Job Description P21517 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:38:27 GMT 2012 Rank 46 Aligned Residues 430 % Identity 25% Template c2ze0A_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:alpha-glucosidase; PDBTitle: alpha-glucosidase gsj Resolution 2.00 Å

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		116	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	P	Q	W	A	A	D	Q	I	F	Y	Q	I	F	P	D	R	F	A	R	S	L	P	R	E	A	E	Q	D	H	V	Y	Y	H	H	A	A	G	Q	E	I	I	L	R	D	W	D	E	P	V	T	A	Q	A	G	G	S	T	F	Y	G	G	D	L	D	G	I	S	E	K	L	P	Y	L	K	K	L	G	V	T
Query Conservation
Alig confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	K	T	W	W	K	E	G	V	A	Y	Q	I	Y	P	R	S	F	M	D	A	N	G	D	G	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	D	L	R	G	I	I	E	K	L	D	Y	L	V	E	L	G	V	D
Template Known Secondary structure																G	G	G	T			S	S	S	S	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									T								T
Template Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.
		196	.	.	.	200	.	.	.	.	.		.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.
Query SS confidence												.
Query Sequence		A	L	Y	L	N	P	V	F	K	A	.	P	S	V	H	K	Y	D	T	E	D	Y	R	H	V	D	P	Q	F	G	G	D	G	A	L	L	R	L	R	H	N	T	Q	Q	L	G	M	R	L	V	L	D	G	V	F	N	H	S	G	D	S	H	A	W	F	D	R	H	N	R	G	T	G	G	A	C	H	N	P	E
Query Conservation												.
Alig confidence												.																																																												.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																								.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	V	W	I	C	P	I	Y	R	S	P	N	A	D	N	G	Y	D	I	S	D	Y	Y	A	I	M	D	E	F	G	T	M	D	D	F	D	E	L	L	A	Q	A	H	R	R	G	L	K	V	I	L	D	L	V	I	N	H	T	S	D	E	H	P	W	F	I	E	S	R	S	.	.	.	.	.	.	.	S	R	D
Template Known Secondary structure														T	T	T	T		S		S							G	G	G																T	T										S	B			T	T	S									.	.	.	.	.	.	.		S	S
Template Predicted Secondary structure																																																																								.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		47	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.								.	.	.
		275	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330
Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	P	W	R	D	W	Y	S	F	S	D	D	G	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	L	D	W	L	G	Y	A	S	L	P	K	L	D	Y	Q	S	E	S	L	V	N	E	I	Y	R	G	E	D	S	I	V	R	H	W	L	K	A	P	W	N	M
Query Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.						.	.
Template Conservation																																																																			.	.	.	.						.	.
Template Sequence		N	P	K	R	D	W	Y	I	W	R	D	G	K	D	G	R	E	P	N	N	W	E	S	I	F	G	G	S	A	W	Q	Y	D	E	R	T	G	Q	Y	Y	L	H	I	F	D	V	K	Q	P	D	L	N	W	E	N	S	E	V	R	Q	A	L	Y	E	M	.	.	.	.	V	N	W	W	L	.	.	D	K	G	I
Template Known Secondary structure		S	T	T	G	G	G	B						B	T	T	B		S	S					T	T	S	S	B	S					T	T	T	T						S	S		T	T			B	B		T	T												.	.	.	.						.	.			T
Template Predicted Secondary structure																																																																			.	.	.	.						.	.
Template SS confidence
		120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.					.	.	.	.	.			190	.	.	.
		331	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	G	W	R	L	D	V	V	H	M	L	G	E	A	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	R	N	N	M	Q	H	V	A	G	I	T	E	A	A	K	E	T	Q	P	E	A	Y	I	V	G	E	H	F	G	D	A	R	Q	W	L	Q	A	D	V	E	D	A	A	M	N	Y
Query Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.
Template Conservation																																																			.
Template Sequence		D	G	F	R	I	D	A	I	S	H	I	K	K	K	P	G	L	P	D	L	P	L	K	Y	V	P	S	F	A	G	H	M	N	Q	P	G	I	M	E	Y	L	R	E	L	K	E	Q	T	F	.	A	R	Y	D	I	M	T	V	G	E	A	N	G	V	T	V	D	E	A	E	Q	W	V	G	E	E	N	G	V	F
Template Known Secondary structure								S	G	G	G	S	S			T	T								S								S	S		T	T												T	G	.	G	G	S	S								T	T			T	T	T	T						S	S	S		S
Template Predicted Secondary structure																																																			.
