Job Description P21517 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:38:27 GMT 2012 Rank 48 Aligned Residues 422 % Identity 23% Template c3czkA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:sucrose hydrolase; PDBTitle: crystal structure analysis of sucrose hydrolase(suh) e322q-2 sucrose complex Resolution 2.20 Å

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		115	.	.	.	.	120	.	.			.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.
Predicted Secondary structure										.	.
Query SS confidence										.	.
Query Sequence		I	G	P	Q	W	A	A	D	.	.	Q	I	F	Y	Q	I	F	P	D	R	F	A	R	S	L	P	R	E	A	E	Q	D	H	V	Y	Y	H	H	A	A	G	Q	E	I	I	L	R	D	W	D	E	P	V	T	A	Q	A	G	G	S	T	F	Y	G	G	D	L	D	G	I	S	E	K	L	P	Y	L	K	K	L
Query Conservation										.	.
Alig confidence										.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	H	A	G	W	F	G	Q	P	H	M	L	G	Y	S	A	Y	A	D	R	F	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	T	L	Q	G	V	A	E	R	V	P	Y	L	Q	E	L
Template Known Secondary structure		S		T	T	G	G	G	S	T	T													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S							T
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.																																											.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.
		193	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.				.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.	.																																																														.
Query SS confidence																	.	.	.																																																														.
Query Sequence		G	V	T	A	L	Y	L	N	P	V	F	K	A	P	S	.	.	.	V	H	K	Y	D	T	E	D	Y	R	H	V	D	P	Q	F	G	G	D	G	A	L	L	R	L	R	H	N	T	Q	Q	L	G	M	R	L	V	L	D	G	V	F	N	H	S	G	D	S	H	A	W	F	D	R	H	N	R	G	T	G	G	.
Query Conservation																	.	.	.																																																														.
Alig confidence																	.	.	.																																																														.
Template Conservation
Template Sequence		G	V	R	Y	L	H	L	L	P	F	L	R	A	R	A	G	D	N	D	G	G	F	A	V	S	D	Y	G	Q	V	E	P	S	L	G	S	N	D	D	L	V	A	L	T	S	R	L	R	E	A	G	I	S	L	C	A	D	F	V	L	N	H	T	A	D	D	H	A	W	A	Q	A	A	R	A	G	D	A	R	Y
Template Known Secondary structure		T		S												S	S			T	T	T	T	S									T	T	T																T	T										S				T	T	S								T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		119	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.
																						269	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	C	H	N	P	E	S	P	W	R	D	W	Y	S	F	S	D	D	G	T	A	L	D	W	L	G	Y	A	S	L	P	K	L	D	Y	Q	S	E	S	L	V	N	E	I	Y	R	G	E	D	S	I	V	R	H	W	L	K	A	P	W
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																.	.	.	.						.	.
Template Conservation																																																																					.	.	.	.						.	.
Template Sequence		L	D	Y	Y	H	H	F	A	D	R	T	V	P	D	R	Y	E	A	T	L	G	Q	V	F	P	H	T	A	P	G	N	F	T	W	V	D	D	T	A	Q	W	M	W	T	T	F	Y	P	Y	Q	W	D	L	N	W	S	N	P	A	V	F	G	D	M	A	L	A	.	.	.	.	M	L	R	L	A	.	.	N	L
Template Known Secondary structure			T	T	B				S	S	S													S	B	T	T	T	B			S					T	T	T	T						S	S	S	T	T				B		T	T	S											.	.	.	.						.	.		T
Template Predicted Secondary structure																																																																					.	.	.	.						.	.
Template SS confidence
		199	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.					.	.	.	.	270			.	.
		329	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.						350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.				.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400
Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.																																				.	.	.
Query SS confidence																							.	.	.	.	.																																				.	.	.
Query Sequence		N	M	D	G	W	R	L	D	V	V	H	M	L	G	E	A	G	G	A	R	N	.	.	.	.	.	N	M	Q	H	V	A	G	I	T	E	A	A	K	E	T	Q	P	E	A	Y	I	V	G	E	H	F	G	D	A	R	Q	W	L	Q	A	.	.	.	D	V	E	D	A	A	M	N	Y	R	G	F	T	F	P	L
Query Conservation																							.	.	.	.	.																																				.	.	.
