Job Description P21517 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:38:27 GMT 2012 Rank 6 Aligned Residues 542 % Identity 20% Template c3edeB_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:cyclomaltodextrinase; PDBTitle: structural base for cyclodextrin hydrolysis Resolution 1.71 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		18	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.						.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.
Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.
Query SS confidence																																					.	.	.	.	.
Query Sequence		D	Q	L	L	I	T	L	W	L	T	G	E	D	P	P	Q	R	I	M	L	R	T	E	H	D	N	E	E	M	S	V	P	M	H	K	.	.	.	.	.	Q	R	S	Q	P	Q	P	G	V	T	A	W	R	A	A	I	D	L	S	S	G	Q	P	R	R	R	Y	S	F	K	L	L	W	H	D	R	Q	R	W	F
Query Conservation																																					.	.	.	.	.
Alig confidence																																					.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	H	M	E	P	P	F	W	W	A	G	M	Q	H	K	G	L	Q	L	M	V	H	G	R	D	I	G	R	M	E	A	A	L	D	Y	P	G	V	R	L	V	S	P	T	R	V	P	N	A	N	Y	L	F	V	D	L	E	I	G	P	E	A	Q	P	G	S	F	D	I	V	F	K	G	D	G	R	S	E	R	Y
Template Known Secondary structure						S	S				T	T		S	S									S	T	T	G	G	G							B	T	T										S		T	T										T	T			S										T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		7	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.
		93	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	P	Q	G	F	S	R	M	P	P	A	R	L	E	Q	F	A	V	D	V	P	D	I	G	P	Q	W	A	A	D	Q	I	F	Y	Q	I	F	P	D	R	F	A	R	S	L	P	R	E	A	E	Q	D	H	V	Y	Y	H	H	A	A	G	Q	E	I	I	L	R	D	W	D	E	P	V	T	A	Q	A	G	G	S
Query Conservation
Alig confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	Y	R	L	L	A	R	E	Q	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	Q	R	Q	G	F	G	P	G	D	A	I	Y	Q	I	M	P	D	R	F	A	N	G	D	P	S	N	D	N	V	A	G	M	R	E	Q	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	R	R	H	G	G
Template Known Secondary structure										T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T						T	T														S		G	G	G	S	S		T	T		S				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T	S	T	T
Template Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		87	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.											.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	140
		173	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.					.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.
Query SS confidence																																				.	.	.	.
Query Sequence		T	F	Y	G	G	D	L	D	G	I	S	E	K	L	P	Y	L	K	K	L	G	V	T	A	L	Y	L	N	P	V	F	K	A	P	.	.	.	.	S	V	H	K	Y	D	T	E	D	Y	R	H	V	D	P	Q	F	G	G	D	G	A	L	L	R	L	R	H	N	T	Q	Q	L	G	M	R	L	V	L	D	G	V
Query Conservation																																				.	.	.	.
Alig confidence																																				.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	R	H	G	G	D	I	R	G	T	I	D	H	L	D	Y	I	A	G	L	G	F	T	Q	L	W	P	T	P	L	V	E	N	D	A	A	A	Y	S	Y	H	G	Y	A	A	T	D	H	Y	R	I	D	P	R	Y	G	S	N	E	D	F	V	R	L	S	T	E	A	R	K	R	G	M	G	L	I	Q	D	V	V
Template Known Secondary structure		S												T							T	T															S	S		G	G	G			S		S							T	T	T																T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		141	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220
		249	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.									.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320
Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	N	H	S	G	D	S	H	A	W	F	D	R	H	N	R	G	T	G	G	A	C	H	N	P	E	S	P	W	R	.	.	.	.	.	.	.	.	D	W	Y	S	F	S	D	D	G	T	A	L	D	W	L	G	Y	A	S	L	P	K	L	D	Y	Q	S	E	S	L	V	N	E	I	Y	R	G	E	D	S	I	V
Query Conservation																																.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.
Template Conservation																																																																													.	.	.	.
Template Sequence		L	S	H	I	G	K	H	H	W	W	M	K	D	L	P	T	P	D	W	I	N	Y	G	G	K	F	V	P	T	Q	H	H	R	V	A	V	Q	D	P	Y	A	A	Q	A	D	S	E	N	F	T	K	G	W	F	V	E	G	M	P	D	L	N	Q	T	N	P	L	V	A	N	Y	L	I	Q	N	.	.	.	.	N
Template Known Secondary structure			S	B			T	T		G	G	G	G	S		S	S	T	T	S	B	G	G	G	G	S			B					G	G	G	G	S		T	T												S	B	S	S	T	T	S		B	B		T	T	S											.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																													.	.	.	.
Template SS confidence
		221	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.					.
