Job Description P21517 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:38:27 GMT 2012 Rank 38 Aligned Residues 436 % Identity 22% Template c2taaA_ PDB info PDB header:hydrolase (o-glycosyl) Chain: A: PDB Molecule:taka-amylase a; PDBTitle: structure and possible catalytic residues of taka-amylase a Resolution 3.00 Å

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		115	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	G	P	Q	W	A	A	D	Q	I	F	Y	Q	I	F	P	D	R	F	A	R	S	L	P	R	E	A	E	Q	D	H	V	Y	Y	H	H	A	A	G	Q	E	I	I	L	R	D	W	D	E	P	V	T	A	Q	A	G	G	S	T	F	Y	G	G	D	L	D	G	I	S	E	K	L	P	Y	L	K	K	L	G	V
Query Conservation
Alig confidence							.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation							.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	P	A	D	W	.	R	S	Q	S	I	Y	F	L	L	T	D	R	F	A	R	T	D	G	S	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	T	C	N	T	A	D	Q	K	Y	C	G	G	T	W	Q	G	I	I	D	K	L	D	Y	I	Q	G	M	G	F
Template Known Secondary structure			T	T	T	G	.	G	G	S							B	T	T	B			T	T			T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					G	G	G		S						G	G	G	G	G	T
Template Predicted Secondary structure							.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		2	.	.	.	.		.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.
		195	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.									.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence														.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	A	L	Y	L	N	P	V	F	K	A	P	.	.	.	.	.	.	.	.	S	V	H	K	Y	D	T	E	D	Y	R	H	V	D	P	Q	F	G	G	D	G	A	L	L	R	L	R	H	N	T	Q	Q	L	G	M	R	L	V	L	D	G	V	F	N	H	S	G	D	S	H	A	W	F	D	R	H	N	R	G	T
Query Conservation														.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	A	I	W	I	T	P	V	T	A	Q	L	P	Q	D	C	A	Y	G	D	A	Y	T	G	Y	W	Q	T	D	I	Y	S	L	N	E	N	Y	G	T	A	D	D	L	K	A	L	S	S	A	L	H	E	R	G	M	Y	L	M	V	D	V	V	A	N	H	M	G	Y	D	G	A	G	S	S	V	D	Y	S	V	F
Template Known Secondary structure										S				S	S			T	T				T	T					S	S	S	S	S			S	S	S			T	T													S									T	T	B					S		G	G	G				S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		58	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.
		267					.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.
Predicted Secondary structure			.	.	.	.
Query SS confidence			.	.	.	.
Query Sequence		G	.	.	.	.	G	A	C	H	N	P	E	S	P	W	R	D	W	Y	S	F	S	D	D	G	T	A	L	D	W	L	G	Y	A	S	L	P	K	L	D	Y	Q	S	E	S	L	V	N	E	I	Y	R	G	E	D	S	I	V	R	H	W	L	K	A	P	W	N	M	D	G	W	R	L	D	V	V	H	M	L	G
Query Conservation			.	.	.	.
Alig confidence			.	.	.	.																																																	.	.	.	.								.
Template Conservation																																																							.	.	.	.								.
Template Sequence		K	P	F	S	S	Q	D	Y	F	H	P	F	C	F	I	Q	N	Y	E	D	Q	T	Q	V	E	D	C	W	L	G	D	N	T	V	S	L	P	D	L	D	T	T	K	D	V	V	K	N	E	W	Y	D	W	.	.	.	.	V	G	S	L	V	S	N	.	Y	S	I	D	G	L	R	I	D	T	V	K	H	V	Q
Template Known Secondary structure		T	T		S	S	S	T	T	B					B			S	G	G	G		S	S	T	T	T	S	B				T	T					B	B			S	S	S										.	.	.	.						T	T	.	T			S					T	T		S	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																							.	.	.	.								.
Template SS confidence
		138	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190					.	.	.	.	.	.	.		.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.
		343	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.			.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Predicted Secondary structure																																												.	.
Query SS confidence																																												.	.
