Job Description P21517 Confidence 96.33% Date Thu Jan 5 11:38:27 GMT 2012 Rank 204 Aligned Residues 345 % Identity 10% Template c3icgD_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: D: PDB Molecule:endoglucanase d; PDBTitle: crystal structure of the catalytic and carbohydrate binding domain of2 endoglucanase d from clostridium cellulovorans Resolution 2.10 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		184	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	K	L	P	Y	L	K	K	L	G	V	T	A	L	Y	L	N	P	V	F	K	A	P	S	V	H	K	Y	D	T	E	D	Y	R	H	V	D	P	Q	F	G	G	D	G	A	L	L	R	L	R	H	N	T	Q	Q	L	G	M	R	L	V	L	D	G	V	F	N	H	S	G	D	S	H	A	W	F	D	R	H	N
Query Conservation
Alig confidence																			.	.	.	.																				.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																			.	.	.	.																				.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	M	I	N	K	I	K	E	A	G	F	N	T	L	R	L	P	.	.	.	.	V	T	W	D	G	H	M	G	A	A	P	E	Y	T	I	D	Q	T	W	.	.	M	K	R	V	E	E	I	A	N	Y	A	F	D	N	D	M	Y	V	I	I	N	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure											T								.	.	.	.				T	T	S	B			T	T	T			B					.	.													T	T	T								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.																				.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		49	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.					.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.			.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.
		264	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	G	T	G	G	A	C	H	N	P	E	S	P	W	R	D	W	Y	S	F	S	D	D	G	T	A	L	D	W	L	G	Y	A	S	L	P	K	L	D	Y	Q	S	E	S	L	V	N	E	I	Y	R	G	E	D	S	I	V	R	H	W	L	K	A	P	W	N	M	D	G	W	R	L	D	V	V	H	M	L	G	E
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	H	E	N	E	W	L	K	P	F	Y	A	N	E	A	Q	V	K	A	Q	L	T	K	V	W	T	Q	I	A	N	N	F	K	K	Y	.	G	D	H	L	I	F	E	T	M	N	E	P	R	P	V	G
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S		T	T	T				S																						T	T	T		.		T	T					S		S	S				S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.
Template SS confidence
																														107	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.		.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.
		344	.	.	.													.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.							.	.	.	.	400	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	G	G	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	N	N	M	Q	H	V	A	G	I	T	E	A	A	K	E	T	Q	P	E	A	Y	I	V	G	E	H	F	G	D	A	R	Q	W	L	Q	A	D	V	E	D	A	A	M	N	Y	R	G	.	.	.	.	.	.	F	T	F	P	L	W	G	F	L	A
Query Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	S	L	Q	W	T	G	G	S	Y	E	N	R	E	V	V	N	R	Y	N	L	T	A	V	N	A	I	R	A	T	G	G	N	N	A	T	R	Y	I	M	V	P	T	L	A	A	S	A	M	S	T	T	I	N	D	L	V	I	P	N	N	D	S	K	V	I	V	S	L	H	M	Y	S	P	Y	F	F	A	M	D
Template Known Secondary structure		G	G	G	T	T	S																								T		G	G	G	G	T	S							G	G	G			S										G	G	G		T	T										S					T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		158	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.
		406	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	T	D	I	S	Y	D	P	Q	Q	I	D	A	Q	T	C	M	A	W	M	D	N	Y	R	A	G	L	S	H	Q	Q	Q	L	R	M	F	N	Q	L	D	S	H	D	T	A	R	F	K	T	L	L	G	R	D	I	A	R	L	P	L	A	V	V	W	L	F	T	W	P	G	V	P	C	I	Y	Y	G	D	E	V
Query Conservation
Alig confidence																																																		.	.	.	.	.
Template Conservation																																																		.	.	.	.	.
Template Sequence		I	N	G	T	S	S	W	G	S	D	Y	D	K	S	S	L	D	S	E	F	D	A	V	Y	N	K	F	V	K	N	G	R	A	V	V	I	G	E	M	G	S	I	N	K	N	N	T	A	.	.	.	.	.	A	R	V	T	H	A	E	Y	Y	A	K	S	A	K	A	R	G	L	T	P	I	W	W	D	N	G	Y
Template Known Secondary structure		T	T	S		S				S																		T	G	G	G	T													S	S				.	.	.	.	.															T	T	T									S
Template Predicted Secondary structure																																																		.	.	.	.	.
Template SS confidence
		238	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.						.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.
		486	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	L	D	G	K	N	D	P	F	C	R	K	P	F	P	W	Q	V	E	K	Q	D	T	A	L	F	A	L	Y	Q	R	M	I	A	L	R	K	K	S	Q	A	L	R	H	G	G	C	Q	V	L	Y	A	E	D	N	V	V	V	F	V	R	V	L	N	Q	Q	R	V	L	V	A	I	N	R	G	E	A	C	E	V
Query Conservation
Alig confidence																										.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.
Template Conservation																										.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.
Template Sequence		S	V	A	G	K	A	E	T	F	G	I	F	N	R	S	N	L	T	W	D	A	P	E	V	.	.	.	.	M	K	A	F	I	K	G	I	G	G	S	S	S	A	V	E	V	T	Y	A	I	T	N	S	W	G	S	G	A	S	V	N	.	.	.	.	.	.	.	.	V	T	I	K	N	N	G	T	T	.	.	.
Template Known Secondary structure				T	T	S	T	T							T	T	T	T			S	S				.	.	.	.										B																S	S						.	.	.	.	.	.	.	.							S	S	S	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																										.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.
Template SS confidence
		313	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.					.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.									.	370	.	.	.	.	.	.	.
		566	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	L	P	A	S	P	F	L	N	A	V	Q	W	Q	C	K	E	G	H	G	Q	L	T	D	G	I	L	A	L	P	A	I	S	A	T	V
Query Conservation
Alig confidence		.	.
Template Conservation		.	.
Template Sequence		.	.	P	I	N	G	W	T	L	K	W	T	M	P	I	N	Q	T	I	T	N	M	W	S	A	S	F	V	A	S	G	T	T	L	S	V
Template Known Secondary structure		.	.				S									T	T								S							T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.
Template SS confidence
				410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low