Job Description P19319 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:37:17 GMT 2012 Rank 11 Aligned Residues 736 % Identity 26% Template c1eu1A_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:dimethyl sulfoxide reductase; PDBTitle: the crystal structure of rhodobacter sphaeroides dimethylsulfoxide2 reductase reveals two distinct molybdenum coordination environments. Resolution 1.30 Å

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		48	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	T	H	G	V	N	C	T	G	S	C	S	W	K	I	Y	V	K	N	G	L	V	T	W	E	I	Q	Q	T	D	Y	P	R	T	R	P	D	L	P	N	H	E	P	R	G	C	P	R	G	A	S	Y	S	W	Y	L	Y	S	A	N	R	L	K	Y	P	L	I	R	K	R	L	I	E	L	W	R	E	A	L	K
Query Conservation
Alig confidence									.																													.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.																										.	.
Template Conservation									.																													.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.																										.	.
Template Sequence		G	E	V	M	S	G	C	.	H	W	G	V	F	K	A	R	V	E	N	G	R	A	V	A	F	E	P	W	D	K	D	P	A	P	S	H	.	.	.	.	.	.	.	Q	L	P	G	V	L	.	.	.	.	D	S	I	Y	S	P	T	R	I	K	Y	P	M	V	R	R	E	F	L	E	K	G	V	N	A	.	.
Template Known Secondary structure									.	T	T									T	T									T	T		S	S			T	.	.	.	.	.	.	.	T						.	.	.	.		T	T	T	S	T	T	B			S											G	G	G	S	.	.
Template Predicted Secondary structure									.																													.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.																										.	.
Template SS confidence
		6	.	.	.	10	.	.		.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40								.	.	.	.	.	.					.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.
		128	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.				.	.	200	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																								.	.	.
Query SS confidence																																																																								.	.	.
Query Sequence		Q	H	S	D	P	V	L	A	W	A	S	I	M	N	D	P	Q	K	C	L	S	Y	K	Q	V	R	G	R	G	G	F	I	R	S	N	W	Q	E	L	N	Q	L	I	A	A	A	N	V	W	T	I	K	T	Y	G	P	D	R	V	A	G	F	S	P	I	P	A	M	S	M	.	.	.	V	S	Y	A	A	G	T
Query Conservation																																																																								.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																		.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	R	S	T	R	G	N	G	D	F	V	R	V	T	W	D	E	A	L	D	L	V	A	R	E	L	K	R	V	Q	E	S	Y	G	P	T	G	T	F	G	G	S	Y	G	W	K	S	P	G	R	L	H	N	C	Q	V	L	M	R
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		G	G	G	T	T	S	S																											G	G	G													S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																							72	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130
		205	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.		220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.					.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.								.	.	.	.	.	.	270	.	.
Predicted Secondary structure																	.																.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																	.																.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	Y	L	S	L	L	G	G	T	C	L	S	F	Y	D	.	W	Y	C	D	L	P	P	A	S	P	M	T	W	G	E	.	.	.	.	Q	T	D	V	P	E	S	A	D	W	Y	N	S	S	Y	I	I	A	W	G	S	N	V	P	Q	T	R	T	P	.	.	.	.	.	.	.	D	A	H	F	F	T	E	V	R
Query Conservation																	.																.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.																.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	A	L	N	L	A	G	G	F	V	N	S	S	G	D	Y	S	T	A	A	A	Q	I	I	M	P	H	V	M	G	T	L	E	V	Y	E	Q	Q	T	A	W	P	V	V	V	E	N	T	D	L	M	V	F	W	A	A	D	P	M	K	T	N	E	I	G	W	V	I	P	D	H	G	A	Y	A	G	M	K	A	L
Template Known Secondary structure								T			B				S		S	S	S	T	T									T	S	S			T	T	S			S										S						S							T	T			S	S	B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		131	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210
		273	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.		.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.
Predicted Secondary structure																					.
Query SS confidence																					.
Query Sequence		Y	K	G	T	K	T	I	A	I	T	P	D	Y	S	E	V	A	K	L	.	C	D	Q	W	L	A	P	K	Q	G	T	D	S	A	L	A	M	A	M	G	H	V	I	L	K	E	F	H	L	D	N	P	S	D	Y	F	I	N	Y	C	R	R	Y	S	D	M	P	M	L	V	M	L	E	P	R	D	D	G	S	Y
Query Conservation																					.
