Job Description P19319 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:37:17 GMT 2012 Rank 19 Aligned Residues 660 % Identity 23% Template d1vlfm2 SCOP info Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Resolution 2.00

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		44	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.													.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.
Predicted Secondary structure																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	I	V	R	S	T	H	G	V	N	C	T	G	S	C	S	W	K	I	Y	V	K	N	G	L	V	T	W	E	I	Q	Q	T	D	Y	P	R	T	R	P	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	P	N	H	E	P	R	G	C	P	R	G	A	S	Y	S	W	Y	L	Y	S	A	N	R	L	K	Y
Query Conservation																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence								.	.	.																								.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation								.	.	.																								.
Template Sequence		E	V	V	R	L	T	.	.	.	N	S	S	T	G	G	P	V	F	V	Y	V	K	D	G	K	I	I	R	M	T	P	M	.	D	F	D	D	A	V	D	A	P	S	W	K	I	E	A	R	G	K	T	F	T	P	P	R	K	T	S	I	A	P	Y	T	A	G	F	K	S	M	I	Y	S	D	L	R	I	P	Y
Template Known Secondary structure								.	.	.				T	T									T	T									.	B			T	T	T	S									T	T							S	B									T	T					T		T	T	B			S
Template Predicted Secondary structure								.	.	.																								.
Template SS confidence
		3	.	.	.	.	.				.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.		.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.
		112	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	L	I	R	K	R	L	I	E	L	W	R	E	A	L	K	Q	H	S	D	P	V	L	A	W	A	S	I	M	N	D	P	Q	K	C	L	S	Y	K	Q	V	R	G	R	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	I	R	S	N	W	Q	E	L	N	Q	L	I	A	A	A
Query Conservation																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	M	K	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	S	F	D	P	N	G	E	R	N	P	Q	L	R	G	A	G	L	S	K	Q	D	P	W	S	D	Y	E	R	I	S	W	D	E	A	T	D	I	V	V	A	E
Template Known Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T			T	T	S				G	G	G	T	T					T	T		G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		79	80	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.
		174	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.				.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.								.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	V	W	T	I	K	T	Y	G	P	D	R	V	A	G	F	S	P	I	P	A	M	S	M	.	.	.	V	S	Y	A	A	G	T	R	Y	L	S	L	L	G	G	T	C	L	S	F	Y	D	W	Y	C	D	L	P	P	.	.	.	.	.	.	.	A	S	P	M	T	W	G	E	Q	T	D	V	P	E	S	A	D
Query Conservation																										.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																										.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	N	R	I	K	H	A	Y	G	P	S	A	I	L	S	T	P	S	S	H	H	M	W	G	N	V	G	Y	R	H	S	T	Y	F	R	F	M	N	M	M	G	F	T	Y	A	D	H	N	P	D	S	W	E	G	W	H	W	G	G	M	H	M	W	G	F	S	W	R	L	G	N	P	E	Q	Y	D	L	L	E	D
Template Known Secondary structure									T		G	G	G							S				S		T	T	T	S	T	T	T																			T	T	T						T								G	G	G	T	T					T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		125	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.
			244	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.						.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.		.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.																					.	.	.	.	.																													.
Query SS confidence		.																					.	.	.	.	.																													.
Query Sequence		.	W	Y	N	S	S	Y	I	I	A	W	G	S	N	V	P	Q	T	R	T	P	.	.	.	.	.	D	A	H	F	F	T	E	V	R	Y	K	G	T	K	T	I	A	I	T	P	D	Y	S	E	V	A	K	L	.	C	D	Q	W	L	A	P	K	Q	G	T	D	S	A	L	A	M	A	M	G	H	V	I	L	K
Query Conservation		.																					.	.	.	.	.																													.
Alig confidence		.																					.	.	.	.	.																													.
Template Conservation
Template Sequence		G	L	K	H	A	E	M	I	V	F	W	S	S	D	P	E	T	N	S	G	I	Y	A	G	F	E	S	N	I	R	R	Q	W	L	K	D	L	G	V	D	F	V	F	I	D	P	H	M	N	H	T	A	R	L	V	A	D	K	W	F	S	P	K	I	G	T	D	H	A	L	S	F	A	I	A	Y	T	W	L	K
Template Known Secondary structure							S						S								S	S	S		T	T	T	T										T	T								S	S										S							T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		205	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.
