Job Description P21517 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:38:27 GMT 2012 Rank 18 Aligned Residues 511 % Identity 16% Template c3k1dA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:1,4-alpha-glucan-branching enzyme; PDBTitle: crystal structure of glycogen branching enzyme synonym: 1,4-alpha-d-2 glucan:1,4-alpha-d-glucan 6-glucosyl-transferase from mycobacterium3 tuberculosis h37rv Resolution 2.33 Å

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		18	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	Q	L	L	I	T	L	W	L	T	G	E	D	P	P	Q	R	I	M	L	R	T	E	H	D	N	E	E	M	S	V	P	M	H	K	Q	R	S	Q	P	Q	P	G	V	T	A	W	R	A	A	I	D	L	S	S	G	Q	P	R	R	R	Y	S	F	K	L	L	W	H	D	R	Q	R	W	F	T	P	Q	G	F
Query Conservation
Alig confidence																					.	.																.	.	.	.	.
Template Conservation																					.	.																.	.	.	.	.
Template Sequence		S	G	V	S	F	A	V	W	A	P	N	A	K	G	V	S	L	I	G	.	.	E	F	N	G	W	N	G	H	E	A	P	M	R	V	L	.	.	.	.	.	G	P	S	G	V	W	E	L	F	W	P	D	F	P	C	D	G	L	Y	K	F	R	V	H	G	A	D	G	V	V	T	D	R	A	D	P	F	A	F
Template Known Secondary structure											T	T		S							.	.	G	G	G	T	T				S		B					.	.	.	.	.	G	G	G									T			T	T										T	T	S								T	T		S
Template Predicted Secondary structure																					.	.																.	.	.	.	.
Template SS confidence
		145	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.			.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.						.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.
		98	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.													.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	R	M	P	P	A	R	L	E	Q	F	A	V	D	V	P	D	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	P	Q	W	A	A	D	Q	I	F	Y	Q	I	F	P	D	R	F	A	R	S	L	P	R	E	A	E	Q	D	H	V	Y	Y	H	H	A	A	G	Q	E	I	I	L	R	D	W	D	E	P	V
Query Conservation																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	T	E	V	P	P	Q	T	A	S	R	V	T	S	S	D	Y	T	W	G	D	D	D	W	M	A	G	R	A	L	R	N	P	V	N	E	A	M	S	T	Y	E	V	H	L	G	S	W	R	P	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S	B			T	T														S									T	T			G	G	G	S									T	T	T	S	S	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		218	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.
		166	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.		.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.			.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.
Predicted Secondary structure																							.																							.	.
Query SS confidence																							.																							.	.
Query Sequence		T	A	Q	A	G	G	S	T	F	Y	G	G	D	L	D	G	I	S	E	K	L	.	P	Y	L	K	K	L	G	V	T	A	L	Y	L	N	P	V	F	K	A	P	S	V	.	.	H	K	Y	D	T	E	D	Y	R	H	V	D	P	Q	F	G	G	D	G	A	L	L	R	L	R	H	N	T	Q	Q	L	G	M	R
Query Conservation																							.																							.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.																							.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	S	Y	R	Q	L	A	R	E	L	T	D	Y	I	V	D	Q	G	F	T	H	V	E	L	L	P	V	A	E	H	P	F	A	G	S	W	G	Y	Q	V	T	S	Y	Y	A	P	T	S	R	F	G	T	P	D	D	F	R	A	L	V	D	A	L	H	Q	A	G	I	G
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		T		S					S						S		G	G	G	T	T		S		S							G	G	G																T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
													269	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.
		243	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	V	L	D	G	V	F	N	H	S	G	D	S	H	A	W	F	D	R	H	N	R	G	T	G	G	A	C	H	N	P	E	S	P	W	R	D	W	Y	S	F	S	D	D	G	T	A	L	D	W	L	G	Y	A	S	L	P	K	L	D	Y	Q	S	E	S	L	V	N	E	I	Y	R	G	E	D	S	I	V	R	H
Query Conservation
Alig confidence																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.
Template Conservation																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.
Template Sequence		V	I	V	D	W	V	P	A	H	F	P	K	D	A	W	A	L	G	R	F	D	G	T	P	L	Y	E	H	S	D	P	K	R	G	E	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	D	W	G	T	Y	V	F	D	F	G	R	P	E	V	R	N	F	L	V	A	N	.	.	.	.	A	L	Y
Template Known Secondary structure								T	T						T	T	T	T	T	T	T	T	S	S			S	B						S	S	S	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T							B		T	T	S											.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.
Template SS confidence
		338	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.																.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.					.	.	.
