Job Description P0A9C0 Confidence 99.95% Date Thu Jan 5 11:09:50 GMT 2012 Rank 20 Aligned Residues 333 % Identity 20% Template c1y56A_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:hypothetical protein ph1363; PDBTitle: crystal structure of l-proline dehydrogenase from p.horikoshii Resolution 2.86 Å

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		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	S	Q	S	S	D	V	I	I	I	G	G	G	A	T	G	A	G	I	A	R	D	C	A	L	R	G	L	R	V	I	L	V	E	R	H	D	I	A	T	G	A	T	G	R	N	H	G	L	L	H	S	G	A	R	Y	A	V	T	D	A	E	S	A	R	E	C	I	S	E	N	Q	I	L	K	R	I	A	R	H
Query Conservation
Alig confidence																											.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																											.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	R	V	V	V	D	V	A	I	I	G	G	G	P	A	G	I	G	A	A	L	E	L	Q	Q	.	Y	L	T	V	A	L	I	E	E	R	G	W	L	G	G	D	M	W	L	K	G	I	K	Q	E	G	F	N	K	D	S	R	K	V	V	E	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure							S							S											T	T	.	T								T	T	S	S	S	S		S	G	G	G	T		S			T	T	T	T										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																											.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		103	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.		.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.
		85	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		C	V	E	P	T	N	G	L	F	I	T	L	P	E	D	D	L	S	F	Q	A	T	F	I	R	A	C	E	E	A	G	I	S	A	E	A	I	D	P	Q	Q	A	R	I	I	E	P	A	V	N	P	A	L	I	G	A	V	K	V	P	D	G	T	V	D	P	F	R	L	T	A	A	N	M	L	D	A	K	E	H
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	V	G	K	L	N	E
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T			T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																																											165	.	.	.	.	170	.
		165	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.																.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	A	V	I	L	T	A	H	E	V	T	G	L	I	R	E	G	A	T	V	C	G	V	R	V	R	N	H	L	T	G	E	T	Q	A	L	H	A	P	V	V	V	N	A	A	G	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	G	Q	H	I	A	E	Y	A	D	L	R	I	R	M	F	P	A
Query Conservation																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																						.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																						.	.	.
Template Sequence		N	T	K	I	Y	L	E	T	S	A	L	G	V	F	D	K	G	E	Y	F	.	.	.	L	V	P	V	V	R	G	D	K	L	I	E	I	L	A	K	R	V	V	L	A	T	G	A	I	D	S	T	M	L	F	E	N	N	D	M	P	G	V	F	R	R	D	F	A	L	E	V	M	N	V	W	E	V	A	P	G
Template Known Secondary structure		T					T	T										S	S	S		.	.	.							T	T								S																T	T	T	T	S	T	T													T	S		B		S
Template Predicted Secondary structure																						.	.	.
Template SS confidence
		172	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.				.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.
		230	.	.	.	.	.	.	.															.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	G	S	L	L	I	M	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	R	I	N	Q	H	V	I	N	R	C	R	K	P	S	D	A	D	I	L	V	P	G	D	T	I	S	L	I	G	T	T	S	L	R	I	D	Y	N	E	I	D	D	N	R	V	T	A	E	E	V	D	I	L	L	R	E	G
Query Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	K	V	A	V	T	G	S	K	A	D	E	V	I	Q	E	L	E	R	W	G	I	D	Y	V	H	I	P	N	V	K	R	V	E	G	N	E	K	V	E	R	V	I	D	M	N	N	H	E	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S						S	T	T												T							S	S							S	S	S							T	T					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		249	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.
		296	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.			330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.					.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																				.	.																								.	.	.	.
Query SS confidence																																				.	.																								.	.	.	.
Query Sequence		E	K	L	A	P	V	M	A	K	T	R	I	L	R	A	Y	S	G	V	R	P	L	V	A	S	D	D	D	P	S	G	R	N	V	.	.	S	R	G	I	V	L	L	D	H	A	E	R	D	G	L	D	G	F	I	T	I	T	G	.	.	.	.	G	K	L	M	T	Y	R	L	M	A	E	W	A	T	D	A	V
Query Conservation																																				.	.																								.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.																								.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	K	V	D	A	L	I	F	A	D	G	R	R	P	D	I	N	P	I	T	Q	A	G	G	K	L	R	F	R	R	G	Y	Y	S	P	V	L	D	E	Y	H	R	I	K	D	G	I	Y	V	A	G	S	A	V	S	I	K	P	H	Y	A	N	Y	L	E	G	K	L	V	G	A	Y	I
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.			S																		T	T							T	T								T	T	S				T	T					S	T	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
										299	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370
		370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		C	R	K	L	G	N	T	R	P	C	T	T	A	D	L	A	L	P	G	S	Q	E	P	A	E	V	T	L	R	K	V	I	S	L	P	A	P	L	R	G	S	A	V	Y	R	H	G	D	R	T	P	A	W	L	S	E	G	R	L	H	R	S	L	V	C	E	C	E	A	V	T	A	G	E	V	Q	Y	A	V	E
Query Conservation
Alig confidence																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.
Template Conservation																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.
Template Sequence		L	K	E	F	G	Y	D	A	Q	P	C	I	Y	E	E	K	L	R	E	Y	E	P	E	S	L	S	I	P	R	I	P	L	D	K	F	N	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	D	V	Q	I	C	G	C	D	.	V	S	L	K	K	V	D	E	V	I	R
Template Known Secondary structure					T	T													T	T	S												T	T	T	S		G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	S	B		S	S	S	S	.		B
Template Predicted Secondary structure																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.
Template SS confidence
		371	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	410	.	.	.	.	.	.		.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.
		450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	L	N	V	N	S	L	L	D	L	R	R	R	T	R	V	G	M	G	T	C	Q	G	E	L	C	A	C	R	A	A	G	L	L	Q	R	F	N	V	T	T	S	A	Q
Query Conservation
Alig confidence			.
Template Conservation			.
Template Sequence		K	.	G	I	T	D	L	Q	I	I	K	R	L	T	H	L	A	M	G	F	C	Q	G	R	Y	C	L	F	N	G	A	V	V	V	S	Q	R	T	G	K	K	L	S	E
Template Known Secondary structure		T	.	T											S		T	T		S	T	T	T	T	T	T	T																G	G	G
Template Predicted Secondary structure			.
Template SS confidence
		428		.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470