		321	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																												.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																												.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	H	W	L	K	A	P	W	N	M	D	G	W	R	L	D	V	V	H	M	L	G	E	A	G	G	A	R	N	N	M	Q	H	V	A	G	I	T	E	A	A	K	E	T	Q	P	E	A	Y	I	V	G	E	H	F	G	D	A	R	Q	W	L	Q	A	D	V	E	D	A	A	M	N	Y	R	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																												.	.	.	.	.	.
Alig confidence								.															.	.	.	.	.	.	.	.																																														.	.	.	.	.	.
Template Conservation								.															.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	W	W	I	E	Y	.	A	G	L	S	G	L	R	I	D	T	Y	G	Y	S	.	.	.	.	.	.	.	.	D	G	A	F	L	T	E	Y	T	R	R	L	M	A	E	Y	P	R	L	N	M	V	G	E	E	W	S	T	R	V	P	V	V	A	R	W	Q	R	G	K	A	N	F	D	G	Y	T	S	H	L	P
Template Known Secondary structure								.		T		S					S	S	G	G	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.																	T	T										S							T	T	S	T	T				T	T
Template Predicted Secondary structure								.															.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		297	.	.	300	.	.		.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.									.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.
			395	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.
Predicted Secondary structure		.
Query SS confidence		.
Query Sequence		.	G	F	T	F	P	L	W	G	F	L	A	N	T	D	I	S	Y	D	P	Q	Q	I	D	A	Q	T	C	M	A	W	M	D	N	Y	R	A	G	L	S	H	Q	Q	Q	L	R	M	F	N	Q	L	D	S	H	D	T	A	R	F	K	T	L	L	G	R	D	I	A	R	L	P	L	A	V	V	W	L	F	T	W
Query Conservation		.
Alig confidence		.																	.	.	.	.
Template Conservation																			.	.	.	.
Template Sequence		S	L	M	D	F	P	L	V	D	A	M	R	N	A	L	S	K	.	.	.	.	T	G	E	E	N	G	L	N	E	V	Y	E	T	L	S	L	D	Y	L	Y	P	E	P	Q	N	L	V	L	F	G	G	N	H	D	M	A	R	M	F	S	A	A	G	E	D	F	D	R	W	R	M	N	L	V	F	L	M	T	M
Template Known Secondary structure				B															.	.	.	.	T	T	S	S		T	T									G	G	G	G	S	S		G	G	G	S				S			T	T	S							T	T	T															S
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.
Template SS confidence
		368	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.					.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.
		474	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.					.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.														.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	G	V	P	C	I	Y	Y	G	D	E	V	G	L	.	.	.	.	D	G	K	N	D	P	F	C	R	K	P	F	P	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	V	E	K	Q	D	T	A	L	F	A	L	Y	Q	R	M	I	A	L	R	K	K	S	Q	A	L	R	H	G	G	C	Q	V	L	Y
Query Conservation																.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	R	I	P	Q	F	Y	S	G	D	E	I	L	M	T	S	T	V	K	G	R	D	D	A	S	Y	R	R	D	F	P	G	G	W	A	G	D	K	A	N	A	F	S	G	A	G	L	T	S	Q	Q	R	A	A	Q	D	L	V	R	K	L	A	N	W	R	K	N	Q	P	V	I	H	N	G	R	L	M	H	F	G
Template Known Secondary structure		S	S						T	T	G	G	G	T						S	S			G	G	G	G					T	T	S	S	T	T		S	S		T	T	T		T	T																					T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		444	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.
		537	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.				570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590		.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.
Predicted Secondary structure																																			.	.	.																						.
Query SS confidence																																			.	.	.																						.
Query Sequence		A	E	D	N	V	V	V	F	V	R	V	L	N	Q	Q	R	V	L	V	A	I	N	R	G	E	A	C	E	V	V	L	P	A	.	.	.	S	P	F	L	N	A	V	Q	W	Q	C	K	E	G	H	G	Q	L	T	D	G	.	I	L	A	L	P	A	I	S	A	T	V	W
Query Conservation																																			.	.	.																						.
Alig confidence																																			.	.	.																						.
Template Conservation
Template Sequence		P	E	E	N	T	W	V	Y	F	R	Y	N	K	D	K	R	I	M	V	A	M	N	N	N	D	K	P	M	T	L	P	T	A	R	F	Q	E	M	L	K	G	A	P	S	G	V	D	F	L	S	G	K	T	V	G	L	G	R	E	L	R	L	A	P	K	S	V	V	V	I
Template Known Secondary structure			B	T	T									S	S										S	S	S						G	G	G	G					T	T						B	T	T	T							S	S						T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		524	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.