Job Description P19319 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:37:17 GMT 2012 Rank 15 Aligned Residues 647 % Identity 26% Template c2iv2X_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: X: PDB Molecule:formate dehydrogenase h; PDBTitle: reinterpretation of reduced form of formate dehydrogenase h2 from e. coli Resolution 2.27 Å

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		44	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.					.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																		.	.	.	.
Query SS confidence																																																																		.	.	.	.
Query Sequence		K	I	V	R	S	T	H	G	V	N	C	T	G	S	C	S	W	K	I	Y	V	K	N	G	L	V	T	W	E	I	Q	Q	T	D	Y	P	R	T	R	P	D	L	P	N	H	E	P	R	G	C	P	R	G	A	S	Y	S	W	Y	L	Y	S	A	N	.	.	.	.	R	L	K	Y	P	L	I	R	K	R	L	I
Query Conservation																																																																		.	.	.	.
Alig confidence										.																								.								.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.									.	.	.	.
Template Conservation										.																								.								.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.
Template Sequence		K	K	V	V	T	V	C	P	.	Y	C	A	S	G	C	K	I	N	L	V	V	D	N	G	K	I	V	R	A	E	A	A	.	Q	G	K	T	N	Q	G	.	.	.	.	.	.	.	T	L	C	L	K	G	Y	Y	G	W	D	F	I	N	D	T	Q	I	L	T	P	R	L	K	T	P	M	I	R	.	.	.	.
Template Known Secondary structure									S	.	S	B	T	T										T	T									.			T	T	T	T	T	.	.	.	.	.	.	.									T	T	G	G	G	G				S	S	S		B			S					.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure										.																								.								.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.
Template SS confidence
		2	.	.	.	.	.	.	.		10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.		.	.	.	.	.	.	.								40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.
		120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	L	W	R	E	A	L	K	Q	H	S	D	P	V	L	A	W	A	S	I	M	N	D	P	Q	K	C	L	S	Y	K	Q	V	R	G	R	G	G	F	I	R	S	N	W	Q	E	L	N	Q	L	I	A	A	A	N	V	W	T	I	K	T	Y	G	P	D	R	V	A	G	F	S	P	I	P	A	M	S	M	V	S
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	Q	R	G	G	K	L	E	P	V	S	W	D	E	A	L	N	Y	V	A	E	R	L	S	A	I	K	E	K	Y	G	P	D	A	I	Q	T	T	G	S	S	R	G	T	G	N	E	T
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	T	T	S																											G	G	G							S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																		69	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.
		200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.			.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																												.	.
Query SS confidence																												.	.
Query Sequence		Y	A	A	G	T	R	Y	L	S	L	L	G	G	T	C	L	S	F	Y	D	W	Y	C	D	L	P	.	.	P	A	S	P	M	T	W	G	E	Q	T	D	V	P	E	S	A	D	W	Y	N	S	S	Y	I	I	A	W	G	S	N	V	P	Q	T	R	T	P	D	A	H	F	F	T	E	V	R	Y	K	G	T	K
Query Conservation																												.	.
Alig confidence																												.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	Y	V	M	Q	K	F	A	R	A	V	I	G	T	N	N	V	D	C	C	A	R	V	H	G	P	S	V	A	G	L	H	Q	S	V	G	N	G	A	M	S	N	A	I	N	E	I	D	N	T	D	L	V	F	V	F	G	Y	N	P	A	D	S	H	P	I	V	A	N	H	V	I	N	A	K	R	N	G	A	K
Template Known Secondary structure												T	T								S	S					S	S	S		S						S			S		S	S		G	G	G	G	G	G		S						S																				T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		117	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.
		278	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	I	A	I	T	P	D	Y	S	E	V	A	K	L	C	D	Q	W	L	A	P	K	Q	G	T	D	S	A	L	A	M	A	M	G	H	V	I	L	K	E	F	H	L	D	N	P	S	D	Y	F	I	N	Y	C	R	R	Y	S	D	M	P	M	L	V	M	L	E	P	R	D	D	G	S	Y	V	P	G	R	M	I
Query Conservation
Alig confidence																																															.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																															.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	I	V	C	D	P	R	K	I	E	T	A	R	I	A	D	M	H	I	A	L	K	N	G	S	N	I	A	L	L	N	A	M	G	H	V	I	I	E	E	N	L	Y	D	K	.	.	.	.	.	.	A	F	V	A	S	R	T	E	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure							S	S							T		S							T	T																T	T		S			.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		198	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.							.	.	.	.	.	.	.	250	.