		317	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	F	H	L	D	N	P	S	D	Y	F	I	N	Y	C	R	R	Y	S	D	M	P	M	L	V	M	L	E	P	R	D	D	G	S	Y	V	P	G	R	M	I	R	A	S	D	L	V	D	G	L	G	E	S	N	N	P	Q	W	K	T	V	A	V	N	T	A	G	E	L	V	V	P	N	G	S	I	G	F	R	W
Query Conservation
Alig confidence								.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation								.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	D	S	Y	D	K	.	.	.	.	.	.	E	Y	V	A	A	N	A	H	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			T		S			.	.	.	.	.	.									S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		285	.	.	.	.	290							.	.	.	.	.	.	.	.	.
		397	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	E	K	G	K	W	N	L	E	S	I	A	A	G	T	E	T	E	L	S	L	T	L	L	G	Q	H	D	A	V	A	G	V	A	F	P	Y	F	G	G	I	E	N	P	H	F	R	S	V	K	H	N	P	V	L	V	R	Q	L	P	V	K	N	L	T	L	V	D	G	N	T	C	P	V	V	S	V	Y	D	L
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	E	E
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																																															300	.	.
		477	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.					.	.	.	.	.	.	.	550	.	.
Predicted Secondary structure																																																																				.	.	.	.
Query SS confidence																																																																				.	.	.	.
Query Sequence		V	L	A	N	Y	G	L	D	R	G	L	E	D	E	N	S	A	K	D	Y	A	E	I	K	P	Y	T	P	A	W	G	E	Q	I	T	G	V	P	R	Q	Y	I	E	T	I	A	R	E	F	A	D	T	A	H	K	T	H	G	R	S	M	I	I	L	G	A	.	.	.	.	G	V	N	H	W	Y	H	M	D	M
Query Conservation																																																																				.	.	.	.
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.												.	.	.	.
Template Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.
Template Sequence		W	A	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	V	L	G	K	T	D	G	T	P	K	T	C	E	W	A	E	E	E	S	G	V	P	A	C	E	I	R	A	L	A	R	Q	W	A	.	.	.	.	.	K	K	N	T	Y	L	A	A	G	G	L	G	G	W	G	G	A	C	R	A	S	H	G	I	E
Template Known Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T	T	T	T	S																												.	.	.	.	.		S							T	T	T	T	S			G	G	G	S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.
Template SS confidence
		303	.	.													.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340						.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.
		553	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	Y	R	G	M	I	N	M	L	I	F	C	G	C	V	G	Q	S	G	G	G	W	A	H	Y	V	G	Q	E	K	L	R	P	Q	T	G	W	L	P	L	A	F	A	L	D	W	N	R	P	P	R	Q	M	N	S	T	S	F	F	Y	N	H	S	S	Q	W	R	Y	E	K	V	S	A	Q	E	L	L	S	P	L
Query Conservation
Alig confidence															.
Template Conservation															.
Template Sequence		W	A	R	G	M	I	A	L	A	T	M	Q	G	.	M	G	K	P	G	S	N	M	W	S	T	T	Q	G	V	P	L	D	Y	E	F	Y	F	P	G	Y	A	E	G	G	I	S	G	D	C	E	N	S	A	A	G	F	K	F	A	W	R	M	F	D	G	K	T	T	F	P	S	P	S	N	L	N	T	S	A	G
Template Known Secondary structure													T	T	.	T	T	S	T	T						S	S	S						T	T	S					G	G	G		T	T	S			T	T	T	S	G	G	G	T	T								S	S	S							S	S	S	S	T	T	S
Template Predicted Secondary structure															.
Template SS confidence
		366	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.		.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.
		633	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	D	A	S	K	Y	S	G	H	L	I	D	F	N	V	R	A	E	R	M	G	W	L	P	S	A	P	Q	L	G	R	N	P	L	G	I	K	A	E	A	D	K	A	G	L	S	P	T	E	F	T	A	Q	A	L	K	S	G	D	L	R	M	A	C	E	Q	P	D	S	S	S	N	H	P	R	N	L	F	V	W
Query Conservation
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	H	I	P	R	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	I	P	E	C	I	M	G	G	K	F	Q	W	S	G	K	G	F	A	G	G	D	I	S	H	Q	L	H	Q	Y	E	Y	P	A	P	G	Y	S	K	I	K	M	F	W	K	Y
Template Known Secondary structure						G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G								S								S	S			S	S	T	T	G	G	G						S		T	T
Template Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		445	.	.	.	.	450																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.
