Job Description P21517 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:38:27 GMT 2012 Rank 5 Aligned Residues 530 % Identity 17% Template c2e8yA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:amyx protein; PDBTitle: crystal structure of pullulanase type i from bacillus subtilis str.2 168 Resolution 2.11 Å

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		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	A	W	H	L	P	V	P	P	F	V	K	Q	S	K	D	Q	L	L	I	T	L	W	L	T	G	E	D	P	P	Q	R	I	M	L	R	T	E	H	D	N	E	E	M	S	V	P	M	H	K	Q	R	S	Q	P	Q	P	G	V	T	A	W	R	A	A	I	D	L	S	S	G	Q	P	R	R	R	Y	S	F	K
Query Conservation
Alig confidence																																					.	.														.	.	.	.	.	.												.	.
Template Conservation																																					.	.														.	.	.	.	.	.												.	.
Template Sequence		D	E	F	Y	Y	D	G	E	L	G	A	V	Y	T	A	D	H	T	V	F	K	V	W	A	P	A	A	T	S	A	A	V	K	L	S	.	.	H	P	N	K	S	G	R	T	F	Q	M	T	R	.	.	.	.	.	.	L	E	K	G	V	Y	A	V	T	V	T	.	.	G	D	L	H	G	Y	E	Y	L	F	C
Template Known Secondary structure								S								S	S									T	T		S								.	.		T	T	S										.	.	.	.	.	.		G	G	G								.	.	S			T	T
Template Predicted Secondary structure																																					.	.														.	.	.	.	.	.												.	.
Template SS confidence
		98	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.			.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.							.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.			.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.
		83	.	.	.	.	.	.	90		.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110							.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.																					.	.	.	.	.	.
Query SS confidence										.																					.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	L	W	H	D	R	Q	R	.	W	F	T	P	Q	G	F	S	R	M	P	P	A	R	L	E	Q	F	A	V	.	.	.	.	.	.	D	V	P	D	I	G	P	Q	W	A	A	D	Q	I	F	Y	Q	I	F	P	D	R	F	A	R	S	L	P	R	E	A	E	Q	D	H	V	Y	Y	H	H	A	A	G	Q	E
Query Conservation										.																					.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.																					.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	C	N	N	S	E	W	M	E	T	V	D	Q	Y	A	K	A	V	T	V	N	G	E	K	G	V	V	L	R	P	D	Q	M	K	W	T	A	P	L	K	P	F	S	H	P	V	D	A	V	I	Y	E	T	H	L	R	D	F	S	I	H	E	N	S	G	M	I	N	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure					T	T								T	T		S	S	B		G	G	G		S																			S		G	G	G														S	T	T	S			S	S	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		168	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.
		156	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.												.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.											.	.	210	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	I	L	R	D	W	D	E	P	V	T	A	Q	A	G	G	S	T	F	Y	G	G	D	L	D	G	I	S	E	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	P	Y	L	K	K	L	G	V	T	A	L	Y	L	N	P	V	F	K	A	P	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	H	K	Y	D	T	E
Query Conservation																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	K	Y	L	A	L	T	E	T	D	T	Q	T	A	N	G	S	S	S	G	L	A	Y	V	K	E	L	G	V	T	H	V	E	L	L	P	V	N	D	F	A	G	V	D	E	E	K	P	L	D	A	Y	N	W	G	Y	N	P	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S	G	G	G	G	G		T	T		B		T	T	S		B										T		S					S						S	S	S		T	T	S	G	G	G							S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																							237	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.
		215	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.									.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.		.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.	.																															.
Query SS confidence													.	.	.	.	.	.	.	.																															.
Query Sequence		D	Y	R	H	V	D	P	Q	F	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	D	G	A	L	L	R	L	R	H	N	T	Q	Q	L	G	M	R	L	V	L	D	G	V	F	N	H	S	G	D	S	.	H	A	W	F	D	R	H	N	R	G	T	G	G	A	C	H	N	P	E	S	P	W	R	D	W	Y	S	F	S	D
Query Conservation													.	.	.	.	.	.	.	.																															.
Alig confidence													.	.	.	.	.	.	.	.																															.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		H	F	F	A	P	E	G	S	Y	A	S	N	P	H	D	P	Q	T	R	K	T	E	L	K	Q	M	I	N	T	L	H	Q	H	G	L	R	V	I	L	D	V	V	F	N	H	V	Y	K	R	E	N	S	P	F	E	K	T	V	P	G	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	F	R	H	D	E
Template Known Secondary structure								S	T	T	S	S		S	S	S																		T	T									T	T			S	S	G	G	G	S						S	T	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	B		B		T
Template Predicted Secondary structure																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		296	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.														.	.	.	360	.	.
