Job Description P0AEW6 Confidence 98.88% Date Thu Jan 5 11:24:28 GMT 2012 Rank 56 Aligned Residues 329 % Identity 13% Template c3drwA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:adp-specific phosphofructokinase; PDBTitle: crystal structure of a phosphofructokinase from pyrococcus2 horikoshii ot3 with amp Resolution 1.90 Å

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		37	.	.	40		.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.												.	.	.	70	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence						.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	G	I	D	.	Q	T	L	V	D	I	E	A	K	V	D	D	E	F	I	E	R	Y	G	L	S	A	G	H	S	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	I	E	D	D	V	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	A	L	Y	Q	E	L	K	Q	K	N
Query Conservation						.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	Y	T	A	Y	N	A	N	I	A	A	I	V	K	L	N	Q	E	T	I	Q	N	L	I	N	A	F	D	P	D	E	V	K	R	R	I	E	E	Y	P	R	E	I	N	E	P	I	D	F	V	A	R	L	V	H	T	L	K	L	G	K	P	A	A	V	P	L	V	N	E	K	M	N	E	W	F	D	K	T	F
Template Known Secondary structure						S																					T	S														S	S	B	S	S															T										T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		8	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.
		85	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	I	T	H	Q	F	A	G	G	T	I	G	N	T	M	H	N	Y	S	V	L	A	D	D	R	S	V	L	L	G	V	M	C	S	N	I	E	I	G	S	Y	A	Y	R	Y	L	C	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	T	S	S	R	T	D	L	N	Y	L	Q	G	V	D
Query Conservation																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																					.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.
Template Conservation																																					.																																										.	.
Template Sequence		R	Y	E	E	E	R	L	G	G	Q	A	G	I	I	A	N	T	L	A	G	L	K	I	R	K	V	I	A	Y	T	P	F	L	P	K	.	R	L	A	E	L	F	K	K	G	V	L	Y	P	V	V	E	N	G	E	L	Q	F	K	P	I	Q	E	A	Y	R	E	G	D	P	L	K	I	N	R	I	F	.	.	E
Template Known Secondary structure				S						S												T	T		S							S					.				T	T	S		T	T							S	S	S	S						G	G	G				T	T										.	.
Template Predicted Secondary structure																																					.																																										.	.
Template SS confidence
		88	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.		.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.			.
		147	.	.	150	.	.	.						.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.		.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.					.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.							.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210
Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.																				.														.	.	.	.														.	.	.	.	.	.
Query SS confidence									.	.	.	.	.																				.														.	.	.	.														.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	P	I	G	R	C	F	.	.	.	.	.	T	L	I	G	E	S	G	E	R	T	F	A	I	S	P	G	H	M	N	.	Q	L	R	A	E	S	I	P	E	D	V	I	A	.	.	.	.	G	A	S	A	L	V	L	T	S	Y	L	V	R	.	.	.	.	.	.	C	K	P	G	E	P	M	P	E	A	T	M
Query Conservation									.	.	.	.	.																				.														.	.	.	.														.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.	.																				.														.	.	.	.														.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	R	K	G	L	K	F	K	L	G	D	E	T	I	E	I	P	N	S	G	R	F	I	V	S	A	R	F	E	S	I	S	R	I	E	T	R	E	D	I	K	P	F	L	G	E	I	G	K	E	V	D	G	A	I	F	S	G	Y	Q	G	L	R	T	K	Y	S	D	G	K	D	A	N	Y	Y	L	R	R	A	K
Template Known Secondary structure				T	T					S	S	S							S											S	G	G	G			S			T	T	T	G	G	G									S							G	G	G			S	B		T	T	S		B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		165	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.
		211	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.														260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	A	I	E	Y	A	K	K	Y	N	V	P	V	V	L	T	L	G	T	K	F	V	I	A	E	N	P	Q	W	W	Q	Q	F	L	K	D	H	V	S	I	L	A	M	N	E	D	E	A	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	L	T	G	E	S	D	P	L	L	A	S	D	K	A	L	D	W
Query Conservation																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																					.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																					.
Template Sequence		E	D	I	I	E	F	K	E	K	D	V	K	I	H	V	E	F	A	S	V	Q	D	R	K	L	R	K	K	I	I	T	N	I	L	P	.	F	V	D	S	V	G	I	D	E	A	E	I	A	Q	I	L	S	V	L	G	Y	R	E	L	A	D	R	I	F	T	Y	N	R	L	E	D	S	I	L	G	G	M	I	I
Template Known Secondary structure										T	T											S												T	G	G	.	G	S	S																	T
Template Predicted Secondary structure																																					.
Template SS confidence
		245	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.		280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.
																	278	.	280	.	.	.	.	.	.	.													.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	D	L	V	L	C	T	A	G	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	G	L	Y	M	A	G	F	T	E	D	E	A	K	R	K	T	Q	H	P	L	L	P	G	A	I	A	E	F	N	Q	Y	E	F	S	R	A	M	R	H	K	D	C
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	D	E	L	N	F	E	I	L	Q	V	H	T	T	Y	Y	L	M	Y	I	T	H	R	D	N	P	L	S	E	E	E	L	A	K	S	L	E	F	G	T	T	L	A	A	A	R	A	S	L	G	D	I	R	G	P	D	D	Y	K	V	G	L	K	V	P	F	N	E	R	S	E	Y	V	K	L	R	F	E	E	A
Template Known Secondary structure								S							S	S								T	T		S	S																							S	S			S	G	G	G						T	S				T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		324	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.
		331	.	.	.	.	.	.	.		.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.		350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.												.												.
Query SS confidence										.												.												.
Query Sequence		Q	N	P	L	R	V	Y	S	.	H	I	A	P	Y	M	G	G	P	E	K	.	I	M	N	T	N	G	A	G	D	G	A	.	L	A	A	L	L	H	D	I	T
Query Conservation										.												.												.
Alig confidence										.												.												.
Template Conservation
Template Sequence		K	S	R	L	R	M	R	E	Y	K	V	V	V	I	P	T	R	L	V	Q	N	P	V	L	T	V	G	L	G	D	T	I	S	A	G	A	F	L	T	Y	L	E
Template Known Secondary structure					S			T	T												S	S		S			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		404	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.