		358	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	A	S	D	L	V	D	G	L	G	E	S	N	N	P	Q	W	K	T	V	A	V	N	T	A	G	E	L	V	V	P	N	G	S	I	G	F	R	W	G	E	K	G	K	W	N	L	E	S	I	A	A	G	T	E	T	E	L	S	L	T	L	L	G	Q	H	D	A	V	A	G	V	A	F	P	Y	F	G	G	I
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		438	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	N	P	H	F	R	S	V	K	H	N	P	V	L	V	R	Q	L	P	V	K	N	L	T	L	V	D	G	N	T	C	P	V	V	S	V	Y	D	L	V	L	A	N	Y	G	L	D	R	G	L	E	D	E	N	S	A	K	D	Y	A	E	I	K	P	Y	T	P	A	W	G	E	Q	I	T	G	V	P	R	Q	Y
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	E	E	Y	R	K	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	E	G	Y	T	P	E	S	V	E	D	I	T	G	V	S	A	S	E
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T			S	G	G	G
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																						252	.	.	.	.	.	.																			.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.
		518	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	E	T	I	A	R	E	F	A	D	T	A	H	K	T	H	G	R	S	M	I	I	L	G	A	G	V	N	H	W	Y	H	M	D	M	N	Y	R	G	M	I	N	M	L	I	F	C	G	C	V	G	Q	S	G	G	G	W	A	H	Y	V	G	Q	E	K	L	R	P	Q	T	G	W	L	P	L	A	F	A	L	D
Query Conservation
Alig confidence													.	.	.	.	.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation													.	.	.	.	.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	R	Q	A	A	R	M	Y	A	Q	A	.	.	.	.	.	K	S	A	A	I	L	W	G	M	G	V	T	Q	F	Y	Q	G	V	E	T	V	R	S	L	T	S	L	A	M	L	T	G	N	L	G	K	P	H	A	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	N	P	V	R	G	Q	N	N	V	Q	G	A	C	D
Template Known Secondary structure												S	.	.	.	.	.	S	S							T	T	G	G	G	S	S	S															T	T		S	S	S	T	T		S	.	.	.	.	.	.	.	.	.						S	B	T	T
Template Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		278	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.						.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.										.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.
		598	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	N	R	P	P	R	Q	M	N	S	T	S	F	F	Y	N	H	S	S	Q	W	R	Y	E	K	V	S	A	Q	E	L	L	S	P	L	A	D	A	S	K	Y	S	G	H	L	I	D	F	N	V	R	A	E	R	M	G	W	L	P	S	A	P	Q	L	G	R	N	P	L	G	I	K	A	E	A	D	K	A	G	L
Query Conservation
Alig confidence																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		M	G	A	L	P	D	T	Y	P	G	Y	Q	Y	V	K	D	P	A	N	R	E	K	F	A	K	A	W	G	V	E	S	L	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T	T		B	T	T			G	G	G			T	T												T	T		S				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		344	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.
		678	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	P	T	E	F	T	A	Q	A	L	K	S	G	D	L	R	M	A	C	E	Q	P	D	S	S	S	N	H	P	R	N	L	F	V	W	R	S	N	L	L	G	S	S	G	K	G	H	E	Y	M	Q	K	Y	L	L	G	T	E	S	G	I	Q	G	E	E	L	G	A	S	D	G	I	K	P	E	E	V	E	W	Q
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	H	T	G	Y	R	I	S	E	L	P	H	R	A	A	H	G	E	V	R	A	A	Y	I	M	G	E	D	P	L	Q	T	D	A	E	L	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S					G	G	G							T	T	S								S							S	S	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
												377	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.																																	.
		758	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	A	A	I	E	G	K	L	D	L	L	V	T	L	D	F	R	M	S	S	T	C	L	F	S	D	I	V	L	P	T	A	T	W	Y	E	K	D	D	M	N	T	S	D	M	H	P	F	I	H	P	L	S	A	A	V	D	P	A	W	E	S	R	S	D	W	E	I	Y	K	G	I	A	K	A	F	S	Q	V	C
Query Conservation
Alig confidence																																									.
