Job Description P0AAI5 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:13:01 GMT 2012 Rank 39 Aligned Residues 303 % Identity 23% Template c2c7yB_ PDB info PDB header:transferase Chain: B: PDB Molecule:3-ketoacyl-coa thiolase 2; PDBTitle: plant enzyme Resolution 2.10 Å

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		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	S	K	R	R	V	V	V	T	G	L	G	M	L	S	P	V	G	N	T	V	E	S	T	W	K	A	L	L	A	G	Q	S	G	I	S	L	I	D	H	F	D	T	S	A	Y	A	T	K	F	A	G	L	V	K	D	F	N	C	E	D	I	I	S	R	K	E	Q	R	K	M	D	A	F	I	Q	Y	G	I	V
Query Conservation
Alig confidence												.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation												.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	Y	G	D	D	V	V	I	V	A	.	A	H	R	T	P	L	C	K	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	R	G	N	F	K	D	T	Y	P	D	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	L	A	P
Template Known Secondary structure				T	T	T						.									T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T		T	T	T	T			T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure												.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		47	.	.	50	.	.	.	.	.	.		.	.	.	60	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.																.	.	80	.
		81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.			.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																											.	.
Query SS confidence																																																																											.	.
Query Sequence		A	G	V	Q	A	M	Q	D	S	G	L	E	I	T	E	E	N	A	T	R	I	G	A	A	I	G	S	G	I	G	G	L	G	L	I	E	E	N	H	T	S	L	M	N	G	G	P	R	K	I	S	P	F	F	V	P	S	T	I	V	N	M	V	A	G	H	L	T	I	M	Y	G	L	.	.	R	G	P	S	I
Query Conservation																																																																											.	.
Alig confidence																			.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.
Template Conservation																			.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	L	R	A	L	I	E	K	T	N	L	N	P	S	E	V	G	.	.	.	.	D	I	V	V	G	T	V	L	A	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	S	Q	R	A	S	E	C	R	M	A	A	F	Y	A	G	F	P	E	T	V	A	V	R
Template Known Secondary structure											T			G	G	G			.	.	.	.								S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T													T	T			T	T	S
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		82	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.					.	100	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.
		159	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	200
Predicted Secondary structure																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	I	A	T	A	C	T	S	G	V	H	N	I	G	H	A	A	R	I	I	A	Y	G	D	A	D	V	M	V	A	G	G	A	E	K	A	S	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	L	G	V
Query Conservation																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	V	N	R	Q	C	S	S	G	L	Q	A	V	A	D	V	A	A	A	I	K	A	G	F	Y	D	I	G	I	G	A	G	L	E	S	M	T	T	N	P	M	A	W	E	K	K	F	A	Q	A	Q	N	C	L	L	P	M	G	V	T	S	E	N	V	A	Q	R	F	G	V	S	R	Q	E	Q	D	Q	A	A	V
Template Known Secondary structure						S	S			S													T	T	S		S										S				S	S																											T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		133	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.
		201	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	G	F	G	A	A	R	A	L	S	T	R	N	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	P	Q	A	A	S	R	P	W	D	K	E	R	D	G	F	V	L	G	D	G	A	G
Query Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	S	H	R	K	A	A	A	A	T	A	A	G	K	F	K	D	E	I	I	P	V	K	T	K	L	V	D	P	K	T	G	D	E	K	P	I	T	V	S	V	D	D	G	I	R	P	T	T	T	L	A	S	L	G	K	L	K	P	V	F	K	K	D	G	T	T	T	A	G	N	S	S	Q	V	S	D	G	A	G
Template Known Secondary structure													T	T	T	T	T	T	T	B										T	T	T										S		T	T			T	T							T	T			B	S	S	S	T	T		S		B	S	S	S	B			B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		238	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	L	V	L	E	E	Y	E	H	A	K	K	R	G	A	K	I	Y	A	E	L	V	G	F	G	M	S	S	D	A	Y	H	M	T	S	P	P	E	N	G	A	G	A	A	L	A	M	A	N	A	L	R	D	A	G	I	E	A	S	Q	I	G	Y	V	N	A	H	G	T	S	T	P	A	G	D	K	A	E	A	Q
Query Conservation
Alig confidence																																					.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.
Template Conservation																																					.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.
Template Sequence		A	V	L	L	M	K	R	S	V	A	M	Q	K	G	L	P	V	L	G	V	F	R	T	F	A	A	V	G	V	D	P	A	I	M	G	.	.	.	.	.	I	G	P	A	V	A	I	P	A	A	V	K	A	A	G	L	E	L	D	D	I	D	L	F	E	I	N	E	A	F	A	.	.	.	.	.	S	Q	F	V
Template Known Secondary structure															T																	T	T	S	T	T	.	.	.	.	.														T	T			G	G	G									S	B		.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.
Template SS confidence
		300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.						.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.						.	.	.	.
		318	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	V	K	T	I	F	G	E	A	A	S	R	V	L	V	S	S	T	K	S	M	T	G	H	L	L	G	A	A	G	A	V	E	S	I	Y	S	I	L	A	L	R	D	Q	A	V	P	P	T	I	N	L	D	N	P	D	E	G	C	D	L	D	F	V	P	H	E	A	R	Q	V	S	G	M	E	Y	T	L	C	N
Query Conservation
Alig confidence																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	C	R	N	K	L	G	L	D	P	E	K	I	N	V	N	G	G	A	M	A	I	G	H	P	L	G	A	T	G	A	R	C	V	A	T	L	L	H	E	M	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	R	G	K	D	C	R	F	G	V	V	S
Template Known Secondary structure								T			G	G	G	B	S	T	T								B		G	G	G															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T
Template Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.
		398	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	F	G	F	G	G	T	N	G	S	L	I	F	K	K	I
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		M	C	I	G	T	G	M	G	A	A	A	V	F	E	R	G
Template Known Secondary structure				S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		424	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.