Alig confidence																					.																																.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																					.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	E	K	G	T	R	V	I	I	N	P	V	R	T	E	T	A	D	Y	F	G	A	D	V	V	S	P	R	P	Q	T	D	V	A	L	M	L	G	M	A	H	T	L	Y	S	E	D	L	H	D	K	.	.	.	.	.	.	D	F	L	E	N	C	T	T	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure					T							S	B									T								T	T																T	T		S			.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																					.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		211	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.							.	.	.	.	.	.	.	.	270
		352	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	P	G	R	M	I	R	A	S	D	L	V	D	G	L	G	E	S	N	N	P	Q	W	K	T	V	A	V	N	T	A	G	E	L	V	V	P	N	G	S	I	G	F	R	W	G	E	K	G	K	W	N	L	E	S	I	A	A	G	T	E	T	E	L	S	L	T	L	L	G	Q	H	D	A	V	A	G	V	A	F
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		432	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	Y	F	G	G	I	E	N	P	H	F	R	S	V	K	H	N	P	V	L	V	R	Q	L	P	V	K	N	L	T	L	V	D	G	N	T	C	P	V	V	S	V	Y	D	L	V	L	A	N	Y	G	L	D	R	G	L	E	D	E	N	S	A	K	D	Y	A	E	I	K	P	Y	T	P	A	W	G	E	Q	I	T
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	D	L	F	A	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	L	T	G	E	S	D	G	T	P	K	T	A	E	W	A	A	E	I	C
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T	T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																												272	.	.	.	.	.													.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.
		512	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	V	P	R	Q	Y	I	E	T	I	A	R	E	F	A	D	T	A	H	K	T	H	G	R	S	M	I	I	L	G	A	G	V	N	H	W	Y	H	M	D	M	N	Y	R	G	M	I	N	M	L	I	F	C	G	C	V	G	Q	S	G	G	G	W	A	H	Y	V	G	Q	E	K	L	R	P	Q	T	G	W	L	P
Query Conservation
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																			.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	L	P	A	E	Q	I	R	E	L	A	R	S	F	V	A	G	.	.	.	.	.	.	R	T	M	L	A	A	G	W	S	I	Q	R	M	H	H	G	E	Q	A	H	W	M	L	V	T	L	A	S	M	I	G	Q	I	G	L	P	G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	G	L	S	Y	H	Y	S	N
Template Known Secondary structure			S														S	S	.	.	.	.	.	.								S	G	G	G	S	S	T	T	T															T		T	T	S	T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.			S		T	T	S	T	T
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		298	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.							.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.										.	.	.	.	.	.	360	.	.
		592	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	A	F	A	L	D	W	N	R	P	P	R	Q	M	N	S	T	S	F	F	Y	N	H	S	S	Q	W	R	Y	E	K	V	S	A	Q	E	L	L	S	P	L	A	D	A	S	K	Y	S	G	H	L	I	D	F	N	V	R	A	E	R	M	G	W	L	P	S	A	P	Q	L	G	R	N	P	L	G	I	K	A	E
Query Conservation
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	G	S	P	T	S	D	G	P	A	L	G	G	I	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	G	G
Template Known Secondary structure		T	T	S				S									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		363	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.																																																															.	.	380
		672	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	D	K	A	G	L	S	P	T	E	F	T	A	Q	A	L	K	S	G	D	L	R	M	A	C	E	Q	P	D	S	S	S	N	H	P	R	N	L	F	V	W	R	S	N	L	L	G	S	S	G	K	G	H	E	Y	M	Q	K	Y	L	L	G	T	E	S	G	I	Q	G	E	E	L	G	A	S	D	G	I	K	P
Query Conservation
Alig confidence																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	G	G	A	T	S	I	P	C	A	R	V	V	D	M	L	L	N	P	G	G	E	F	Q	F	N	G	A	T	A	T	Y	P	D	V	K	L	A	Y	W	A	G	G	N	P	F	A	H	H	Q	D	R	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure						S				G	G	G								T	T						T	T															S							S	S				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		384	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.
		752	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.			.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																				.	.
Query SS confidence																																																				.	.
Query Sequence		E	E	V	E	W	Q	T	A	A	I	E	G	K	L	D	L	L	V	T	L	D	F	R	M	S	S	T	C	L	F	S	D	I	V	L	P	T	A	T	W	Y	E	K	D	D	M	N	T	S	D	.	.	M	H	P	F	I	H	P	L	S	A	A	V	D	P	A	W	E	S	R	S	D	W	E	I	Y	K	G	I
Query Conservation																																																				.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.																																														.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	R	M	L	K	A	W	E	K	L	E	T	F	I	V	Q	D	F	Q	W	T	A	T	A	R	H	A	D	I	V	L	P	A	T	T	S	Y	E	R	N	D	I	E	S	V	G	D	Y	S	N	R	A	I	L	A	M	K	K	V	V	D	P	L	Y	E	A	R	S	D	Y	D	I	F	A	A	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.						G	G	G		S							S	B							T		S					B			G	G	G	S								T	T	T											S				T	T		B
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.
Template SS confidence
							444	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.
