Job Description P0AAI5 Confidence 99.97% Date Thu Jan 5 11:13:01 GMT 2012 Rank 50 Aligned Residues 338 % Identity 14% Template c2d3mA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:pentaketide chromone synthase; PDBTitle: pentaketide chromone synthase complexed with coenzyme a Resolution 1.60 Å

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.		20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.													.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60					.	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.
Query SS confidence																				.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.
Query Sequence		S	K	R	R	V	V	V	T	G	L	G	M	L	S	P	V	G	N	.	T	V	E	S	T	W	K	A	L	L	A	G	Q	S	G	I	S	L	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	H	F	D	T	S	A	Y	A	T	K	F	A	G	L	V	K	D	F	N	C	E	.	.	.	.	D	I	I	S
Query Conservation																				.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.
Alig confidence																				.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	D	G	T	A	T	V	M	A	I	G	T	A	H	P	P	H	I	F	P	Q	D	T	Y	A	D	V	Y	F	R	A	T	N	S	E	H	K	V	E	L	K	K	K	F	D	H	I	C	K	K	T	M	I	G	K	R	Y	F	N	Y	D	E	E	F	L	K	K	Y	P	N	I	T	S	Y	D	E	P	S	L	N
Template Known Secondary structure			S	S													S					G	G	G									T	T		T	T															S								S							T	T		T	T	T	S	S	S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		26	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.
		65	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	K	E	Q	R	K	M	D	A	F	I	Q	Y	G	I	V	A	G	V	Q	A	M	Q	D	S	G	L	E	I	T	E	E	N	A	T	R	I	G	A	A	I	G	S	G	I	G	G	L	G	L	I	E	E	N	H	T	S	L	M	N	G	G	P	R	K	I	S	P	F	F	V	P	S	T	I	V	N	M	V	A
Query Conservation
Alig confidence																																			.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																			.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	R	Q	D	I	C	V	P	G	V	P	A	L	G	T	E	A	A	V	K	A	I	E	E	W	G	R	P	K	S	E	I	T	.	.	.	.	H	L	V	F	C	T	S	C	G	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	M	P	S	A	D
Template Known Secondary structure																												S		G	G	G			.	.	.	.							S	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S
Template Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		106	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.					.	140	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	150	.	.	.	.
		145	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.			.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.
Predicted Secondary structure													.	.
Query SS confidence													.	.
Query Sequence		G	H	L	T	I	M	Y	G	L	R	G	.	.	P	S	I	S	I	A	T	A	C	T	S	G	V	H	N	I	G	H	A	A	R	I	I	A	Y	G	D	A	D	V	M	V	A	G	G	A	E	K	A	S	T	P	L	G	V	G	G	F	G	A	A	R	A	L	S	T	R	N	D	N	P	Q	A	A	S	R	P
Query Conservation													.	.
Alig confidence													.	.																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	Q	C	A	K	L	L	G	L	H	A	N	V	N	K	Y	C	I	Y	M	Q	G	Y	A	G	G	T	V	M	R	Y	A	K	D	L	A	E	N	N	R	G	A	R	V	L	V	V	C	A	E	L	T	I	M	M	L	R	A	P	N	E	T	H	L	D	N	A	I	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure									T			T	T								S																		T	S	T	T											G	G	G	T						S	T	T							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		155	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.
		223	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		W	D	K	E	R	D	G	F	V	L	G	D	G	A	G	M	L	V	L	E	E	Y	E	H	A	K	K	R	G	A	K	I	Y	A	E	L	V	G	F	G	M	S	S	D	A	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	M	T	S	P	P	E	N	G	A	G	A	A	L	A	M	A	N
Query Conservation																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	I	S	L	F	G	D	G	A	A	A	L	I	I	G	S	D	P	I	I	G	V	E	K	P	M	F	E	I	V	C	T	K	Q	T	V	I	P	N	T	E	D	V	I	H	L	H	L	R	E	T	G	M	M	F	Y	L	S	K	G	S	P	M	T	I	S	N	N	V	E	A	C	L	I	D
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.		T	T	B											S	S			T	T	T																T	T		T	T	T							T	T								T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
								225	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.
		287	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.				.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.		.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.
Predicted Secondary structure														.	.	.																																				.
Query SS confidence														.	.	.																																				.
Query Sequence		A	L	R	D	A	G	I	E	A	S	Q	I	.	.	.	G	Y	V	N	A	H	G	T	S	T	P	A	G	D	K	A	E	A	Q	A	V	K	T	I	F	G	E	A	A	S	R	V	L	V	S	.	S	T	K	S	M	T	G	H	L	L	G	A	A	G	A	V	E	S	I	Y	S	I	L	A	L	R	D	Q	A
Query Conservation														.	.	.																																				.
Alig confidence														.	.	.													.	.	.	.	.																			.																							.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																													.	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	F	K	S	V	G	I	T	P	P	E	D	W	N	S	L	F	W	I	P	H	P	G	G	R	A	I	.	.	.	.	.	L	D	Q	V	E	A	K	L	K	L	R	P	E	K	F	R	A	A	R	T	V	L	W	D	Y	G	N	M	V	S	A	S	V	G	Y	I	L	D	E	M	R	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure					T	T	T					S	S	G	G	G	S							S					.	.	.	.	.								T	T			T	T	T	T												B		G	G	G											.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		299	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.						.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.
		363	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	P	P	T	I	N	L	D	N	P	D	E	G	C	D	L	D	F	V	P	H	E	A	R	Q	V	S	G	M	E	Y	T	L	C	N	S	F	G	F	G	G	T	N	G	S	L	I	F	K	K	I
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	K	S	A	A	K	G	L	E	T	Y	G	E	G	L	E	W	G	V	L	L	G	F	G	P	G	I	T	V	E	T	I	L	L	H	S	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						T	T		S	B	T	T	T	T		S									T	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																367	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.