Template SS confidence
		194	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.		.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.
		394	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.					.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																			.	.	.	.
Query SS confidence																																																																			.	.	.	.
Query Sequence		R	G	F	T	F	P	L	W	G	F	L	A	N	T	D	I	S	Y	D	P	Q	Q	I	D	A	Q	T	C	M	A	W	M	D	N	Y	R	A	G	L	S	H	Q	Q	Q	L	R	M	F	N	Q	L	D	S	H	D	T	A	R	F	K	T	L	L	G	R	.	.	.	.	D	I	A	R	L	P	L	A	V	V	W
Query Conservation																																																																			.	.	.	.
Alig confidence							.	.	.	.	.																																		.	.																					.	.	.	.
Template Conservation							.	.	.	.	.																																		.	.
Template Sequence		N	M	I	F	Q	.	.	.	.	.	F	E	H	L	G	L	W	E	R	R	A	S	I	D	V	R	R	L	K	R	T	L	T	K	W	Q	K	G	L	E	N	R	G	.	.	W	N	A	L	F	L	E	N	H	D	L	P	R	S	V	S	T	W	G	N	D	R	D	Y	W	A	E	S	A	K	A	L	G	A	L
Template Known Secondary structure		S					.	.	.	.	.		T	T																											T	T	T		.	.		B				S			T	T	S							T	S		S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.																																		.	.
Template SS confidence
		277	.	.	280	.						.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.			.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	500	.	.	.
Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	F	T	W	P	G	V	P	C	I	Y	Y	G	D	E	V	G	L	D	G	K	N	D	P	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	R	K	P	F	P	W	Q	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	F	F	M	Q	G	T	P	F	I	Y	Q	G	Q	E	I	G	M	T	N	V	R	F	D	D	I	R	D	Y	R	D	V	S	A	L	R	I	I	W	K	T	G	R	D	N	S	R	T	P	M	Q	W	S	G	A	S	N	A	G	F	T	T	G	T	P	W	I	K	V	N	E	N	Y	R	T	I	N	V	E	A
Template Known Secondary structure				T	S	S	S						T	T	G	G	G	T							S	S	G	G	G			S												G	G	G	G	T	S						S	S	G	G	G	G	S		S	S			S	S				G	G	G	G	T	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		352	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.
			504	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.		540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.					.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.																																					.																												.	.	.	.
Query SS confidence		.																																					.																												.	.	.	.
Query Sequence		.	E	K	Q	D	T	A	L	F	A	L	Y	Q	R	M	I	A	L	R	K	K	S	Q	A	L	R	H	G	G	C	Q	V	L	Y	A	E	D	.	N	V	V	V	F	V	R	V	L	N	Q	Q	R	V	L	V	A	I	N	R	G	E	A	C	E	V	V	.	.	.	.	L	P	A	S	P	F	L	N	A	V	Q
Query Conservation		.																																					.																												.	.	.	.
Alig confidence		.																																					.																												.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	R	R	D	P	N	S	V	W	S	F	Y	R	Q	M	I	Q	L	R	K	A	N	E	L	F	V	Y	G	T	Y	D	L	L	L	E	N	H	P	S	I	Y	A	Y	T	R	T	L	G	R	D	R	A	L	V	V	V	N	L	S	D	R	P	S	L	Y	R	Y	D	G	F	R	L	Q	S	S	D	L	A	L	S
Template Known Secondary structure						T	T	S																T					S						S	T	T		S	S									T	T										S	S	S							T	T	S		B		G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		445	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.
		578	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	Q	C	K	E	G	H	G	Q	L	T	D	G	I	L	A	L	P	A	I	S	A	T	V	W	M
Query Conservation
Alig confidence													.	.
Template Conservation													.	.
Template Sequence		N	Y	P	V	R	P	H	K	N	A	T	.	.	R	F	K	L	K	P	Y	E	A	R	V	Y	I
Template Known Secondary structure		S	S						S	S	B	S	.	.						T	T
Template Predicted Secondary structure													.	.
Template SS confidence
		525	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.			.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.