Job Description P21517 Confidence 96.05% Date Thu Jan 5 11:38:27 GMT 2012 Rank 213 Aligned Residues 337 % Identity 14% Template c3a23A_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:putative secreted alpha-galactosidase; PDBTitle: crystal structure of beta-l-arabinopyranosidase complexed with d-2 galactose Resolution 1.90 Å

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		178	.	180	.	.	.	.	.	.			.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.	.
Query SS confidence											.	.
Query Sequence		D	L	D	G	I	S	E	K	L	.	.	P	Y	L	K	K	L	G	V	T	A	L	Y	L	N	P	V	F	K	A	P	S	V	H	K	Y	D	T	E	D	Y	R	H	V	D	P	Q	F	G	G	D	G	A	L	L	R	L	R	H	N	T	Q	Q	L	G	M	R	L	V	L	D	G	V	F	N	H	S	G	D	S
Query Conservation											.	.
Alig confidence											.	.																											.	.												.	.																									.	.	.	.
Template Conservation																																							.	.												.	.																									.	.	.	.
Template Sequence		V	I	K	K	Q	V	D	A	F	V	A	A	G	L	P	A	A	G	Y	T	Y	I	N	I	D	E	G	W	W	Q	G	T	R	D	S	A	G	.	.	N	I	T	V	D	T	A	E	W	P	G	.	.	G	M	S	A	I	T	A	Y	I	H	S	K	G	L	K	A	G	I	Y	T	D	A	G	K	.	.	.	.
Template Known Secondary structure													T	T					T								T	T	S			S		B		T	T	S	.	.		B				T	T	T	S	T	T	.	.												T	T									S	S	S	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																							.	.												.	.																									.	.	.	.
Template SS confidence
		74	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110			.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.			.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.
		256	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	A	W	F	D	R	H	N	R	G	T	G	G	A	C	H	N	P	E	S	P	W	R	D	W	Y	S	F	S	D	D	G	T	A	L	D	W	L	G	Y	A	S	L	P	K	L	D	Y	Q	S	E	S	L	V	N	E	I	Y	R	G	E	D	S	I	V	R	H	W	L	K	A	P	W	N	M	D	G	W	R	L
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	G	C	G	Y	Y	Y	P	T	G	R	P	A	A	P	G	S	G	S	E	G	H	Y	D	Q	D	M	L	Q	F	S	.	.	.	.	.	.	T	W	G	F	D	F	V	K	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S						S		S	S	S				T	T		S		T	T											.	.	.	.	.	.			T		S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																				146	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.							.	.	.	180	.	.	.	.	.
		336	.	.	.	340	.	.	.		.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.
Query SS confidence										.
Query Sequence		D	V	V	H	M	L	G	E	.	A	G	G	A	R	N	N	M	Q	H	V	A	G	I	T	E	A	A	K	E	T	Q	P	E	A	Y	I	V	G	E	H	F	G	D	A	R	Q	W	L	Q	A	D	V	E	D	A	A	M	N	Y	R	G	F	T	F	P	L	W	G	F	L	A	N	T	D	I	S	Y	D	P	Q
Query Conservation										.
Alig confidence										.																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	W	C	G	G	D	A	E	G	L	D	A	A	T	T	Y	K	S	I	S	D	A	V	G	R	A	A	A	T	T	G	R	P	L	T	L	S	I	C	N	W	G	Y	Q	N	P	W	N	W	A	A	G	Q	A	P	L	W	R	T	S	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	I	I	Y	Y
Template Known Secondary structure										T																						S										T	T	T	T		G	G	G	T		T	T	T		S					S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S		T
Template Predicted Secondary structure																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		186	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.															.	.	.	250	.
		415	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	I	D	A	Q	T	C	M	A	W	M	D	N	Y	R	A	G	L	S	H	Q	Q	Q	L	R	M	F	N	Q	L	D	S	H	D	T	A	R	F	K	T	L	L	G	R	D	I	A	R	L	P	L	A	V	V	W	L	F	T	W	P	G	V	P	C	I	Y	Y	G	D	E	V	G	L	D	G	K	N	D	P	F
Query Conservation
Alig confidence																																						.	.																				.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																						.	.																				.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	N	Q	P	S	M	T	S	L	L	S	N	F	D	Q	T	L	H	P	T	A	Q	H	T	G	Y	Y	N	D	P	D	M	L	M	V	G	.	.	M	D	G	F	T	A	A	Q	N	R	T	H	M	N	L	W	A	I	S	.	.	.	G	A	P	L	L	A	G	N	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T																		T	T	T		B	T	T	B						S			T	T	.	.		T	T																	.	.	.	T							S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																						.	.																				.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		252	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.			.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.				.	.	.	310	.	.	.	.	.
		495	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.			.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.			.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.																																			.	.																			.	.	.	.
Query SS confidence																						.	.																																			.	.																			.	.	.	.
Query Sequence		C	R	K	P	F	P	W	Q	V	E	K	Q	D	T	A	L	F	A	L	Y	.	.	Q	R	M	I	A	L	R	K	K	S	Q	A	L	R	H	G	G	C	Q	V	L	Y	A	E	D	N	V	V	V	F	V	R	V	L	.	.	N	Q	Q	R	V	L	V	A	I	N	R	G	E	A	C	E	V	V	.	.	.	.
Query Conservation																						.	.																																			.	.																			.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.													.	.							.	.																											.	.																			.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	L	T	T	M	T	S	E	T	A	G	I	L	K	N	P	E	V	I	A	V	.	.	D	Q	D	S	R	G	L	Q	G	V	K	V	A	E	D	T	T	G	L	Q	A	Y	G	K	V	L	S	G	T	G	N	R	A	V	V	L	L	N	R	T	S	A	A	H	D	I	T	V	R	W
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G										T								.	.		T		T	T												T	T									S	S	S	S										S	S	S								T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.
Template SS confidence
										316	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.			.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.
						567	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	L	P	A	S	P	F	L	N	A	V	Q	W	Q	C	K	E	G	H	G	Q	L	T	D	G	I	L	A	L	P	A	I	S	A	T	V	W
Query Conservation		.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	D	L	G	L	T	N	A	S	A	T	V	R	D	L	W	A	R	Q	N	V	G	T	S	A	T	G	Y	T	A	S	V	P	A	G	G	S	V	M	L
Template Known Secondary structure		T	T	T	T	B		S	S							T	T	T	T							S	S								T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		386	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.