Job Description P21517 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:38:27 GMT 2012 Rank 7 Aligned Residues 531 % Identity 21% Template c3faxA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:reticulocyte binding protein; PDBTitle: the crystal structure of gbs pullulanase sap in complex with2 maltotetraose Resolution 2.40 Å

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		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.			.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.		.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.				70	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.																				.																																	.	.	.
Query SS confidence																.	.																				.																																	.	.	.
Query Sequence		W	H	L	P	V	P	P	F	V	K	Q	S	K	D	.	.	Q	L	L	I	T	L	W	L	T	G	E	D	P	P	Q	R	I	M	L	.	R	T	E	H	D	N	E	E	M	S	V	P	M	H	K	Q	R	S	Q	P	Q	P	G	V	T	A	W	R	A	A	I	D	.	.	.	L	S	S	G	Q	P	R	R	R
Query Conservation																.	.																				.																																	.	.	.
Alig confidence																.	.																				.																.	.	.	.	.	.												.	.	.
Template Conservation																																																					.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	A	Y	S	G	N	L	G	A	V	L	N	Q	D	G	S	K	V	E	A	S	L	W	S	P	S	A	D	S	V	T	M	I	I	Y	D	K	D	N	Q	N	R	V	V	A	T	T	P	L	V	K	.	.	.	.	.	.	N	N	K	G	V	W	Q	T	I	L	D	T	K	L	G	I	K	N	Y	T	G	Y	Y
Template Known Secondary structure						S								T	T	S	S									T	T		S									T	T														.	.	.	.	.	.		T	T	S								G	G	G	T		S			T	T
Template Predicted Secondary structure																																																					.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		474	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.							.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.
		79	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.											.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120											.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	S	F	K	L	L	W	H	D	R	Q	R	W	F	T	P	Q	G	F	S	R	M	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	A	R	L	E	Q	F	A	V	D	V	P	D	I	G	P	Q	W	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	D	Q	I	F	Y	Q	I	F	P	D	R	F	A	R	S	L	P
Query Conservation																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	L	Y	E	I	K	R	G	D	K	V	K	I	L	D	P	Y	A	K	S	L	A	E	W	D	S	N	T	V	N	D	D	I	K	T	A	K	A	A	F	V	N	P	S	Q	L	G	P	Q	N	L	S	F	A	K	I	A	N	F	K	G	R	Q	D	A	V	I	Y	E	A	H	V	R	D	F	T	S	D	Q	S
Template Known Secondary structure																	T	T		S		B				B	G	G	G			S	S			S								G	G	G	S	S		T	T							T	T			S	G	G	G															G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		548	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.
		139	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	E	A	E	Q	D	H	V	Y	Y	H	H	A	A	G	Q	E	I	I	L	R	D	W	D	E	P	V	T	A	Q	A	G	G	S	T	F	Y	G	G	D	L	D	G	I	S	E	K	L	P	Y	L	K	K	L	G	V	T	A	L	Y	L	N	P	V	F	K	A	P	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	D	G	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	Q	L	G	T	F	A	A	F	S	E	K	L	D	Y	L	Q	K	L	G	V	T	H	I	Q	L	L	P	V	L	S	Y	F	Y	V	N	E	M	D	K	S	R	S	T	A
Template Known Secondary structure		G				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T	S							T								T		S					S			B		B	S	S		B	T	T							S
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		629	630	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.
										208	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.									.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	V	H	K	Y	D	T	E	D	Y	R	H	V	D	P	Q	F	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	D	G	A	L	L	R	L	R	H	N	T	Q	Q	L	G	M	R	L	V	L	D	G	V	F	N	H	S	G	D	S	H	A	W	F	D	R	H	N	R	G	T	G	G	A	C	H
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.																																									.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																												.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	T	S	S	D	N	N	Y	N	W	G	Y	D	P	Q	S	Y	F	A	L	S	G	M	Y	S	E	K	P	K	D	P	S	A	R	I	A	E	L	K	Q	L	I	H	D	I	H	K	R	G	M	G	V	I	L	D	V	V	Y	N	H	T	A	K	T	Y	L	F	E	D	I	E	P	N	Y	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure				S	S	S		S				S		S	B	S		S	S	S	B		G	G	G		S		T	T	S																		T	T										S			S		T					T	T	S	T	T	T	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																												.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.