		323	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		W	L	K	A	P	W	N	M	D	G	W	R	L	D	V	V	H	M	L	G	E	A	G	G	A	R	N	N	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	H	V	A	G	I	T	E	A	A	K	E	T	Q	P	E	A	Y	I	V	G	E	H	F	G	D	A	R	Q	W	L	Q	A	D	V
Query Conservation																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation						.
Template Sequence		W	L	Q	E	.	F	H	I	D	G	L	R	V	D	A	V	A	S	M	L	Y	L	D	Y	S	R	P	E	G	G	W	T	P	N	V	H	G	G	R	E	N	L	E	A	V	Q	F	L	Q	E	M	N	A	T	A	H	K	V	A	P	G	I	V	T	I	A	E	E	S	T	P	W	S	G	V	T	R	P	T	N
Template Known Secondary structure						.	S										T					B							S	S			S				S	S		S	B																			S	T	T									S	S				T	T	S		G	G
Template Predicted Secondary structure						.
Template SS confidence
		399	400	.	.		.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.
		387	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.										450	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	D	A	A	M	N	Y	R	G	F	T	F	P	L	W	G	F	L	A	N	T	D	I	S	Y	D	P	Q	Q	I	D	A	Q	T	C	M	A	W	M	D	N	Y	R	A	G	L	S	H	Q	Q	Q	L	R	M	F	N	Q	L	D	S	H	D	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	R	F	K	T	L	L	G
Query Conservation																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																			.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																			.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	G	G	L	G	F	S	M	K	W	N	M	G	W	M	H	D	T	L	D	Y	V	S	R	D	P	V	Y	R	S	Y	H	H	.	.	.	.	.	.	.	H	E	M	T	F	S	M	L	Y	A	F	S	E	N	Y	V	L	P	L	S	H	D	E	V	V	H	G	K	G	T	L	W	G	R	M	P	G	N	N	H
Template Known Secondary structure		G	T					S																	S		G	G	G	G	G	G	G		.	.	.	.	.	.	.					G	G	G	G	T	T	T	S	S								G	G	G	S	S	T	T	S							S		S	S
Template Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		478	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510								.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550
		458	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.		.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.
Predicted Secondary structure																																								.																																					.	.	.	.	.
Query SS confidence																																								.																																					.	.	.	.	.
Query Sequence		R	D	I	A	R	L	P	L	A	V	V	W	L	F	T	W	P	G	V	P	C	I	Y	Y	G	D	E	V	G	L	D	G	K	N	D	P	F	C	.	R	K	P	F	P	W	Q	V	E	K	Q	D	T	A	L	F	A	L	Y	Q	R	M	I	A	L	R	K	K	S	Q	A	L	R	H	G	G	.	.	.	.	.
Query Conservation																																								.																																					.	.	.	.	.
Alig confidence																																								.																																					.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	K	A	A	G	L	R	S	L	L	A	Y	Q	W	A	H	P	G	K	Q	L	L	F	M	G	Q	E	F	G	Q	R	A	E	W	S	E	Q	R	G	L	D	W	F	Q	L	D	E	N	G	F	S	N	G	I	Q	R	L	V	R	D	I	N	D	I	Y	R	C	H	P	A	L	W	S	L	D	T	T	P	E	G
Template Known Secondary structure																	S	S	S						T	T	G	G	G	T			S				T	T	T				G	G	G	G	G	S	S	S	S																			G	G	G	T	T	T	T	T	S	G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		551	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630
					532	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.		.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.					.	.	.	.		.	570	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	580	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.																		.																	.	.	.	.					.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.																		.																	.	.	.	.					.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	C	Q	V	L	Y	A	E	D	N	V	V	V	F	V	R	V	L	.	N	Q	Q	R	V	L	V	A	I	N	R	G	E	A	C	E	.	.	.	.	V	V	L	P	.	A	S	P	F	L	N	A	V	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	Q	C	K	E	G	H
Query Conservation		.	.	.																		.																	.	.	.	.					.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.																		.																	.	.	.	.					.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	S	W	I	D	A	N	D	S	A	N	N	V	L	S	F	M	R	Y	G	S	D	G	S	V	L	A	C	V	F	N	F	A	G	A	E	H	R	D	Y	R	L	G	L	P	R	A	G	R	W	R	E	V	L	N	T	D	A	T	I	Y	H	G	S	G	I	G	N	L	G	G	V	D	A	T	D	D	P	W	H
Template Known Secondary structure										T	T	T	T									T	T	S										S	S	S										S	S										T	T		G	G	G	T	S				S		T	T						S			B	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		631	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710
		585	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	Q	L	T	D	G	I	L	A	L	P	A	I	S	A	T	V	W
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		G	R	P	A	S	A	V	L	V	L	P	P	T	S	A	L	W	L
Template Known Secondary structure		T	B	S									T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		711	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.