Job Description P21517 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:38:27 GMT 2012 Rank 83 Aligned Residues 342 % Identity 23% Template d1eh9a3 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Amylase, catalytic domain Resolution 3.00

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		114	.	.	.	.	.	120	.			.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.
Predicted Secondary structure										.	.
Query SS confidence										.	.
Query Sequence		D	I	G	P	Q	W	A	A	.	.	D	Q	I	F	Y	Q	I	F	P	D	R	F	A	R	S	L	P	R	E	A	E	Q	D	H	V	Y	Y	H	H	A	A	G	Q	E	I	I	L	R	D	W	D	E	P	V	T	A	Q	A	G	G	S	T	F	Y	G	G	D	L	D	G	I	S	E	K	L	P	Y	L	K	K
Query Conservation										.	.
Alig confidence										.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	N	N	E	T	F	L	K	K	E	D	L	I	I	Y	E	I	H	V	G	T	F	T	P	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	T	F	E	G	V	I	R	K	L	D	Y	L	K	D
Template Known Secondary structure				S			S			S	S	S								T	T	T	S	S	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S							T
Template Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		91	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.																																									.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130
		192	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.			.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.
Query SS confidence																	.	.
Query Sequence		L	G	V	T	A	L	Y	L	N	P	V	F	K	A	P	.	.	S	V	H	K	Y	D	T	E	D	Y	R	H	V	D	P	Q	F	G	G	D	G	A	L	L	R	L	R	H	N	T	Q	Q	L	G	M	R	L	V	L	D	G	V	F	N	H	S	G	D	S	H	A	W	F	D	R	H	N	R	G	T	G	G	A
Query Conservation																	.	.
Alig confidence																	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	G	I	T	A	I	E	I	M	P	I	A	Q	F	P	G	K	R	D	W	G	Y	D	G	V	Y	L	Y	A	V	Q	N	S	Y	G	G	P	E	G	F	R	K	L	V	D	E	A	H	K	K	G	L	G	V	I	L	D	V	V	Y	N	H	V	G	P	E	G	N	Y	M	V	K	L	G	P	Y	F	S	Q	K
Template Known Secondary structure			T										B			S	S	S				S	T	T				T	T		B		S	T	T																T	T										S				S	S	S							S			S		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		131	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210
		270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		C	H	N	P	E	S	P	W	R	D	W	Y	S	F	S	D	D	G	T	A	L	D	W	L	G	Y	A	S	L	P	K	L	D	Y	Q	S	E	S	L	V	N	E	I	Y	R	G	E	D	S	I	V	R	H	W	L	K	A	P	W	N	M	D	G	W	R	L	D	V	V	H	M	L	G	E	A	G	G	A	R	N
Query Conservation
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.								.
Template Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.								.
Template Sequence		Y	K	T	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	G	L	T	F	N	F	D	D	A	E	S	D	E	V	R	K	F	I	L	E	N	.	.	.	.	V	E	Y	W	I	K	E	.	Y	N	V	D	G	F	R	L	D	A	V	H	A	I	I	D	T	S	P	K	H	I
Template Known Secondary structure					S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S					S	S	S	T	T												.	.	.	.								.	S								T	T	G	G	G					S	S	S
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.								.
Template SS confidence
		211	.	.	.																					.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.					.	.	.	240	.	.	.		.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.
		350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.					.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																			.	.	.	.
Query SS confidence																																																			.	.	.	.
Query Sequence		N	M	Q	H	V	A	G	I	T	E	A	A	K	E	T	Q	P	E	A	Y	I	V	G	E	H	F	G	D	A	R	Q	W	L	Q	A	D	V	E	D	A	A	M	N	Y	R	G	F	T	F	.	.	.	.	P	L	W	G	F	L	A	N	T	D	I	S	Y	D	P	Q	Q	I	D	A	Q	T	C	M	A	W	M
Query Conservation																																																			.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.
Template Conservation												.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	E	E	I	A	D	V	V	H	K	.	.	.	.	.	.	Y	N	R	I	V	I	A	E	S	D	L	N	D	P	R	V	V	N	P	K	E	K	C	G	Y	N	I	D	A	Q	W	V	D	D	F	H	H	S	I	H	A	Y	L	T	G	E	R	Q	G	Y	Y	T	D	F	G	N	L	D	D	I	V	K	S	Y
Template Known Secondary structure												.	.	.	.	.	.	T	T									S			T	T	T	T	S		G	G	G	T					S																S				S	G	G	G	G	G			S
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		266	.	.	.	270	.	.	.	.	.							.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		426	.	.	.	430	.																.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.						.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.
Query SS confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.
Query Sequence		D	N	Y	R	A	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	S	H	Q	Q	Q	L	R	M	F	N	Q	L	D	S	H	D	T	A	R	F	K	T	.	.	.	.	.	L	L	G	R	D	I	A	R	L	P	L	A	V	V	W	L	F	T	W	P	G	V	P	C	I	Y	Y	G	D	E	V
Query Conservation								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	D	V	F	V	Y	D	G	K	Y	S	N	F	R	R	K	T	H	G	E	P	V	G	E	L	D	G	C	N	F	V	V	Y	I	Q	N	H	D	Q	V	G	N	R	G	K	G	E	R	I	I	K	L	V	D	R	E	S	Y	K	I	A	A	A	L	Y	L	L	S	P	Y	I	P	M	I	F	M	G	E	E	Y
Template Known Secondary structure			S	S		S		S	S				T	T	T	T									S			G	G	G					S								T	T	T	T				G	G	G	G	S														S	S	S	S						S	S	G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		486	.	.	.																					490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.										.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	L	D	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	N	D	P	F	C	R	K	P	F	P	W	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	E	K	Q	D	T	A	L	F	A	L	Y	Q	R	M	I	A	L	R	K	K	S	Q	A
Query Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	E	E	N	P	F	Y	F	F	S	D	F	S	D	S	K	L	I	Q	G	V	R	E	G	R	K	K	E	N	G	Q	D	T	D	P	Q	D	E	S	T	F	N	A	S	K	L	S	W	K	I	D	E	E	I	F	S	F	Y	K	I	L	I	K	M	R	K	E	L	S	I
Template Known Secondary structure		T													S	T	T													T				S		T	T	S						T	T	S																								T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.