		272	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	P	E	S	P	W	R	D	W	Y	S	F	S	D	D	G	T	A	L	D	W	L	G	Y	A	S	L	P	K	L	D	Y	Q	S	E	S	L	V	N	E	I	Y	R	G	E	D	S	I	V	R	H	W	L	K	A	P	W	N	M	D	G	W	R	L	D	V	V	H	M	L	G	E	A	G	G	A	R	N	N	M
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.																			.	.	.	.								.															.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.																			.	.	.	.								.															.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	Y	H	F	M	N	E	D	G	S	P	R	E	S	F	G	.	.	.	G	G	R	L	G	T	T	H	A	M	S	R	R	V	L	V	D	S	.	.	.	.	I	K	Y	L	T	S	E	.	F	K	V	D	G	F	R	F	D	M	M	G	D	H	.	.	.	.	.	.	.	.	D	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	S	B		B		T	T	S		B		B	S	S	S	.	.	.	S	B		B		T	T	S											.	.	.	.								.	S								T	T	G	G	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	B
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.																			.	.	.	.								.															.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
										754	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.				.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.					.	.	.	790	.	.	.		.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.									.	.
		352	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.								.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.							.	410	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																												.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	H	V	A	G	I	T	E	A	A	K	E	T	Q	P	E	A	Y	I	V	G	E	H	F	G	D	A	R	Q	W	L	Q	A	D	V	E	D	A	A	M	N	Y	.	.	.	.	.	.	.	R	G	F	T	F	P	L	W	G	F	L	A	N	T	D	.	.	.	.	.	.	I	S	Y	D	P	Q	Q	I	D	A
Query Conservation																																												.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																												.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	A	I	E	L	A	Y	K	E	A	K	A	I	N	P	N	M	I	M	I	G	E	G	W	R	T	F	Q	G	D	Q	G	K	P	V	K	P	A	D	Q	D	W	M	K	S	T	D	T	V	G	V	F	S	D	D	I	R	N	S	L	K	S	G	F	P	N	E	G	T	P	A	F	I	T	G	G	P	Q	S	L
Template Known Secondary structure																T	T									S					B	T	T	B				B	S	S	G	G	G	G	G	G		S	S																T	T	S	T	T				T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		419	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.													460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	T	C	M	A	W	M	D	N	Y	R	A	G	L	S	H	Q	Q	Q	L	R	M	F	N	Q	L	D	S	H	D	T	A	R	F	K	T	L	L	G	R	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	A	R	L	P	L	A	V	V	W	L	F	T	W	P	G	V	P	C	I	Y	Y	G	D	E	V	G
Query Conservation																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	G	I	F	K	N	I	K	A	Q	P	G	N	F	E	A	D	S	P	G	D	V	V	Q	Y	I	A	A	H	D	N	L	T	L	H	D	V	I	A	K	S	I	N	K	D	P	K	V	A	E	E	D	I	H	R	R	L	R	L	G	N	V	M	I	L	T	S	Q	G	T	A	F	I	H	S	G	Q	E	Y	G
Template Known Secondary structure									T	T			T	T	S			S	S	G	G	G					S			S	S	S	S											T			T	T	T	T																	T	S	S	S						T	T	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		487	.	.	490	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.							.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.
Query SS confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	D	G	K	N	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	F	C	R	K	P	F	P	W	Q	V	.	.	.	.	.	.	E	K	Q	D	T	A	L	F	A	L	Y	Q	R	M	I	A	L	R	K	K	S	Q
Query Conservation								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	T	K	R	L	L	N	P	D	Y	M	T	K	V	S	D	K	L	P	N	K	A	T	L	I	E	A	V	K	E	Y	P	Y	F	I	H	D	S	Y	D	S	S	D	A	I	N	H	F	D	W	A	A	A	T	D	N	N	K	H	P	I	S	T	K	T	Q	A	Y	T	A	G	L	I	T	L	R	R	S	T	D
Template Known Secondary structure					B				G	G	G	S	S								T	T					S	S			S	S					S		G	G	G																T	T	T																				T		T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		526	.	.	.	530	.	.	.	.	.																.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.
Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	L	R	H	G	G	C	Q	V	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	A	E	D	N	V	V	V	F	V	R	V	L	N	Q	Q	R	V	L	V	A	I	N	R	G	E	A	C	E	V	V	L	P	A	S	P	F	L	N	A	V	Q	W	Q	C	K	E	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	F	R	K	L	S	K	A	E	I	D	R	E	V	S	L	I	T	E	V	G	Q	G	D	I	K	E	K	D	L	V	I	A	Y	Q	T	I	D	S	G	D	I	Y	A	V	F	V	N	A	D	S	K	A	R	N	V	L	L	G	E	K	Y	K	H	L	L	K	G	Q	V	I	V	D	A	D	Q	A	G	I	K
Template Known Secondary structure		T	S	S														S	S		T	T	S	T	T			S			S																				S	S	S											G	G	G	G	G	S						S	S		B	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1051	.	.	.	.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1070	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1080	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1130
							583	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	G	H	G	Q	L	T	D	G	I	L	A	L	P	A	I	S	A	T	V	W
Query Conservation		.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	I	S	T	P	R	G	V	H	F	E	K	D	S	L	L	I	D	P	L	T	A	I	V	I
Template Known Secondary structure				S	S		S	S					S	S						T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1132	.	.	.	.	.	.	.	1140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1150	.	.	.	.	.	.