Job Description P0AED7 Confidence 99.58% Date Thu Jan 5 11:23:04 GMT 2012 Rank 58 Aligned Residues 242 % Identity 13% Template d1rtqa_ SCOP info Phosphorylase/hydrolase-like Zn-dependent exopeptidases Bacterial dinuclear zinc exopeptidases Resolution 0.95

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		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.				.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.											.	.	.	50	.	.	.	.	.		.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.
Query SS confidence																	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.
Query Sequence		C	P	V	I	E	L	T	Q	Q	L	I	R	R	P	S	.	.	.	L	S	P	D	D	A	G	C	Q	A	L	L	I	E	R	L	Q	A	I	G	F	T	V	E	R	M	D	F	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	T	Q	N	F	W	A	W	R	.	G	Q	G	E	T	L	A	F	A	G	H	T	D
Query Conservation																	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.
Alig confidence																	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.
Template Conservation
Template Sequence		S	Q	I	T	G	T	I	S	S	L	E	S	F	T	N	R	F	Y	T	T	T	S	G	A	Q	A	S	D	W	I	A	S	E	W	Q	A	L	S	A	S	L	P	N	A	S	V	K	Q	V	S	H	S	G	Y	N	Q	K	S	V	V	M	T	I	T	G	S	E	A	P	D	E	W	I	V	I	G	G	H	L	D
Template Known Secondary structure													T	S	S				T	T	S																			T	T	S	T	T									T	T													S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		69	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	V	P	P	G	D	A	D	R	W	I	N	P	P	F	E	P	T	I	R	D	G	M	L	F	G	R	G	A	A	D	M	K	G	S	L	A	A	M	V	V	A	A	E	R	F	V	A	Q	H	P	N	H	T	G	R	L	A	F	L	I	T	S	D	E	E	A	S	A	H	N	G	T	V	K	V	V	E	A	L
Query Conservation
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																.
Template Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																.
Template Sequence		S	T	I	G	S	H	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	E	Q	S	V	A	P	G	A	D	D	D	A	S	G	I	A	A	V	T	E	V	I	R	V	L	S	E	N	N	F	Q	P	K	R	S	I	A	F	M	A	Y	A	A	E	E	V	.	G	L	R	G	S	Q	D	L	A	N	Q	Y
Template Known Secondary structure				S	S	T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T						T	T	T	T																	T	T				S									S		G	G	G	.	T	S
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																.
Template SS confidence
		100	.	.	.	.	.	.														.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.		.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.
		149	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	A	R	N	E	R	L	D	Y	C	L	V	G	E	P	S	S	I	E	V	V	G	D	V	V	K	N	G	R	R	G	S	L	T	C	N	L	T	I	H	G	V	Q	G	H	V	A	Y	P	H	L	A	D	N	P	V	H	R	A	A	P	F	L	N	E	L	V	A	I	E	W	D	Q	G	N	E	F	F	P	A
Query Conservation
Alig confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	S	E	G	K	N	V	V	S	A	L	Q	L	D	M	T	N	Y	K	G	S	A	Q	D	V	V	F	I	T	D	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure				T	T										S			S				S	S	S	S						T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		166	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.
		229	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	S	M	Q	I	A	N	I	Q	A	G	T	G	S	N	N	V	I	P	G	E	L	F	V	Q	F	N	F	R	F	S	T	E	L	T	D	E	M	I	K	A	Q	V	L	A	L	L	E	K	H	Q	L	R	Y	T	V	D	W	W	L	S	G	Q	P	F	L	T	A	R	G	K	L	V	D	A	V	V	N	A	V
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	D	S	N	F	T	Q	Y	L	T	Q	L	M
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																																					197	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		309	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.			.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340						.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.						.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.																		.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.
Query SS confidence																	.	.																		.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	H	Y	N	E	I	K	P	Q	L	L	T	T	G	G	.	.	T	S	D	G	R	F	I	A	R	M	G	A	Q	V	V	E	L	.	.	.	.	.	G	P	V	N	A	T	I	H	K	I	N	E	C	V	N	A	.	.	.	.	.	A	D	L	Q	L	L	A	R	M	Y	Q	R	I	M	E	Q	L	V
Query Conservation																	.	.																		.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.	.																		.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	E	Y	L	P	S	L	T	Y	G	F	D	T	C	G	Y	A	C	S	D	H	A	S	W	H	N	A	G	Y	P	A	A	M	P	F	E	S	K	F	N	D	Y	N	P	R	I	H	T	T	Q	D	T	L	A	N	S	D	P	T	G	S	H	A	K	K	F	T	Q	L	G	L	A	Y	A	I	E	M	G
Template Known Secondary structure						T	T									S	S			S	T							T	T								S	S		G	G	G	S		T	T	T	T	S	T	T			G	G	G	S		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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