Query Sequence		E	A	G	G	A	R	N	N	M	Q	H	V	A	G	I	T	E	A	A	K	E	T	Q	P	E	A	Y	I	V	G	E	H	F	G	D	A	R	Q	W	L	Q	A	.	.	D	V	E	D	A	A	M	N	Y	R	G	F	T	F	P	L	W	G	F	L	A	N	T	D	I	S	Y	D	P	Q	Q	I	D	A	Q	T
Query Conservation																																												.	.
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.																				.	.											.												.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.																																.												.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	.	.	.	.	.	.	.	.	D	F	W	P	G	Y	N	K	A	.	.	.	.	.	A	G	V	Y	C	I	G	E	V	L	D	G	D	P	A	Y	T	C	P	Y	Q	N	V	M	D	G	V	L	N	Y	P	.	I	Y	Y	P	L	L	N	A	F	K	S	.	.	.	.	.	.	.	T	S	G	S	M	D	D
Template Known Secondary structure		T	.	.	.	.	.	.	.	.	T									.	.	.	.	.	S		S															T	G	G	G	T	T	T	S	B						.									S	S	S	.	.	.	.	.	.	.	T	T			T
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.																																.												.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		213									.	.	.	.	.	.	220	.	.						.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.		.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.								.	.	.	.	.	270	.
		421	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		C	M	A	W	M	D	N	Y	R	A	G	L	S	H	Q	Q	Q	L	R	M	F	N	Q	L	D	S	H	D	T	A	R	F	K	T	L	L	G	R	D	I	A	R	L	P	L	A	V	V	W	L	F	T	W	P	G	V	P	C	I	Y	Y	G	D	E	V	G	L	D	G	K	N	D	P	F	C	R	K	P	F	P
Query Conservation
Alig confidence															.	.																								.
Template Conservation															.	.																								.
Template Sequence		L	Y	N	M	I	N	T	V	K	S	D	C	P	.	.	D	S	T	L	L	G	T	F	V	E	N	H	D	N	P	R	F	A	S	Y	T	N	D	.	I	A	L	A	K	N	V	A	A	F	I	I	L	N	D	G	L	P	I	I	Y	A	G	Q	E	Q	H	Y	A	G	G	N	D	P	A	N	R	E	A	T	W
Template Known Secondary structure													B		.	.		T	T						S	S		T	T	S			G	G	G	S				.														S	S	S						T	T	T	T	T	T					S	S	S	T	T				G	G
Template Predicted Secondary structure															.	.																								.
Template SS confidence
		272	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.			.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.		.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.
		501	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530				.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.					560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.
Predicted Secondary structure																																.	.	.																														.	.	.	.
Query SS confidence																																.	.	.																														.	.	.	.
Query Sequence		W	Q	V	E	K	Q	D	T	A	L	F	A	L	Y	Q	R	M	I	A	L	R	K	K	S	Q	A	L	R	H	G	.	.	.	G	C	Q	V	L	Y	A	E	D	N	V	V	V	F	V	R	V	L	N	Q	Q	R	V	L	V	A	I	N	R	.	.	.	.	G	E	A	C	E	V	V	L	P	A	S	P	F	L
Query Conservation																																.	.	.																														.	.	.	.
Alig confidence																																.	.	.																														.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	S	G	Y	P	T	D	S	E	L	Y	K	L	I	A	S	A	N	A	I	R	N	Y	A	I	S	K	D	T	G	F	V	T	Y	K	N	P	Y	I	K	D	D	T	T	I	A	M	R	K	G	T	D	G	S	Q	I	V	T	I	L	S	N	K	G	A	S	G	D	S	Y	T	L	S	L	S	G	A	S	Y	T
Template Known Secondary structure		G	S	S			T	T	S																				S			T	T	T	S								S	S	S								S	T	T											T	T									S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		349	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.
		574	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590						.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.
Query Sequence		N	A	V	Q	W	Q	C	K	E	G	H	G	Q	L	T	D	G	.	.	.	.	.	I	L	A	L	P	A	I	S	A	T	V	W	M
Query Conservation																			.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	G	Q	Q	L	T	E	V	I	G	C	T	T	V	T	V	G	S	D	G	N	V	P	V	P	M	A	G	G	L	P	R	V	L	Y
Template Known Secondary structure		T	T						S	T	T								T	T	T							S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		429	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.