Template Conservation																																									.
Template Sequence		V	R	K	A	F	E	D	L	E	L	V	I	V	Q	D	I	F	M	T	K	T	A	S	A	A	D	V	I	L	P	S	T	S	W	G	E	H	E	G	.	V	F	T	A	A	D	R	G	F	Q	R	F	F	K	A	V	E	P	K	W	D	L	K	T	D	W	Q	I	I	S	E	I	A	T	R	M	G	Y	P	M
Template Known Secondary structure									S	S							S	B							T		S					B			B	T	T	B			.					T	T	S									S			S	S	S		B													T	T
Template Predicted Secondary structure																																									.
Template SS confidence
		415	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.		.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.
		838	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	G	H	L	G	K	E	T	D	V	V	L	Q	P	L	L	H	D	S	P	A	E	L	S	Q	P	C	E	V	L	D	W	R	K	G	E	C	D	L	I	P	G	K	T	A	P	N	I	V	A	V	E	R	D	Y	P	A	T	Y	E	R	F	T	S	L	G	P	L	M	D	K	L	G	N	G	G	K	G	I	S
Query Conservation
Alig confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		H	Y	N	N	T	Q	E	I	W	D	E	L	R	H	L	C	P	D	F	Y	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	T	Y	E	K	M	G	E	L	G	F	I	Q	W	P	C	R	D	T	S	D	A	D	Q
Template Known Secondary structure				S	S													T	T	T	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							T	T	T					S					S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		494	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.
		918	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960	.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	N	T	Q	D	E	I	D	F	L	G	K	L	N	Y	T	K	R	D	G	P	A	Q	G	R	P	L	I	D	T	A	I	D	A	S	E	V	I	L	A	L	A	P	E	T	N	G	H	V	A	V	K	A	W	Q	A	L	G	E	I	T	G	R	E	H	T	H	L	A	L	H	K	E	D	E	K	I	R	F	R
Query Conservation
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	T	S	Y	L	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		B		S	S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		539	540	.	.	.	.
		998	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1070	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	I	Q	A	Q	P	R	K	I	I	S	S	P	T	W	S	G	L	E	S	D	H	V	S	Y	N	A	G	Y	T	N	V	H	E	L	I	P	W	R	T	L	S	G	R	Q	Q	L	Y	Q	D	H	P	W	M	R	A	F	G	E	S	L	V	A	Y	R	P	P	I	D	T	R	S	V	S	E	M	R	Q	I	P
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	E	K	F	D	T	P	N	G	L	A	Q	F	F	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	D	W	V	A	P	I	D	K	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S			S	S	T	T	S							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							S	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																				545	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.													560	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		1078	.	1080	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.	.	.			.	.	.	.	.	1100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.		.	.	.	.	1120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1150	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.																						.
Query SS confidence																			.	.																						.
Query Sequence		P	N	G	F	P	E	K	A	L	N	F	L	T	P	H	Q	K	.	.	W	G	I	H	S	T	Y	S	E	N	L	L	M	L	T	L	S	R	G	G	P	.	I	V	W	I	S	E	T	D	A	R	E	L	T	I	V	D	N	D	W	V	E	V	F	N	A	N	G	A	L	T	A	R	A	V	V	S	Q	R	V
Query Conservation																			.	.																						.
Alig confidence		.	.	.															.	.									.													.
Template Conservation		.	.	.																									.
Template Sequence		.	.	.	T	D	E	Y	P	M	V	L	S	T	V	R	E	V	G	H	Y	S	C	R	S	M	T	G	.	N	C	A	A	L	A	A	L	A	D	E	P	G	Y	A	Q	I	N	T	E	D	A	K	R	L	G	I	E	D	E	A	L	V	W	V	H	S	R	K	G	K	I	I	T	R	A	Q	V	S	D	R	P
Template Known Secondary structure		.	.	.		S	S	S										T	T			S	S		T	T	G	G	.	G	S					T	T			S	S														T			T	T								S	S											S	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.																									.
Template SS confidence
					570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.		.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.
		1155	.	.	.	.	1160	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	P	G	M	T	M	M	Y	H	A	Q	E	R
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		N	K	G	A	I	Y	M	T	Y	Q	W	W	P
Template Known Secondary structure			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		646	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.