		830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	K	A	F	S	Q	V	C	V	G	H	L	G	K	E	T	D	V	V	L	Q	P	L	L	H	D	S	P	A	E	L	S	Q	P	C	E	V	L	D	W	R	K	G	E	C	D	L	I	P	G	K	T	A	P	N	I	V	A	V	E	R	D	Y	P	A	T	Y	E	R	F	T	S	L	G	P	L	M	D	K	L
Query Conservation
Alig confidence																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	E	R	L	G	K	G	A	E	F	T	E	G	R	D	E	M	G	W	I	S	S	F	Y	E	A	A	V	K	Q	A	E	F	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	V	A	M	P	S	F	E	D	F	W	S	E	G	I	V	E	F	P	I
Template Known Secondary structure					T	T							T	T																					T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T
Template Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		519	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.
		910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960	.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	N	G	G	K	G	I	S	W	N	T	Q	D	E	I	D	F	L	G	K	L	N	Y	T	K	R	D	G	P	A	Q	G	R	P	L	I	D	T	A	I	D	A	S	E	V	I	L	A	L	A	P	E	T	N	G	H	V	A	V	K	A	W	Q	A	L	G	E	I	T	G	R	E	H	T	H	L	A	L	H	K
Query Conservation
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	E	G	A	N	F	V	R	Y	A	D	F	R	E	D	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S	G	G	G	G			T	T							T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		573	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.
		990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.			.	.	1050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																												.	.
Query SS confidence																																																												.	.
Query Sequence		E	D	E	K	I	R	F	R	D	I	Q	A	Q	P	R	K	I	I	S	S	P	T	W	S	G	L	E	S	D	H	V	S	Y	N	A	G	Y	T	N	V	H	E	L	I	P	W	R	T	L	S	G	R	Q	Q	L	Y	Q	D	.	.	H	P	W	M	R	A	F	G	E	S	L	V	A	Y	R	P	P	I	D	T
Query Conservation																																																												.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	F	N	P	L	G	T	P	S	G	L	I	E	I	Y	S	K	N	I	E	K	M	G	Y	D	D	C	P	A	H	P	T	W	M	E	P	A	E	R
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	S			S	S	T	T	S	S			S	S										T	T	S		S	S							S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																											589	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.
		1068	.	1070	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1080	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1100	.		.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1140	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																				.
Query SS confidence																																				.
Query Sequence		R	S	V	S	E	M	R	Q	I	P	P	N	G	F	P	E	K	A	L	N	F	L	T	P	H	Q	K	W	G	I	H	S	T	Y	.	S	E	N	L	L	M	L	T	L	S	R	G	G	P	I	V	W	I	S	E	T	D	A	R	E	L	T	I	V	D	N	D	W	V	E	V	F	N	A	N	G	A	L	T	A
Query Conservation																																				.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.
Template Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	G	G	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	A	K	Y	P	L	H	V	V	A	S	H	P	K	S	R	L	H	S	Q	L	N	G	T	S	L	R	D	L	Y	A	V	A	G	H	E	P	C	L	I	N	P	A	D	A	A	A	R	G	I	A	D	G	D	V	L	R	V	F	N	D	R	G	Q	I	L	V
Template Known Secondary structure		T	T		T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T			S	S									S	S	S	B	T	T	B	T	T	T	S	G	G	G	G	G	T		B	T	T	B												T	T	T			T	T								S	S
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		628	.	630	.										.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.
		1147	.	.	1150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1190		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1220	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																														.
Query SS confidence																																														.
Query Sequence		R	A	V	V	S	Q	R	V	P	P	G	M	T	M	M	Y	H	A	Q	E	R	I	M	N	I	P	G	S	E	V	T	G	M	R	G	G	I	H	N	S	V	T	R	V	.	C	P	K	P	T	H	M	I	G	G	Y	A	Q	L	A	W	G	F	N	Y	Y	G	T	V	G	S	N	R	D	E	F	I	M	I	R
Query Conservation																																														.
Alig confidence																																														.					.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																			.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	A	K	V	S	D	A	V	M	P	G	A	I	Q	I	Y	E	G	G	W	Y	D	P	L	D	P	S	E	E	G	T	L	D	K	Y	G	D	V	N	V	L	S	L	D	V	G	T	S	K	.	.	L	A	Q	G	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	G	Q	T	I	L	A	D	V	E
Template Known Secondary structure							T	T	B		T	T						T	T					B	S		T	T	S	T	T			B	S	S			G	G	G	S						S		T	.	.	T	T				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T
Template Predicted Secondary structure																																																			.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		699	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.			.	.	750	.	.															.	.	.	.	.	.	.	760	.	.
		1226	.	.					.	1230	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.	.	.	.
Query SS confidence					.	.	.	.
Query Sequence		K	M	K	.	.	.	.	N	V	N	W	L	D	D	E	G
Query Conservation					.	.	.	.
Alig confidence					.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	Y	A	G	A	P	V	T	V	T	V	F	D	T	P	K
Template Known Secondary structure					S							T	T	S			T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		763	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.