		286	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	G	T	A	L	D	W	L	G	Y	A	S	L	P	K	L	D	Y	Q	S	E	S	L	V	N	E	I	Y	R	G	E	D	S	I	V	R	H	W	L	K	A	P	W	N	M	D	G	W	R	L	D	V	V	H	M	L	G	E	A	G	G	A	R	N	N	M	Q	H	V	A	G	I	T	E	A	A	K	E	T	Q
Query Conservation
Alig confidence														.	.																	.	.	.	.								.																.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation														.	.																	.	.	.	.								.																.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		C	G	K	P	S	N	G	T	G	V	G	N	.	.	D	I	A	S	E	R	R	M	A	R	K	F	I	A	D	C	.	.	.	.	V	V	Y	W	L	E	E	.	Y	N	V	D	G	F	R	F	D	L	L	G	I	L	D	.	.	.	.	.	.	.	.	I	D	T	V	L	Y	M	K	E	K	A	T	K	A	K
Template Known Secondary structure		T	S	S	B			T	T	S	S	S		.	.		B		T	T	S											.	.	.	.								.									T	T	G	G	G	S	B	.	.	.	.	.	.	.	.															S
Template Predicted Secondary structure														.	.																	.	.	.	.								.																.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		363	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.			.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390					.	.	.	.	.	.	.		.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.									.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.
		366	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.						.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.							.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.
Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.																					.
Query SS confidence																														.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.																					.
Query Sequence		P	E	A	Y	I	V	G	E	H	F	G	D	A	R	Q	W	L	Q	A	D	V	E	D	A	A	M	N	Y	.	.	.	.	.	R	G	F	T	F	P	L	W	G	F	L	A	N	T	D	I	S	Y	D	P	.	.	.	.	.	.	Q	Q	I	D	A	Q	T	C	M	A	W	M	D	N	Y	R	A	G	L	S	.
Query Conservation																														.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.																					.
Alig confidence																														.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.																					.
Template Conservation
Template Sequence		P	G	I	L	L	F	G	E	G	W	D	L	A	T	P	L	P	H	E	Q	K	A	A	L	A	N	A	P	R	M	P	G	I	G	F	F	N	D	M	F	R	D	A	V	K	G	N	T	F	H	L	K	A	T	G	F	A	L	G	N	G	E	S	A	Q	A	V	M	H	G	I	A	G	S	S	G	W	K	A	L
Template Known Secondary structure		T	T													S	S		G	G	G	B			G	G	G	G	G	G		T	T																S	S	S	T	T				G	G	G	T		G	G	G									B	T	T	S		B	T	T	B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		428	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.
					434	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.										.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.							.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	H	Q	Q	Q	L	R	M	F	N	Q	L	D	S	H	D	T	A	R	F	K	T	L	L	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	D	I	A	R	L	P	L	A	V	V	W	L	F	T	W	P	G	V	P	C	I	Y	Y	G	D	E	V	G	L	D	G	K	N	D	.	.	.	.	.	.	P	F	C
Query Conservation		.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	P	I	V	P	E	P	S	Q	S	I	N	Y	V	E	S	H	D	N	H	T	F	W	D	K	M	S	F	A	L	P	Q	E	N	D	S	R	K	R	S	R	Q	R	L	A	V	A	I	I	L	L	A	Q	G	V	P	F	I	H	S	G	Q	E	F	F	R	T	K	Q	G	V	E	N	S	Y	Q	S	S	D	S
Template Known Secondary structure				S	S	S	S	G	G	G					S			S	S	S	S											T	T																			T	S	B	S						T	T	G	G	G	T				T	T		S			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		508	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.
		496	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.								.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550						.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.
Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.
Query SS confidence																																						.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.
Query Sequence		R	K	P	F	P	W	Q	V	E	K	Q	D	T	A	L	F	A	L	Y	Q	R	M	I	A	L	R	K	K	S	Q	A	L	R	H	G	G	.	.	.	.	.	.	.	C	Q	V	L	Y	A	E	D	N	V	V	V	F	V	R	V	L	N	Q	.	.	.	.	.	Q	R	V	L	V	A	I	N	R	G	E	A	C
Query Conservation																																						.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.
Alig confidence																																						.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	N	Q	L	D	W	D	R	R	E	T	F	K	E	D	V	H	Y	I	R	R	L	I	S	L	R	K	A	H	P	A	F	R	L	R	S	A	A	D	I	Q	R	H	L	E	C	L	T	L	K	E	H	L	I	A	Y	R	L	Y	D	L	D	E	V	D	E	W	K	D	I	I	V	I	H	H	A	S	P	D	S
Template Known Secondary structure				S									T																		G	G	G	G			S															S	S										T	T	T		S	S	S									S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		588	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.
		564		.	.	.	.	.	570		.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.
Predicted Secondary structure			.							.
Query SS confidence			.							.
Query Sequence		E	.	V	V	L	P	A	S	.	P	F	L	N	A	V	Q	W	Q	C	K	E	G	H	G	Q	L	T	D	G	I	L	A	L	P	A	I	S	A	T	V	W
Query Conservation			.							.
Alig confidence			.							.
Template Conservation
Template Sequence		V	E	W	R	L	P	N	D	I	P	Y	R	L	L	C	D	P	S	G	F	Q	E	D	P	T	E	I	K	K	T	V	A	V	N	G	I	G	T	V	I	L
Template Known Secondary structure							S	S		S								T	T											S						S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		668	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.