Job Description P21517 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:38:27 GMT 2012 Rank 8 Aligned Residues 541 % Identity 20% Template c2wanA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:pullulanase; PDBTitle: pullulanase from bacillus acidopullulyticus Resolution 1.65 Å

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		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	H	L	P	V	P	P	F	V	K	Q	S	K	D	Q	L	L	I	T	L	W	L	T	G	E	D	P	P	Q	R	I	M	L	R	T	E	H	D	N	E	E	M	S	V	P	M	H	K	Q	R	S	Q	P	Q	P	G	V	T	A	W	R	A	A	I	D	L	S	S	G	Q	P	R	R	R	Y	S	F	K	L	L
Query Conservation
Alig confidence																																																		.	.	.	.	.	.							.	.
Template Conservation																																																		.	.	.	.	.	.							.	.
Template Sequence		D	Y	S	G	N	D	L	G	N	V	Y	S	K	D	A	T	S	F	R	V	W	A	P	T	A	S	N	V	Q	L	L	L	Y	N	S	E	K	G	S	I	T	K	Q	L	E	M	Q	K	.	.	.	.	.	.	S	D	N	G	T	W	.	.	K	L	Q	V	S	G	N	L	E	N	W	Y	Y	L	Y	Q	V	T
Template Known Secondary structure						S								S	S									T	T		S								S	S	S	S	S			S								.	.	.	.	.	.		G	G	G			.	.						S			T	T
Template Predicted Secondary structure																																																		.	.	.	.	.	.							.	.
Template SS confidence
		312	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.							360	.	.	.	.	.			.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.
			85	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110											.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.
Predicted Secondary structure		.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	W	H	D	R	Q	R	W	F	T	P	Q	G	F	S	R	M	P	P	A	R	L	E	Q	F	A	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	V	P	D	I	G	P	Q	W	A	A	D	Q	I	F	Y	Q	I	F	P	D	R	F	A	R	S	L	P	R	E	A	E	Q	D	H	V	Y	Y	H	H	A	A	G
Query Conservation		.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																												.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	N	G	T	T	Q	T	A	V	D	P	Y	A	R	A	I	S	V	N	A	T	R	G	M	I	V	D	L	K	A	T	D	P	A	G	W	Q	G	D	H	E	Q	T	P	A	N	P	V	D	E	V	I	Y	E	A	H	V	R	D	F	S	I	D	A	N	S	G	M	K	N	K	G	K	Y	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			S	S								T	T		S	S	B	S	G	G	G	S	S						G	G	G	G	S		T	T	G	G	G							S	S	G	G	G														S	T	T	S			S	S	T	T	S	G	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																												.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		384	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.
		154	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.										.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	E	I	I	L	R	D	W	D	E	P	V	T	A	Q	A	G	G	S	T	F	Y	G	G	D	L	D	G	I	S	E	K	L	P	Y	L	K	K	L	G	V	T	A	L	Y	L	N	P	V	F	K	A	P	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	H	K	Y	D	T	E	D	Y	R	H	V	D	P	Q	F	G
Query Conservation																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	A	F	T	E	H	G	T	K	G	P	D	H	V	K	T	G	I	D	S	L	K	E	L	G	I	T	T	V	Q	L	Q	P	V	E	E	F	N	S	I	D	E	T	Q	P	D	T	Y	N	W	G	Y	D	P	R	N	Y	N	V	P	E	G	A	Y	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G	G			S		B		G	G	G		B										T							S						S	S	S		T	T	S	T	T	S						S									G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																	458	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.
		225								.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence			.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	.	.	.	.	.	.	.	D	G	A	L	L	R	L	R	H	N	T	Q	Q	L	G	M	R	L	V	L	D	G	V	F	N	H	S	G	D	S	H	A	W	F	D	R	H	N	R	G	T	G	G	A	C	H	N	P	E	S	P	W	R	D	W	Y	S	F	S	D	D	G	T	A	L	D	W	L	G	Y	A	S
Query Conservation			.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.
Template Conservation																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.
Template Sequence		T	T	P	E	G	T	A	R	I	T	E	L	K	Q	L	I	Q	S	L	H	Q	Q	R	I	G	V	N	M	D	V	V	Y	N	H	T	F	D	V	M	V	S	D	F	D	K	I	V	P	Q	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	Y	R	T	D	S	N	G	N	Y	T	N	G	S	G	.	.	.
Template Known Secondary structure		S		S	S	T	T																T	T									T	T			S		S	S	S	S						S	T	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	B		B		T	T	S		B			T	T		.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.
Template SS confidence
		523	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.													.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.
