Job Description P28861 Confidence 99.93% Date Thu Jan 5 11:45:15 GMT 2012 Rank 31 Aligned Residues 220 % Identity 22% Template c2bpoA_ PDB info PDB header:reductase Chain: A: PDB Molecule:nadph-cytochrom p450 reductase; PDBTitle: crystal structure of the yeast cpr triple mutant: d74g,2 y75f, k78a. Resolution 2.9 Å

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		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.					.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.			.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.												.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.												.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	A	D	W	V	T	G	K	V	T	K	V	Q	N	W	T	D	.	.	.	.	A	L	F	S	L	T	V	H	A	P	V	.	.	L	P	F	T	A	G	Q	F	T	K	L	G	L	E	I	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																			.	.	.	.												.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.												.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	S	Q	P	Y	I	A	P	I	V	K	S	R	E	L	F	S	S	N	D	R	N	C	I	H	S	E	F	D	L	S	G	S	N	I	K	Y	S	T	G	D	H	L	A	V	W	P	S	N	P	L	E	K	V	E	Q	F	L	S	I	F	N	L	D	P	E	T	I	F	D	L	K	P	L	D	P	T	V	K	V
Template Known Secondary structure		T	T	B																S	S											T	T	B	T					T	T																						T			T	T							B	S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		265	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	F	P	T	P	T	T	I	G	A	A	I	K	H	Y	L	E	I	T	G	P	V	S	R	Q	L	F	S	S	L	I	Q	F	A	P	N	A	D	V	K	E	K	L	T	L	L	S	K	D	K	D	Q	F	A	V	E	I	T	S	K	Y	F	N	I	A	D	A	L	K	Y	L	S	D	G	A	K	W	D	T	V
Template Known Secondary structure		S	S		S	S										T	B			S	S											S	T	T		S	S											T	T									T	G	G	G	T												T	T				T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		345	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.
											45	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.			.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.													.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	E	R	V	Q	R	A	Y	S	Y	V	N	S	P	.	.	D	N	P	D	L	E	F	Y	L	V	T	V	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	G	K	L	S	P	R	L	A	A	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	M	Q	F	L	V	E	S	V	P	Q	M	T	P	R	Y	Y	S	I	S	S	S	S	L	S	E	K	Q	T	V	H	V	T	S	I	V	E	N	F	P	N	P	E	L	P	D	A	P	P	V	V	G	V	T	T	N	L	L	R	N	I	Q	L	A	Q	N	N	V	N	I	A	E	T	N	L	P	V	H	Y	D
Template Known Secondary structure										S		B								B		S		T	T	T		T	T														S	S		T	T	S																			T	T			T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		425	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.
									83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130							.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	K	P	G	D	E	V	Q	V	V	S	E	A	A	G	F	F	V	L	D	E	V	P	H	C	E	T	L	W	M	L	A	T	G	T	A	I	G	P	Y	L	S	I	L	Q	L	G	K	D	.	.	.	.	.	.	L	D	R	F	K	N	L	V	L	V	H	A	A	R	Y	A	A	D	L
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.																							.	.																									.	.	.	.	.	.
Template Conservation																															.	.
Template Sequence		L	N	G	P	R	K	L	F	A	N	Y	K	L	P	V	H	V	R	R	S	N	F	R	L	P	S	N	P	S	.	.	T	P	V	I	M	I	G	P	G	T	G	V	A	P	F	R	G	F	I	R	E	R	V	A	F	L	E	S	Q	K	N	V	S	L	G	K	H	I	L	F	Y	G	S	R	N	T	D	D	F
Template Known Secondary structure		S	S		G	G	G	T	T	T	T	T										S					S	S	T	T	.	.	S								G	G	G	G																T																S	S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure																															.	.
Template SS confidence
		505	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.			.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.
		150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.		.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																					.
Query SS confidence																																																																					.
Query Sequence		S	Y	L	P	L	M	Q	E	L	E	K	R	Y	E	G	K	L	R	I	Q	T	V	V	S	R	E	T	A	A	G	S	L	T	G	R	I	P	A	L	I	E	S	G	E	L	E	S	T	I	G	L	P	M	N	K	E	T	S	H	V	M	L	C	G	N	P	Q	.	M	V	R	D	T	Q	Q	L	L	K	E
Query Conservation																																																																					.
Alig confidence																													.	.																									.	.	.												.
Template Conservation																													.	.																									.	.	.
Template Sequence		L	Y	Q	D	E	W	P	E	Y	A	K	K	L	D	G	S	F	E	M	V	V	A	H	S	R	L	P	.	.	N	T	K	K	V	Y	V	Q	D	K	L	K	D	Y	E	D	Q	V	F	E	M	I	N	N	.	.	.	G	A	F	I	Y	V	C	G	D	A	K	G	M	A	K	G	V	S	T	A	L	V	G
Template Known Secondary structure		T	T	T	T	T									G	G	G								S			T	.	.	T	S												T									T	T	.	.	.	T									S	T	T
Template Predicted Secondary structure																													.	.																									.	.	.
Template SS confidence
		587	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.			.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.				.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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