G	G	L	T	L	G	R	D	S	P	Y	E	V	E	Y	D	V	L	A	A	Q	K	A	T	T	S	R	L
Template Known Secondary structure													T		T	T								.																S	S									S	S			S			B	S	S		S	S		S									T			S
Template Predicted Secondary structure																								.
Template SS confidence
		299	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320		.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.
																																																				352	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	T	W	T	G	T	D	H	T	R	E	H	I	P	V	L	V	Y	G	P	K	V	K	P	G	S	L	G	H	R
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.
Template Conservation																																																																									.	.
Template Sequence		R	D	L	L	A	G	V	R	S	A	D	E	L	E	S	I	V	A	A	H	T	G	I	T	A	L	T	D	R	E	V	A	K	L	R	D	A	P	G	S	I	S	T	I	L	A	E	R	A	G	I	A	F	T	T	D	G	H	T	G	T	D	V	P	V	F	A	H	G	P	N	.	.	A	A	R	F	D	A	A
Template Known Secondary structure						T	T															S	S																G	G	G										T		B				S	S												S	T	T	.	.	G	G	G	G	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																																									.	.
Template SS confidence
		378	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.			.	450	.	.	.	.	.
		382	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	T	F	A	D	I	G	Q	T	L	A	K	Y	F	G	T	S	D
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		R	D	N	T	A	V	A	D	A	L	A	A	A	L	G	V	S	L
Template Known Secondary structure				T	T											T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		456	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.