Job Description P21517 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:38:27 GMT 2012 Rank 65 Aligned Residues 355 % Identity 27% Template d1g5aa2 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Amylase, catalytic domain Resolution 1.40

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		115	.	.	.	.	120	.			.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.
Predicted Secondary structure									.	.
Query SS confidence									.	.
Query Sequence		I	G	P	Q	W	A	A	.	.	D	Q	I	F	Y	Q	I	F	P	D	R	F	A	R	S	L	P	R	E	A	E	Q	D	H	V	Y	Y	H	H	A	A	G	Q	E	I	I	L	R	D	W	D	E	P	V	T	A	Q	A	G	G	S	T	F	Y	G	G	D	L	D	G	I	S	E	K	L	P	Y	L	K	K	L
Query Conservation									.	.
Alig confidence									.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	N	P	D	W	I	L	S	N	K	Q	V	G	G	V	C	Y	V	D	L	F	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	D	L	K	G	L	K	D	K	I	P	Y	F	Q	E	L
Template Known Secondary structure		T		G	G	G	G	G		T	T													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S						T	T
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		88	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.
		193	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.				.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure															.	.	.
Query SS confidence															.	.	.
Query Sequence		G	V	T	A	L	Y	L	N	P	V	F	K	A	.	.	.	P	S	V	H	K	Y	D	T	E	D	Y	R	H	V	D	P	Q	F	G	G	D	G	A	L	L	R	L	R	H	N	T	Q	Q	L	G	M	R	L	V	L	D	G	V	F	N	H	S	G	D	S	H	A	W	F	D	R	H	N	R	G	T	G	G	A
Query Conservation															.	.	.
Alig confidence															.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	L	T	Y	L	H	L	M	P	L	F	K	C	P	E	G	K	S	D	G	G	Y	A	V	S	S	Y	R	D	V	N	P	A	L	G	T	I	G	D	L	R	E	V	I	A	A	L	H	E	A	G	I	S	A	V	V	D	F	I	F	N	H	T	S	N	E	H	E	W	A	Q	R	C	A	A	G	D	P	L	F
Template Known Secondary structure		T		S								B				S	S		S	T	T	T	T	S		S		S	S	S	B		T	T	T																T	T										S				T	T	S								T	T		G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		126	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.
		270																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		C	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	N	P	E	S	P	W	R	D	W	Y	S	F	S	D	D	G	T	A	L	D	W	L	G	Y	A	S	L	P	K	L	D	Y	Q	S	E	S	L	V	N	E	I	Y	R	G	E	D	S	I	V	R	H	W	L	K	A	P	W	N
Query Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																														.	.	.	.						.	.
Template Conservation																																																																				.	.	.	.						.	.
Template Sequence		D	N	F	Y	Y	I	F	P	D	R	R	M	P	D	Q	Y	D	R	T	L	R	E	I	F	P	D	Q	H	P	G	G	F	S	Q	L	E	D	G	R	W	V	W	T	T	F	N	S	F	Q	W	D	L	N	Y	S	N	P	W	V	F	R	A	M	A	G	E	.	.	.	.	M	L	F	L	A	.	.	N	L	G
Template Known Secondary structure		T	T	S	B				S	S	S							T	T	T				S	S	T	T	T		S	T	T					T	T	S						S	S	S	T	T				B		T	T	S											.	.	.	.						.	.	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																				.	.	.	.						.	.
Template SS confidence
		206	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.					.	.	.	.	.			.	.	.
		330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.						350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.				.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.
Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.																																			.	.	.
Query SS confidence																						.	.	.	.	.																																			.	.	.
Query Sequence		M	D	G	W	R	L	D	V	V	H	M	L	G	E	A	G	G	A	R	N	.	.	.	.	.	N	M	Q	H	V	A	G	I	T	E	A	A	K	E	T	Q	P	E	A	Y	I	V	G	E	H	F	G	D	A	R	Q	W	L	Q	.	.	.	A	D	V	E	D	A	A	M	N	Y	R	G	F	T	F	P	L	W
Query Conservation																						.	.	.	.	.																																			.	.	.
Alig confidence																						.	.	.	.	.																																			.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	D	I	L	R	M	D	A	V	A	F	I	W	K	Q	M	G	T	S	C	E	N	L	P	Q	A	H	A	L	I	R	A	F	N	A	V	M	R	I	A	A	P	A	V	F	F	K	S	E	A	I	V	H	P	D	Q	V	V	Q	Y	I	G	Q	D	E	C	Q	I	G	Y	N	P	L	Q	M	A	L	L	W	N
Template Known Secondary structure			S					T	T	G	G	G	S				T	T	S		S	S	S																				T	T									S						G	G	G	B	S	T	T	S	B	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		402	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.
Predicted Secondary structure																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	F	L	A	N	T	D	I	S	Y	D	P	Q	Q	I	D	A	Q	T	C	M	A	W	M	D	N	Y	R	A	G	L	S	H	Q	Q	Q	L	R	M	F	N	Q	L	D	S	H	D	T	A	R	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	L	A	T	R	E	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	L	L	H	Q	A	L	T	Y	R	H	N	L	P	E	H	T	A	W	V	N	Y	V	R	S	H	D	D	I	G	W	T	F	A	D	E	D	A	A	Y	L	G	I	S	G	Y	D	H	R	Q	F	L	N	R	F	F	V	N	R	F
Template Known Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										S					T	T							S			S	S		B												T	T															T	T		S
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		360	.	.	.	.	.	.														.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.
																																	453	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.					490	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.						.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.						.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	T	L	L	G	R	D	I	A	R	L	P	L	A	V	V	W	L	F	T	W	P	G	V	P	C	I	Y	Y	G	D	E	V	G	L	D	G	.	.	.	.	K	N	D	P	F	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.						.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.						.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	G	S	F	A	R	G	V	P	F	Q	Y	N	P	S	T	G	D	C	R	V	S	G	T	A	A	A	L	V	G	L	A	Q	D	D	P	H	A	V	D	R	I	K	L	L	Y	S	I	A	L	S	T	G	G	L	P	L	I	Y	L	G	D	E	V	G	T	L	N	D	D	D	W	S	Q	D	S	N	K	S	D
Template Known Secondary structure		T	T												T	T	T														T	G	G	G	T		T	T															S	S	S						T	T	G	G	G	T					S	S	G	G	G		T	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		427	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.
							495	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.								510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	C	R	K	P	F	P	W	Q	V	E	K	Q	D	T	A	.	.	.	.	.	.	.	L	F	A	L	Y	Q	R	M	I	A	L	R	K	K	S	Q	A	L	R	H	G
Query Conservation		.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	S	R	W	A	H	R	P	R	Y	N	E	A	L	Y	A	Q	R	N	D	P	S	T	A	A	G	Q	I	Y	Q	D	L	R	H	M	I	A	V	R	Q	S	N	P	R	F	D	G	G
Template Known Secondary structure			G	G	G	G	G										T	T	T	T		T	T	S																				G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		507	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.