Job Description P21517 Confidence 98.74% Date Thu Jan 5 11:38:27 GMT 2012 Rank 117 Aligned Residues 338 % Identity 14% Template c3a5vA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:alpha-galactosidase; PDBTitle: crystal structure of alpha-galactosidase i from mortierella vinacea Resolution 2.00 Å

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		178	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.						.	.	.	.	.	.	.	.						200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.									.	.	.	.	.
Query SS confidence																.	.	.	.	.									.	.	.	.	.
Query Sequence		D	L	D	G	I	S	E	K	L	P	Y	L	K	K	.	.	.	.	.	L	G	V	T	A	L	Y	L	.	.	.	.	.	N	P	V	F	K	A	P	S	V	H	K	Y	D	T	E	D	Y	R	H	V	D	P	Q	F	G	G	D	G	A	L	L	R	L	R	H	N	T	Q	Q	L	G	M	R	L	V	L	D	G
Query Conservation																.	.	.	.	.									.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.									.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	E	Q	L	I	L	D	A	A	K	A	I	A	S	S	G	L	K	D	L	G	Y	N	Y	V	I	I	D	D	C	W	Q	K	N	E	R	E	S	S	K	T	L	L	A	D	P	T	K	F	P	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	I	K	P	L	V	D	D	I	H	N	L	G	L	K	A	G	I	Y	S
Template Known Secondary structure																	T					T								S	S		B		S	S			T	T	S				B		T	T	T		T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.												T	T
Template Predicted Secondary structure																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		24	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.										.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.
		248	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	F	N	H	S	G	D	S	H	A	W	F	D	R	H	N	R	G	T	G	G	A	C	H	N	P	E	S	P	W	R	D	W	Y	S	F	S	D	D	G	T	A	L	D	W	L	G	Y	A	S	L	P	K	L	D	Y	Q	S	E	S	L	V	N	E	I	Y	R	G	E	D	S	I	V	R	H	W	L	K	A	P
Query Conservation
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.
Template Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	A	G	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	T	C	G	G	H	I	A	S	L	G	Y	E	D	I	D	A	K	T	W	A	.	.	.	.	.	.	K
Template Known Secondary structure			S	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B		T	T	S		B			T	T											.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		95	.	.	.																																																	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.							120
		328	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	N	M	D	G	W	R	L	D	V	V	H	M	L	G	E	A	G	G	A	R	N	N	M	Q	H	V	A	G	I	T	E	A	A	K	E	T	Q	P	E	A	Y	I	V	G	E	H	F	G	D	A	R	Q	W	L	Q	A	D	V	E	D	A	A	M	N	Y	R	G	F	T	F	P	L	W	G	F	L	A	N	T
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		W	G	I	D	Y	L	K	Y	D	N	C	Y	N	Q	G	Q	S	G	T	P	K	L	S	Y	D	R	Y	K	A	M	G	N	A	L	N	K	T	G	R	P	M	L	Y	S	L	C	N	W	G	E	D	G	P	W	N	F	A	S	T	I	S	N	S	W	R	I	S	G	D	V	Y	D	N	F	N	R	P	D	P	A
Template Known Secondary structure			T									T	T		T	T			S	S																		T		S								S	T	T	T	T						S	T	T	T		S					S	S		B		S		S	S				T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		121	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200
		408	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	I	S	Y	D	P	Q	Q	I	D	A	Q	T	C	M	A	W	M	D	N	Y	R	A	G	L	S	H	Q	Q	Q	L	R	M	F	N	Q	L	D	S	H	D	T	A	R	F	K	T	L	L	G	R	D	I	A	R	L	P	L	A	V	V	W	L	F	T	W	P	G	V	P	C	I	Y	Y	G	D	E	V	G	L
Query Conservation
Alig confidence																																																																		.	.	.										.	.	.	.
Template Conservation																																																																		.	.	.										.	.	.	.
Template Sequence		C	P	C	T	T	Y	D	C	V	L	A	G	F	R	C	S	V	M	N	I	I	N	K	A	V	A	V	S	Q	K	A	R	S	G	G	W	N	D	L	D	M	L	E	V	G	N	G	G	M	N	Q	E	E	Y	R	V	H	Y	T	I	W	A	A	L	.	.	.	K	S	P	L	I	L	G	N	D	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S				S	S			S				S		B													G	G	G		B	T	T	B							B		T	T	S	S	S	S															T	.	.	.	T							S		.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																		.	.	.										.	.	.	.
Template SS confidence
		201	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.				.	.	.	.	.	270	.	.	.
		488	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.			.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																													.	.
Query SS confidence																													.	.
Query Sequence		D	G	K	N	D	P	F	C	R	K	P	F	P	W	Q	V	E	K	Q	D	T	A	L	F	A	L	Y	.	.	Q	R	M	I	A	L	R	K	K	S	Q	A	L	R	H	G	G	C	Q	V	L	Y	A	E	D	N	V	V	V	F	V	R	V	L	N	Q	Q	R	V	L	V	A	I	N	R	G	E	A	C	E	V
Query Conservation																													.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.										.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	T	N	I	T	N	T	T	K	E	I	I	M	N	K	E	V	I	A	V	N	Q	D	.	.	S	S	F	S	P	A	N	R	I	W	V	K	G	D	Q	Q	L	F	S	G	N	L	A	N	N	T	Q	V	V	I	L	L	N	A	G	D	S	A	A	K
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	S																			T		.	.	T	T											T	T									T	T	T										S	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.
Template SS confidence
																	274	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.			.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.
																566	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590		.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	L	P	A	S	P	F	L	N	A	V	Q	W	Q	C	K	E	G	H	G	Q	L	T	D	G	.	I	L	A	L	P	A	I	S	A	T	V	W
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.
Template Conservation
Template Sequence		M	T	A	T	W	D	D	I	W	V	Y	N	L	P	N	V	D	S	S	R	S	I	E	V	R	D	L	W	K	Q	K	S	L	G	N	F	S	N	H	I	T	L	D	V	P	A	H	G	V	R	L	L
Template Known Secondary structure										T	G	G	G	T	T	S	B		T	T								T	T	T	T								S								T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		337	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.