Job Description P21517 Confidence 97.91% Date Thu Jan 5 11:38:27 GMT 2012 Rank 142 Aligned Residues 321 % Identity 14% Template c1xsiF_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: F: PDB Molecule:putative family 31 glucosidase yici; PDBTitle: structure of a family 31 alpha glycosidase Resolution 2.20 Å

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		180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.			.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.				.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.															.	.	.
Query SS confidence																	.	.															.	.	.
Query Sequence		D	G	I	S	E	K	L	P	Y	L	K	K	L	G	V	.	.	T	A	L	Y	L	N	P	V	F	K	A	P	S	V	.	.	.	H	K	Y	D	T	E	D	Y	R	H	V	D	P	Q	F	G	G	D	G	A	L	L	R	L	R	H	N	T	Q	Q	L	G	M	R	L	V	L	D	G	V	F	N	H	S	G	D
Query Conservation																	.	.															.	.	.
Alig confidence																	.	.															.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.
Template Conservation																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.
Template Sequence		A	T	V	N	S	F	I	D	G	M	A	E	R	N	L	P	L	H	V	F	H	F	D	C	F	W	M	K	A	F	Q	W	C	D	F	E	W	D	P	L	T	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	D	P	E	G	M	I	R	R	L	K	A	K	G	L	K	I	C	V	W	I	N	P	.	Y	I	G	Q
Template Known Secondary structure														T	T										G	G	G	B		T	T			S	S			B		T	T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S											T	T	T									S	.				T
Template Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.
Template SS confidence
		284	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.											.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.		.	350	.	.
		255	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.		.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.
Predicted Secondary structure																																												.
Query SS confidence																																												.
Query Sequence		S	H	A	W	F	D	R	H	N	R	G	T	G	G	A	C	H	N	P	E	S	P	W	R	D	W	Y	S	F	S	D	D	G	T	A	L	D	W	L	G	Y	A	.	S	L	P	K	L	D	Y	Q	S	E	S	L	V	N	E	I	Y	R	G	E	D	S	I	V	R	H	W	L	K	A	P	W	N	M	D	G	W
Query Conservation																																												.
Alig confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.																									.	.	.	.	.	.
Template Conservation													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	S	P	V	F	K	E	L	Q	E	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	Y	L	L	K	R	P	D	G	S	L	W	Q	W	D	K	W	Q	P	G	L	A	I	Y	D	F	T	N	P	D	A	C	K	W	Y	A	D	K	L	K	G	L	V	.	.	.	.	.	.	A	M	G	V	D	C	F
Template Known Secondary structure		T	S										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T		B		B		T	T	S	S	B			B		S	S	S	T	T	B			B		T	T	S																.	.	.	.	.	.		T	T
Template Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		353	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.														.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.							.	.	.	410	.	.	.
		334	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	L	D	V	V	H	M	L	G	E	A	G	G	A	R	N	N	M	Q	H	V	A	G	I	T	E	A	A	K	E	T	Q	P	E	A	Y	I	V	G	E	H	F	G	D	A	R	Q	W	L	Q	A	D	V	E	D	A	A	M	N	Y	R	G	F	T	F	P	L	W	G	F	L	A	N	T	D	I	S	Y	D	P
Query Conservation
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	T	D	F	G	E	R	I	P	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	V	Q	W	F	D	G	S	D	P	Q	K	M	H	N	H	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure											S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	B		T	T												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		414	.	.	.	.	.	420	.	.	.																																													.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440
		414	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.							460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.	.	.																												.
Query SS confidence																																																.	.	.	.	.	.																												.
Query Sequence		Q	Q	I	D	A	Q	T	C	M	A	W	M	D	N	Y	R	A	G	L	S	H	Q	Q	Q	L	R	M	F	N	Q	L	D	S	H	D	T	A	R	F	K	T	L	L	G	R	D	.	.	.	.	.	.	I	A	R	L	P	L	A	V	V	W	L	F	T	W	P	G	V	P	C	I	Y	Y	G	D	E	V	G	.
Query Conservation																																																.	.	.	.	.	.																												.
Alig confidence		.	.	.	.																																											.	.	.	.	.	.																			.	.								.
Template Conservation		.	.	.	.																																																																			.	.
Template Sequence		.	.	.	.	A	Y	I	Y	N	E	L	V	W	N	V	L	K	D	T	V	G	E	E	E	A	V	L	F	A	R	S	A	S	V	G	A	Q	K	F	P	V	H	W	G	G	D	C	Y	A	N	Y	E	S	M	A	E	S	L	R	G	G	L	S	I	G	L	S	G	F	G	.	.	F	W	S	H	D	I	G	G
Template Known Secondary structure		.	.	.	.														T	T	T		G	G	G						S		B		T	T	G	G	G	S							S		B	S	S																T	T	T			.	.					B	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.																																																																			.	.
Template SS confidence
						441	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.			.	.	.	510	.	.	.	.
																								487	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.																	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	D	G	K	N	D	P	F	C	R	K	P	F	P	W	Q	V	E	K	Q	D	T	A	L	F	A	L	Y	Q	R	M	I	A	L	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	K	S	Q	A	L	R
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																							.	.	.	.	.
Template Sequence		F	E	N	T	A	P	A	H	V	Y	K	R	W	C	A	F	G	L	L	S	S	H	S	R	L	H	G	S	K	S	Y	R	V	P	W	A	Y	.	.	.	.	.	D	D	E	S	C	D	V	V	R	F	F	T	Q	L	K	C	R	M	M	P	Y	L	Y	R	E	A	A	R	A	N	A	R	G	T	P	M	M	R
Template Known Secondary structure		S	B	S																T	S	S	S						S	S	S				G	G	G	T	.	.	.	.	.																		T																		S
Template Predicted Secondary structure																																							.	.	.	.	.
Template SS confidence
		515	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.						.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.
								529	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.			.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																												.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.																												.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	H	G	G	C	Q	V	L	Y	A	E	D	N	V	V	V	F	V	R	V	L	N	Q	Q	R	V	L	V	.	.	A	I	N	R	G	E	A	C	E	V	V	L	P	A	S	P	F	L	N	A	V	Q	W	Q	C	K	E	G	H	G	Q	L	T	D	G	I	L	A	L	P	A	I	S	A	T
Query Conservation		.	.	.	.	.	.																												.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.							.	.																																	.	.	.
Template Conservation																							.	.	.	.	.	.																																									.	.	.
Template Sequence		A	M	M	M	E	F	P	D	D	P	A	C	D	Y	L	D	R	Q	Y	M	L	.	.	.	.	.	.	G	D	N	V	M	V	A	P	V	F	T	E	A	G	D	V	Q	F	Y	L	P	E	G	R	W	T	H	L	W	H	N	D	E	L	D	G	S	R	W	H	.	.	.	K	Q	Q	H	G	F	L	S	L	P
Template Known Secondary structure								T	T		G	G	G	T	T			S					.	.	.	.	.	.	T	T	T								S	S	S									S	S					T	T	T						S	S				.	.	.						T	T
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.																																									.	.	.
Template SS confidence
		590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610							.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650				.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
		601	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	W	M
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		V	Y	V
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		661	.	.