Job Description P0AAI5 Confidence 99.74% Date Thu Jan 5 11:13:01 GMT 2012 Rank 75 Aligned Residues 318 % Identity 18% Template c2h84A_ PDB info PDB header:biosynthetic protein, transferase Chain: A: PDB Molecule:steely1; PDBTitle: crystal structure of the c-terminal type iii polyketide synthase (pks2 iii) domain of 'steely1' (a type i/iii pks hybrid from dictyostelium) Resolution 2.90 Å

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		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.		.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	R	V	V	V	T	G	L	G	M	L	S	P	V	.	G	N	T	V	E	S	T	W	K	A	L	L	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	Q	S	G	I	S	L	I	D	H	F	D	T	S	A	Y	A	T	K	F	A	G	L	V	K	D	F	N	C	E	D	I	I	S	R	K
Query Conservation																.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.
Template Conservation																																																																		.	.	.	.
Template Sequence		N	N	S	F	V	L	G	I	G	I	S	V	P	G	E	P	I	S	Q	Q	S	L	K	D	S	I	S	N	D	F	S	D	K	A	E	T	N	E	K	V	K	R	I	F	E	Q	S	Q	I	K	T	R	H	L	V	R	D	Y	T	K	P	E	N	S	.	.	.	.	I	K	F	R	H	L	E	T	I	T	D	V
Template Known Secondary structure														S	S	S															S		S														T	T								S	S		T	T	S	G	G	G		.	.	.	.	G	G	G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																																																		.	.	.	.
Template SS confidence
		2785	.	.	.	.	2790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2840	.	.	.	.	.	.	.	.					.	2850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2860
		67	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	Q	R	K	M	D	A	F	I	Q	Y	G	I	V	A	G	V	Q	A	M	Q	D	S	G	L	E	I	T	E	E	N	A	T	R	I	G	A	A	I	G	S	G	I	G	G	L	G	L	I	E	E	N	H	T	S	L	M	N	G	G	P	R	K	I	S	P	F	F	V	P	S	T	I	V	N	M	V	A	G	H
Query Conservation
Alig confidence																																	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	N	Q	F	K	K	V	V	P	D	L	A	Q	Q	A	C	L	R	A	L	K	D	W	G	G	D	K	G	D	I	T	.	.	.	.	H	I	V	S	V	T	S	T	G	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	I	P	D	V	N	F	K
Template Known Secondary structure																										S		G	G	G			.	.	.	.							S	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S
Template Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		2861	.	.	.	.	.	.	.	.	2870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2890	.					.	.	.	.	.	.	.	.	2900	.																												.	.	.	.	.	.	.	.
		147	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.				.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.	.
Query SS confidence																	.	.	.
Query Sequence		L	T	I	M	Y	G	L	R	G	P	S	I	S	I	A	.	.	.	T	A	C	T	S	G	V	H	N	I	G	H	A	A	R	I	I	A	Y	G	D	A	D	V	M	V	A	G	G	A	E	K	A	S	T	P	L	G	V	G	G	F	G	A	A	R	A	L	S	T	R	N	D	N	P	Q	A	A	S	R	P	W
Query Conservation																	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	I	D	L	L	G	L	N	K	D	V	E	R	V	S	L	N	L	M	G	C	L	A	G	L	S	S	L	R	T	A	A	S	L	A	K	A	S	P	R	N	R	I	L	V	V	C	T	E	V	C	S	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	F	S	N	T
Template Known Secondary structure							T			T	T								S		G	G	G														T	T		T	T												G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G				S
Template Predicted Secondary structure																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		2910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2960	.	.																							.	.	.	.	.
		224	.	.	.	.	.				230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.																.	.	280	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure								.	.	.																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence								.	.	.																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	K	E	R	D	G	.	.	.	F	V	L	G	D	G	A	G	M	L	V	L	E	E	Y	E	H	A	K	K	R	G	A	K	I	Y	A	E	L	V	G	F	G	M	S	S	D	A	Y	H	M	T	S	P	P	E	N	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	G	A	A	L	A	M	A
Query Conservation								.	.	.																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence								.	.	.																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	G	G	D	Q	M	V	A	S	S	I	F	A	D	G	S	A	A	Y	I	I	G	C	N	P	R	I	E	E	T	P	L	Y	E	V	M	C	S	I	N	R	S	F	P	N	T	E	N	A	M	V	W	D	L	E	K	E	G	W	N	L	G	L	D	A	S	I	P	I	V	I	G	S	G	I	E	A	F	V	D
Template Known Secondary structure		S	S										B											S	S			T	T																S	S		T	T	S							T	T								T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		2968	.	2970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3020	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3040	.	.	.	.	.	.	.
		286	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.						.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.		.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.																																				.
Query SS confidence															.	.	.	.	.																																				.
Query Sequence		N	A	L	R	D	A	G	I	E	A	S	Q	I	.	.	.	.	.	G	Y	V	N	A	H	G	T	S	T	P	A	G	D	K	A	E	A	Q	A	V	K	T	I	F	G	E	A	A	S	R	V	L	V	S	.	S	T	K	S	M	T	G	H	L	L	G	A	A	G	A	V	E	S	I	Y	S	I	L	A	L	R
Query Conservation															.	.	.	.	.																																				.
Alig confidence															.	.	.	.	.													.	.	.	.	.																			.																							.	.	.	.
Template Conservation																																.	.	.	.	.																																										.	.	.	.
Template Sequence		T	L	L	D	K	A	K	L	Q	T	S	T	A	I	S	A	K	D	C	E	F	L	I	H	T	G	G	K	S	I	.	.	.	.	.	L	M	N	I	E	N	S	L	G	I	D	P	K	Q	T	K	N	T	W	D	V	Y	H	A	Y	G	N	M	S	S	A	S	V	I	F	V	M	D	H	A	R	.	.	.	.
Template Known Secondary structure								T	T	T	S		S				S	S	S	S												.	.	.	.	.								T	T			G	G	G	G												B		T	T												.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.																																										.	.	.	.
Template SS confidence
		3048	.	3050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3060	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3070	.	.	.	.	.	.	.						.	.	3080	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3090	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3110	.	.	.	.	.	.	.	.
		360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	Q	A	V	P	P	T	I	N	L	D	N	P	D	E	G	C	D	L	D	F	V	P	H	E	A	R	Q	V	S	G	M	E	Y	T	L	C	N	S	F	G	F	G	G	T	N	G	S	L	I	F	K	K	I
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	S	K	S	L	P	T	Y	S	I	S	L	A	F	G	P	G	L	A	F	E	G	C	F	L	K	N	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T		S				S									T	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																												3119	3120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3140	.	.	.	.	.	.