Job Description P21517 Confidence 98.02% Date Thu Jan 5 11:38:27 GMT 2012 Rank 138 Aligned Residues 290 % Identity 17% Template d1tz7a1 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Amylase, catalytic domain Resolution 2.15

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		177	.	.		180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.				.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.																												.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence					.																												.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	D	L	.	D	G	I	S	E	K	L	P	Y	L	K	K	L	G	V	T	A	L	Y	L	N	P	V	F	K	A	P	.	.	.	S	V	H	K	Y	D	T	E	D	Y	R	H	V	D	P	Q	F	G	G	D	G	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation					.																												.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.																												.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	D	L	G	K	E	A	Y	R	F	L	D	F	L	K	E	C	G	F	S	L	W	Q	V	L	P	L	N	P	T	S	L	E	A	G	N	S	P	Y	S	S	N	S	L	F	A	G	N	Y	V	L	I	D	P	E	E	L	L	E	E	D	L	I	K	E	R	D	L	K	R	F	P	L	G	E	A	L	Y	E	V
Template Known Secondary structure				S	S														T										S				G	G	G	T	T		T	T	S		S		S	S	S			G	G	G	S		T						T	T	S	S		G	G	G						S		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	Y	E	Y	K	K	E	L	L	E	K	A	F	K	N	F	R	R	F	E	L	L	E	D	F	L	K	E	H	S	Y	W	L	R	D	Y	A	L	Y	M	A	I	K	E	E	E	G	K	E	W	Y	E	W	D	E	E	L	K	R	R	E	K	E	A	L	K	R	V	L	N	K	L	K	G	R	F	Y	F	H	V
Template Known Secondary structure																T														T																			S		G	G	G	S						T	T												T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.
											229	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.												.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	L	R	L	R	H	N	T	Q	Q	L	G	M	R	L	V	L	D	G	V	F	N	H	S	G	D	S	H	A	W	F	D	R	H	N	R	G	T	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	A	C	H	N	P	E	S	P	W	R	D	W	Y	S	F	S	D	D	G	T
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	V	Q	F	V	F	F	K	Q	W	E	K	L	R	R	Y	A	R	E	R	G	I	S	I	V	G	D	L	P	M	.	Y	P	S	Y	S	S	A	D	V	W	T	N	P	E	L	F	K	L	D	G	D	L	K	P	L	F	V	A	G	V	P	P	D	F	F	S	K	T	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure																					T	T									S	.	S			S	S	S							G	G	G	B		B		T	T	S		B	S									S	S	S	S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.		210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.
		289	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.							.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																	.	.	.	.	.	.																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	L	D	W	L	G	Y	A	S	L	P	K	L	D	Y	.	.	.	.	.	.	Q	S	E	S	L	V	N	E	I	Y	R	G	E	D	S	I	V	R	H	W	L	K	A	P	W	N	M	D	G	W	R	L	D	V	V	H	M	L	G	E	A	G	G	A	R	N	N	M	Q	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																	.	.	.	.	.	.																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.				.	.	.	.								.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.				.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	Q	L	W	.	.	.	.	G	N	P	V	Y	N	W	E	E	H	E	K	E	G	F	R	W	W	I	R	R	V	L	H	N	L	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	F	D	F	L	R	L	D	H	F	R	G	F	E	A	Y	W	E	V	P	Y	G	E	E	T	A	V	N	G	R	W	V	K	A
Template Known Secondary structure		.				.	.	.	.					B								T	T	T												T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T		S					T	T	G	G	G	G	T							T	T		S	S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure		.				.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
			249	250	.					.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.												.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.
			354	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.
Predicted Secondary structure		.
Query SS confidence		.
Query Sequence		.	V	A	G	I	T	E	A	A	K	E	T	Q	P	E	A	Y	I	V	G	E	H	F	G	D	A	R	Q	W	L	Q	A	D	V	E	D	A	A	M	N	Y	R	G	F	T	F	P	L	W	G	F	L	A	N	T	D	I	S	Y	D	P	Q	Q	I	D	A	Q	T	C	M	A	W	M	D	N	Y	R	A	G	L
Query Conservation		.
Alig confidence		.																																						.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																								.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	G	K	T	L	F	K	K	L	L	S	Y	F	P	K	N	P	F	I	A	E	D	L	G	F	I	T	D	E	V	R	Y	L	R	E	T	F	K	.	.	.	.	I	P	G	S	R	V	I	E	F	A	F	Y	D	K	E	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	H	L
Template Known Secondary structure														S	T	T									S	S												T	T	.	.	.	.							G	G	G	T	T	S	S	T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																								.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		313	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350					.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.																				.	.	.
		433	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480								.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.						.	.
Query SS confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.						.	.
Query Sequence		S	H	Q	Q	Q	L	R	M	F	N	Q	L	D	S	H	D	T	A	R	F	K	T	L	L	G	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	I	A	R	L	P	L	A	V	V	W	L	F	T	W	P	G	V	P	C	I	Y	.	.	.	.	.	.	.	Y	G	D	E	V	.	.
Query Conservation																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.						.	.
Alig confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.						.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	H	N	V	E	E	N	N	V	Y	Y	T	S	T	H	D	L	P	P	I	R	G	W	F	E	N	L	G	E	E	S	R	K	R	L	F	E	Y	L	G	R	E	I	K	E	E	K	V	N	E	E	L	I	R	L	V	L	I	S	R	A	K	F	A	I	I	Q	M	Q	D	L	L	N	L	G	N	E	A	R	M
Template Known Secondary structure		G	G	G			S	S					S			T	T	S									T														T	S				G	G	G												S			S										T	T			G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		486	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	L	D	G	K	N	D	P	F	C	R	K	P	F	P	W	Q	V	E	K	Q	D	T	A	L	F	A	L	Y	Q	R	M	I	A	L
Query Conservation
Alig confidence																								.	.	.	.
Template Conservation																								.	.	.	.
Template Sequence		N	Y	P	G	R	P	F	G	N	W	R	W	R	I	K	E	D	Y	T	Q	K	K	.	.	.	.	E	F	I	K	K	L	L	G	I
Template Known Secondary structure				T	T			S	S		S						S		G	G	G	G		.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.	.
Template SS confidence
		450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.					.	.	.	.	.	.	.	.	480