		713	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.			.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790
Predicted Secondary structure																																																				.	.
Query SS confidence																																																				.	.
Query Sequence		R	S	N	L	L	G	S	S	G	K	G	H	E	Y	M	Q	K	Y	L	L	G	T	E	S	G	I	Q	G	E	E	L	G	A	S	D	G	I	K	P	E	E	V	E	W	Q	T	A	A	I	E	.	.	G	K	L	D	L	L	V	T	L	D	F	R	M	S	S	T	C	L	F	S	D	I	V	L	P	T	A	T
Query Conservation																																																				.	.
Alig confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.
Template Conservation														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	G	P	H	L	G	T	M	T	A	T	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	Y	A	K	M	Y	T	H	D	S	L	E	F	V	V	S	Q	S	I	W	F	E	G	E	V	P	F	A	D	I	I	L	P	A	C	T
Template Known Secondary structure		S							S	S	S	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						T	T		T	T									S	B	S		T	T	G	G	G		S					B
Template Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		497	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.
		791	.	.	.	.	.	.														.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		W	Y	E	K	D	D	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	T	S	D	M	H	P	F	I	H	P	L	S	A	A	V	D	P	A	W	E	S	R	S	D	W	E	I	Y	K	G	I	A	K	A	F	S	Q	V	C	V	G	H	L	G	K	E	T	D	V	V	L	Q	P	L	L	H	D	S	P
Query Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																									.	.	.	.
Template Conservation																																																																														.	.	.	.
Template Sequence		N	F	E	R	W	D	I	S	E	F	A	N	C	S	G	Y	I	P	D	N	Y	Q	L	C	N	H	R	V	I	S	L	Q	A	K	C	I	E	P	V	G	E	S	M	S	D	Y	E	I	Y	R	L	F	A	K	K	L	N	I	E	E	M	F	S	E	G	K	D	E	L	A	W	C	E	Q	Y	F	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		G	G	G	S						T	T			B	T	T	B	T	T	G	G	G	G	S	S	S										S			S	T	T		B													T	T							T	T												.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																														.	.	.	.
Template SS confidence
		545	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620
		858	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	E	L	S	Q	P	C	E	V	L	D	W	R	K	G	E	C	D	L	I	P	G	K	T	A	P	N	I	V	A	V	E	R	D	Y	P	A	T	Y	E	R	F	T	S	L	G	P	L	M	D	K	L	G	N	G	G	K	G	I	S	W	N	T	Q	D	E	I	D	F	L	G	K	L	N	Y	T	K	R	D	G
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	A	T	D	M	P	K	Y	M	T	W	D	E	F	F	K	K	G	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	S	S	G	G	G	T												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																														621	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		938	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960	.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	A	Q	G	R	P	L	I	D	T	A	I	D	A	S	E	V	I	L	A	L	A	P	E	T	N	G	H	V	A	V	K	A	W	Q	A	L	G	E	I	T	G	R	E	H	T	H	L	A	L	H	K	E	D	E	K	I	R	F	R	D	I	Q	A	Q	P	R	K	I	I	S	S	P	T	W	S	G	L	E	S
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	V	V	P	D	N	P	N	R	K	K	T	V	A	L	R	W	F	A	E	G	R	E	K
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							T	T	S					T	T					T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																										640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.
		1018	.	1020	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1070	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1080	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	H	V	S	Y	N	A	G	Y	T	N	V	H	E	L	I	P	W	R	T	L	S	G	R	Q	Q	L	Y	Q	D	H	P	W	M	R	A	F	G	E	S	L	V	A	Y	R	P	P	I	D	T	R	S	V	S	E	M	R	Q	I	P	P	N	G	F	P	E	K	A	L	N	F
Query Conservation
Alig confidence																																																										.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																										.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	T	P	D	W	G	P	R	L	N	N	Q	V	C	R	K	G	L	Q	T	T	T	G	K	V	E	F	I	A	T	S	L	K	N	F	E	E	Q	G	Y	I	D	E	H	R	P	S	M	H	T	Y	V	P	A	W	E	.	.	.	.	.	.	S	Q	K	H	S	P	L	A	V
Template Known Secondary structure			S	S		S		S		G	G	G	S	B	T	T	B	S		S	S	T	T	S	S			S	B										T	T				T	T	S		S	B							T	T	.	.	.	.	.	.	S	T	T	T		G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																																										.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		664	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.							720	.	.	.	.	.	.	.	.