Job Description P21517 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:38:27 GMT 2012 Rank 53 Aligned Residues 375 % Identity 22% Template d2fhfa5 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Amylase, catalytic domain Resolution 1.65

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		102	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	A	R	L	E	Q	F	A	V	D	V	P	D	I	G	P	Q	W	A	A	D	Q	I	F	Y	Q	I	F	P	D	R	F	A	R	S	L	P	R	E	A	E	Q	D	H	V	Y	Y	H	H	A	A	G	Q	E	I	I	L	R	D	W	D	E	P	V	T	A	Q	A	G	G	S	T	F	Y	G	G	D	L	D	G
Query Conservation
Alig confidence																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	E	G	W	D	G	L	T	M	P	H	A	Q	K	T	K	A	D	L	A	K	M	T	I	H	E	S	H	I	R	D	L	S	A	W	D	Q	T	V	P	A	E	L	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	K	Y	L	A
Template Known Secondary structure			T	T	G	G	G				S	S			S	S						T													T	T		T	T	S		G	G	G	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		403	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	450	.
									182	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	I	S	E	K	L	P	Y	L	K	K	L	G	V	T	A	L	Y	L	N	P	V	F	K	A	P	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	T	A	Q	E	S	N	M	V	Q	H	L	K	Q	L	S	A	S	G	V	T	H	I	E	L	L	P	V	F	D	L	A	T	V	N	E	F	S	D	K	V	A	D	I	Q	Q	P	F	S	R	L	C	E	V	N	S	A	V	K	S	S	E	F	A	G	Y	C	D	S	G	S	T	V	E	E	V	L	T	Q	L
Template Known Secondary structure		G	G		T	T	S													T							S						S	S	S				G	G	G				T	T	S	B													T	S	T	T	G	G	G	T	T	S	S		B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		452	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.
																										208	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.								.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.		.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.														.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.														.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	H	K	Y	D	T	E	D	Y	R	H	V	D	P	Q	F	G	G	.	.	.	.	.	.	.	D	G	A	L	L	R	L	R	H	N	T	Q	Q	.	L	G	M	R	L	V	L	D	G	V	F	N	H	S	G	D	S
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.														.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.														.
Template Conservation
Template Sequence		K	Q	N	D	S	K	D	N	P	Q	V	Q	A	L	N	T	L	V	A	Q	T	D	S	Y	N	W	G	Y	D	P	F	H	Y	T	V	P	E	G	S	Y	A	T	D	P	E	G	T	A	R	I	K	E	F	R	T	M	I	Q	A	I	K	Q	D	L	G	M	N	V	I	M	D	V	V	Y	N	H	T	N	A	A
Template Known Secondary structure		S	T	T		B	T	T	B											T	T	S	S	S															S	T	T	S	S			S	T	T																T	S										T	T			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		532	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.
		256	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	A	W	F	D	R	H	N	R	G	T	G	G	A	C	H	N	P	E	S	P	W	R	D	W	Y	S	F	S	D	D	G	T	A	L	D	W	L	G	Y	A	S	L	P	K	L	D	Y	Q	S	E	S	L	V	N	E	I	Y	R	G	E	D	S	I	V	R	H	W	L	K	A	P	W	N	M	D	G	W	R	L
Query Conservation
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.	.	.	.								.
Template Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.	.	.	.								.
Template Sequence		G	P	T	D	R	T	S	V	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	K	I	V	P	W	Y	Y	Q	R	L	N	E	T	T	G	S	V	E	S	A	T	C	C	S	D	S	A	P	E	H	R	M	F	A	K	L	I	A	D	S	.	.	.	.	L	A	V	W	T	T	D	.	Y	K	I	D	G	F	R	F
Template Known Secondary structure		S	S	S		T	T				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				S	T	T	T	S	B		B		T	T	T			B			T	T	S	S			B		T	T	S											.	.	.	.								.
Template Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.	.	.	.								.
Template SS confidence
		612	.	.	.	.	.	.	.	620											.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.					.	.	.	.	.	.	.		.	670	.	.	.	.	.	.
		336	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.				.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																														.	.	.												.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																														.	.	.												.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	V	V	H	M	L	G	E	A	G	G	A	R	N	N	M	Q	H	V	A	G	I	T	E	A	A	K	E	T	Q	P	E	A	Y	I	V	G	E	H	F	G	D	A	R	Q	W	L	Q	A	D	V	E	D	A	A	M	N	Y	R	G	.	.	.	F	T	F	P	L	W	G	F	L	A	N	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																														.	.	.												.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.																																													.	.	.												.	.	.	.	.	.
Template Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	L	M	L	Y	H	P	K	.	.	.	.	.	.	.	.	A	Q	I	L	S	A	W	E	R	I	K	A	L	N	P	D	I	Y	F	F	G	E	G	W	D	S	N	Q	S	D	R	F	E	I	A	S	Q	I	N	L	K	G	T	G	I	G	T	F	S	D	R	L	R	D	A	V	R	G	G	G	P	F	D	S
Template Known Secondary structure		T	T	G	G	G	S	B		.	.	.	.	.	.	.	.												T	T		T	T											S		T	T	T	S		B			T	T	T	T	T	T	S	S															S		T	T
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		677	.	.	680	.	.	.	.									.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.
																407	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	440	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	D	I	S	Y	D	P	Q	Q	I	D	A	Q	T	C	M	A	W	M	D	N	Y	R	A	G	L	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	Q	Q	Q	L	R	M	F	N
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	D	A	L	R	Q	N	Q	G	V	G	S	G	A	G	V	L	P	N	E	L	T	T	L	S	D	D	Q	A	R	H	L	A	D	L	T	R	L	G	M	A	G	N	L	A	D	F	V	L	I	D	K	D	G	A	V	K	R	G	S	E	I	D	Y	N	G	A	P	G	G	Y	A	A	D	P	T	E	V	V	N
Template Known Secondary structure		T	T								G	G	G	T	T	T	T	S			S	S																				T	T		B	T	T						T	T	S					G	G	G	S			T	T			S			B	S	S	G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		749	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.
		443	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.											460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.														.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	L	D	S	H	D	T	A	R	F	K	T	L	L	G	R	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	A	R	L	P	L	A	V	V	W	L	F	T	W	P	G	V	P	C	I	Y	Y	G	D	E	V	G	L	D	G	K	N	D	P	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	R	K	P	F
Query Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	V	S	K	H	D	N	Q	T	L	W	D	M	I	S	Y	K	A	A	Q	E	A	D	L	D	T	R	V	R	M	Q	A	V	S	L	A	T	V	M	L	G	Q	G	I	A	F	D	Q	Q	G	S	E	L	L	R	S	K	S	F	T	R	D	S	Y	D	S	G	D	W	F	N	R	V	D	Y	S	L	Q	D	N
Template Known Secondary structure			S			S	S	S	S										S		T	T																			T	S	S	S						T	T	G	G	G	T				T	T		S			T	T	S									T	T		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		829	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.	.	.
		500	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530
Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	W	Q	V	E	K	Q	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	A	L	F	A	L	Y	Q	R	M	I	A	L	R	K	K	S	Q	A	L	R	H	G
Query Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	Y	N	V	G	M	P	R	S	S	D	D	G	S	N	Y	D	I	I	A	R	V	K	D	A	V	A	T	P	G	E	T	E	L	K	Q	M	T	A	F	Y	Q	E	L	T	A	L	R	K	S	S	P	L	F	T	L	G
Template Known Secondary structure		S		S	S	S								G	G	G								T	T	S	S																							T	S		G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		909	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960	.	.	.	.	.