		298	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	P	K	L	D	Y	Q	S	E	S	L	V	N	E	I	Y	R	G	E	D	S	I	V	R	H	W	L	K	A	P	W	N	M	D	G	W	R	L	D	V	V	H	M	L	G	E	A	G	G	A	R	N	N	M	Q	H	V	A	G	I	T	E	A	A	K	E	T	Q	P	E	A	Y	I	V	G	E	H	F	G	D
Query Conservation
Alig confidence																				.	.	.	.								.																.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																				.	.	.	.								.																.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	N	E	F	A	T	E	H	P	M	A	Q	K	F	V	L	D	S	.	.	.	.	V	N	Y	W	V	N	E	.	Y	H	V	D	G	F	R	F	D	L	M	A	L	L	G	.	.	.	.	.	.	.	.	K	D	T	M	A	K	I	S	N	E	L	H	A	I	N	P	G	I	V	L	Y	G	E	P	W	T	G
Template Known Secondary structure					B		T	T	S											.	.	.	.								.									T	T	G	G	G	G		.	.	.	.	.	.	.	.																T	T							S	S		S
Template Predicted Secondary structure																				.	.	.	.								.																.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		589	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.					.	.	.	610	.	.	.		.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.									.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.
		378	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.						.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.							.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.
Query SS confidence													.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	R	Q	W	L	Q	A	D	V	E	D	.	.	.	.	.	A	A	M	N	Y	R	G	F	T	F	P	L	W	G	F	L	A	N	T	D	I	S	Y	D	P	.	.	.	.	.	.	Q	Q	I	D	A	Q	T	C	M	A	W	M	D	N	Y	R	A	G	L	S	H	Q	Q	Q	L	R	M	F	N	Q	L	D	S
Query Conservation													.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.
Alig confidence													.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.																						.
Template Conservation																																																																						.
Template Sequence		G	T	S	G	L	S	S	D	Q	L	V	T	K	G	Q	Q	K	G	L	G	I	G	V	F	N	D	N	I	R	N	G	L	D	G	N	V	F	D	K	T	A	Q	G	F	A	T	G	D	P	N	Q	V	D	V	I	K	N	G	V	I	G	S	I	Q	D	F	T	S	.	A	P	S	E	T	I	N	Y	V	T	S
Template Known Secondary structure		S			S	S		T	T	T	S			T	T	T	T	T	T	T	T																T	T		T	T				T	T	T	T		S	S										B	T	T	T	T	T	T		S	.	S	G	G	G					S
Template Predicted Secondary structure																																																																						.
Template SS confidence
		656	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.		.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.
		447	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.										460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.							.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.
Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.
Query SS confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.
Query Sequence		H	D	T	A	R	F	K	T	L	L	G	R	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	A	R	L	P	L	A	V	V	W	L	F	T	W	P	G	V	P	C	I	Y	Y	G	D	E	V	G	L	D	G	K	N	D	P	F	C	R	.	.	.	.	.	.	K	P	F	P	W	Q	V	E	K	Q	D	T	A	L	F
Query Conservation															.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.
Alig confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		H	D	N	M	T	L	W	D	K	I	L	A	S	N	P	S	D	T	E	A	D	R	I	K	M	D	E	L	A	H	A	V	V	F	T	S	Q	G	V	P	F	M	Q	G	G	E	E	M	L	R	T	K	G	G	N	D	N	S	Y	N	A	G	D	S	V	N	Q	F	D	W	S	R	K	A	Q	F	K	D	V	F
Template Known Secondary structure		S	S	S												T	T	S																			S	B	S						T	T	G	G	G	T				T	T		S			T	T							S			T						T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		735	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.
		512	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.								.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.						.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.		.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.																	.
Query SS confidence																						.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.																	.
Query Sequence		A	L	Y	Q	R	M	I	A	L	R	K	K	S	Q	A	L	R	H	G	G	.	.	.	.	.	.	.	C	Q	V	L	Y	A	E	D	N	V	V	V	F	V	R	V	L	.	.	.	.	.	N	Q	Q	R	V	L	V	A	I	N	R	G	E	A	C	E	.	V	V	L	P	A	S	P	F	L	N	A	V	Q	W
Query Conservation																						.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.																	.
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.																	.
Template Conservation
Template Sequence		D	Y	F	S	S	M	I	H	L	R	N	Q	H	P	A	F	R	M	T	T	A	D	Q	I	K	Q	N	L	T	F	L	E	S	P	T	N	T	V	A	F	E	L	K	N	Y	A	N	H	D	T	W	K	N	I	I	V	M	Y	N	P	N	K	T	S	Q	T	L	N	L	P	S	G	D	W	T	I	V	G	L	G
Template Known Secondary structure															G	G	G	G			S															T	T								S	S	G	G	G		S	S	S									S	S	S								S	S								T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		815	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.
			579	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.
Predicted Secondary structure		.
Query SS confidence		.
Query Sequence		.	Q	C	K	E	G	H	G	Q	L	T	D	G	I	L	A	L	P	A	I	S	A	T	V	W	M
Query Conservation		.
Alig confidence		.
Template Conservation
Template Sequence		D	Q	I	G	E	K	S	L	G	H	V	M	G	N	V	Q	V	P	A	I	S	T	L	I	L	K
Template Known Secondary structure		T			S	S	S		S					S						S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		895	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920