Job Description P21517 Confidence 96.86% Date Thu Jan 5 11:38:27 GMT 2012 Rank 186 Aligned Residues 369 % Identity 12% Template c3ogrA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:beta-galactosidase; PDBTitle: complex structure of beta-galactosidase from trichoderma reesei with2 galactose Resolution 1.50 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		184	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.				.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260
Predicted Secondary structure																																								.	.	.
Query SS confidence																																								.	.	.
Query Sequence		E	K	L	P	Y	L	K	K	L	G	V	T	A	L	Y	L	N	P	V	F	K	A	P	S	V	H	K	Y	D	T	E	D	Y	R	H	V	D	P	.	.	.	Q	F	G	G	D	G	A	L	L	R	L	R	H	N	T	Q	Q	L	G	M	R	L	V	L	D	G	V	F	N	H	S	G	D	S	H	A	W	F	D
Query Conservation																																								.	.	.
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.																																			.	.	.	.	.
Template Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	V	F	H	K	I	K	A	L	G	F	N	T	V	S	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	V	D	W	A	L	L	E	G	K	P	G	R	F	R	A	D	G	I	F	S	L	E	P	F	F	E	A	A	T	K	A	G	I	Y	L	L	A	R	P	G	P	Y	I	N	A	E	V	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure										T	T							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									S	B	T	T	B					G	G	G		S											T									S				T	T	B	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.												.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.
		261	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.					330	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																							.	.	.	.
Query SS confidence																																																																							.	.	.	.
Query Sequence		R	H	N	R	G	T	G	G	A	C	H	N	P	E	S	P	W	R	D	W	Y	S	F	S	D	D	G	T	A	L	D	W	L	G	Y	A	S	L	P	K	L	D	Y	Q	S	E	S	L	V	N	E	I	Y	R	G	E	D	S	I	V	R	H	W	L	K	A	P	W	N	.	.	.	.	M	D	G	W	R	L	D
Query Conservation																																																																							.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.																															.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	G	G	G	F	P	G	W	L	Q	R	V	K	G	.	K	L	R	T	D	A	P	D	Y	L	H	A	T	D	N	Y	V	A	H	I	A	S	I	I	A	K	A	Q	I	T	N	G	G	P	V	I	L	Y	Q	P	E
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G	G			G	G	G	G	G			S	.		T	T	S																							T	B	G	G	G	T	S	S							S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.
Template SS confidence
																										144	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.		.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.
		337	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	V	H	M	L	G	E	A	G	G	A	R	N	N	M	Q	H	V	A	G	I	T	E	A	A	K	E	T	Q	P	E	A	Y	I	V	G	E	H	F	G	D	A	R	Q	W	L	Q	A	D	V	E	D	A	A	M	N	Y	R	G	F	T	F	P	L	W	G	F	L	A	N	T	D	I	S	Y	D	P	Q	Q	I
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		N	E	Y	S	G	A	A	E	G	V	L	F	P	N	K	P	Y	M	Q	Y	V	I	D	Q	A	R	N	A	G	I	I	V	P	L	I	N	N	D	A	F	P	G	G	T	G	A	P	G	T	G	L	G	S	V	D	I	Y	G	H	D	G	Y	P	L	G	F	D	C	A	H	P	S	A	W	P	D	N	G	L	P
Template Known Secondary structure		S					B		T	T	S		S	S															T	T			S		B	B			B	S	S	S			T	T		T	T	S		T	T			S	B							T	T		S			S		T	T				T	T		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		199	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.
			417	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.			.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.
Predicted Secondary structure		.																																																								.	.
Query SS confidence		.																																																								.	.
Query Sequence		.	D	A	Q	T	C	M	A	W	M	D	N	Y	R	A	G	L	S	H	Q	Q	Q	L	R	M	F	N	Q	L	D	S	H	D	T	A	R	F	K	T	L	L	G	R	D	I	A	R	L	P	L	A	V	V	W	L	F	.	.	T	W	P	G	V	P	C	I	Y	Y	G	D	E	V	G	L	D	G	K	N	D	P
Query Conservation		.																																																								.	.
Alig confidence		.																																																								.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	T	W	R	Q	D	H	L	N	I	S	P	S	T	P	F	S	L	V	E	F	Q	G	G	A	F	D	P	F	G	G	W	G	F	E	Q	C	S	A	L	V	N	H	E	F	E	R	V	F	Y	K	N	N	M	A	A	G	V	T	I	F	N	I	Y	M	T	F	G	G	T	N	W	G	N	L	G	H	P	G	G
Template Known Secondary structure													T	T	S									S	S					T	T	S										S	S														T	T		S											B			T	T		B		T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		279	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.
		494	.	.	.	.	.			500	.	.	.	.	.	.	.	.		.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.						.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure								.	.										.																					.	.	.	.	.
Query SS confidence								.	.										.																					.	.	.	.	.
Query Sequence		F	C	R	K	P	F	.	.	P	W	Q	V	E	K	Q	D	T	.	A	L	F	A	L	Y	Q	R	M	I	A	L	R	K	K	S	Q	A	L	R	.	.	.	.	.	H	G	G	C	Q	V	L	Y	A	E	D	N	V	V	V	F	V	R	V	L	N	Q	Q	R	V	L	V	A	I	N	R	G	E	A	C	E	V
Query Conservation								.	.										.																					.	.	.	.	.
Alig confidence								.	.										.																					.	.	.	.	.																																					.
Template Conservation																																																																																	.
Template Sequence		Y	T	S	Y	D	Y	G	A	S	I	R	E	D	R	R	I	D	R	E	K	Y	S	E	L	K	L	Q	G	Q	F	L	K	V	S	P	G	Y	I	T	A	T	P	E	N	A	T	Q	G	V	Y	S	D	S	Q	N	I	V	I	T	P	L	L	A	K	E	S	G	D	F	F	V	V	R	H	A	N	Y	S	S	.
Template Known Secondary structure			S	B			T	T		S	B		T	T					S															T		T					S						B	S	S	S	S	S	S		S	S									S	S	S									S	S	T	T		.
Template Predicted Secondary structure																																																																																	.
Template SS confidence
		359	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.
		566	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	L	P	A	S	P	F	L	N	A	V	Q	W	Q	C	K	E	G	H	G	Q	L	T	D	G	I	L	A	L	P	A	I	S	A	T	V	W	M	N
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	D	T	A	S	Y	T	V	K	L	P	T	S	A	G	D	L	T	I	P	Q	L	G	G	S	L	T	L	T
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S											T	T							T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
												438	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.