Alig confidence																							.	.	.	.	.																																				.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	V	E	A	F	R	L	D	S	T	A	Y	L	W	K	R	I	G	T	D	C	M	N	Q	S	E	A	H	T	L	L	V	A	L	R	A	V	T	D	I	V	A	P	A	V	V	M	K	A	Q	A	I	V	P	M	T	Q	L	P	P	Y	F	G	S	G	V	D	E	G	H	E	C	H	L	A	Y	H	S	T	L
Template Known Secondary structure		T							T	T	T	T	S	S				T	T	S		S	S	S																				T	T											G	G	G	S	G	G	G	G			G	G	G	T	T	S	S		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		273	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.
		401	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		W	G	F	L	A	N	T	D	I	S	Y	D	P	Q	Q	I	D	A	Q	T	C	M	A	W	M	D	N	Y	R	A	G	L	S	H	Q	Q	Q	L	R	M	F	N	Q	L	D	S	H	D	T	A	R	F	K	T	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		M	A	A	G	W	S	A	L	A	L	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	R	G	D	I	L	H	N	V	I	A	H	S	P	P	L	P	R	H	C	A	W	L	S	Y	V	R	C	H	D	D	I	G	W	N	V	L	Q	H	E	A	C	G	N	A	A	Q	P	P	F	S	L	R	D	V	A	R	F	Y	A	N	A
Template Known Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	T		T									T	S					T	T							S			S	S				G	G	G	G					T			S	S	S														T
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		353	.	.	.	.	.	.	360	.	.									.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.
																																								456	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	G	R	D	I	A	R	L	P	L	A	V	V	W	L	F	T	W	P	G	V	P	C	I	Y	Y	G	D	E	V	G	L	D	G	K	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	P	G	S	Y	A	R	G	E	S	F	Q	G	V	H	G	T	N	G	M	A	A	A	L	A	G	I	Q	A	A	Q	E	A	G	D	A	A	A	L	A	V	A	V	D	R	L	V	L	L	Y	A	I	A	L	A	M	P	G	V	P	L	I	Y	M	G	D	E	L	A	M	V	N	D	P	G	Y	R	D	D	P
Template Known Secondary structure		S	T	T																						T	T							T	T																						S	S							T	T	G	G	G	T					G	G	G	G	G		T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		425	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.
							491	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.								510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540			.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.																																.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.																																.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	N	D	P	F	C	R	K	P	F	P	W	Q	V	E	K	Q	D	T	A	.	.	.	.	.	.	.	L	F	A	L	Y	Q	R	M	I	A	L	R	K	K	S	Q	A	L	R	H	G	G	C	Q	V	L	Y	A	E	D	N	.	.	V	V	V	F	V	R	V	L	N	Q	Q	R	V	L	V	A
Query Conservation		.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.																																.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.																																.	.							.	.	.
Template Conservation																																																																								.	.	.
Template Sequence		H	R	Q	H	E	G	R	W	L	H	R	P	A	M	D	W	Q	L	A	A	Q	R	H	D	A	K	S	L	S	G	T	V	Y	R	R	L	R	G	L	I	R	Q	R	A	A	L	G	A	L	A	A	D	Q	A	L	A	S	I	A	L	N	D	P	R	V	F	A	L	T	R	.	.	.	G	D	S	F	I	A	L
Template Known Secondary structure		T	T	T	T		G	G	G	G	G											T	T	S		T	T	S																		T		G	G	G	S	T	T	S								S		T	T							.	.	.	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																								.	.	.
Template SS confidence
		509	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.				.	580	.	.	.	.	.
		557	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	N	R	G	E	A	C	E	V	V	L	P	A	S	P	F	L	N	A	V	Q	W	Q	C	K	E	G	H	G	Q	L	T	D	G	I	L	A	L	P	A	I	S	A	T	V	W	M
Query Conservation
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.																	.
Template Conservation																						.	.	.	.	.	.	.																	.
Template Sequence		H	N	F	S	D	Q	L	L	D	V	E	L	A	A	I	G	V	D	G	W	.	.	.	.	.	.	.	T	L	L	R	G	D	G	S	I	V	L	P	P	Y	G	V	.	R	W	L
Template Known Secondary structure					S	S	S						G	G	G	T	T					.	.	.	.	.	.	.							S						T	T			.
Template Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.																	.
Template SS confidence
		586	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.								.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.		.	.	.