Job Description P21517 Confidence 93.59% Date Thu Jan 5 11:38:27 GMT 2012 Rank 256 Aligned Residues 319 % Identity 14% Template c1t0oA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:alpha-galactosidase; PDBTitle: the structure of alpha-galactosidase from trichoderma reesei complexed2 with beta-d-galactose Resolution 1.96 Å

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		178	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.						190	.	.	.	.	.	.	.						.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.									.	.	.	.	.
Query SS confidence														.	.	.	.	.									.	.	.	.	.
Query Sequence		D	L	D	G	I	S	E	K	L	P	Y	L	.	.	.	.	.	K	K	L	G	V	T	A	L	.	.	.	.	.	Y	L	N	P	V	F	K	A	P	S	V	H	K	Y	D	T	E	D	Y	R	H	V	D	P	Q	F	G	G	D	G	A	L	L	R	L	R	H	N	T	Q	Q	L	G	M	R	L	V	L	D	G
Query Conservation														.	.	.	.	.									.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.	.	.									.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	E	S	K	F	L	S	A	A	E	L	I	V	S	S	G	L	L	D	A	G	Y	N	Y	V	N	I	D	D	C	W	S	M	K	D	G	R	V	D	G	H	I	A	P	N	A	T	R	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	D	G	I	D	G	L	A	K	K	V	H	A	L	G	L	K	L	G	I	Y	S
Template Known Secondary structure																T	T					T								S	S		B		T	T			B	T	T	B			B		T	T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T												T	T
Template Predicted Secondary structure																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		27	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.										.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.
		248	.		250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.
Query SS confidence				.
Query Sequence		V	F	.	N	H	S	G	D	S	H	A	W	F	D	R	H	N	R	G	T	G	G	A	C	H	N	P	E	S	P	W	R	D	W	Y	S	F	S	D	D	G	T	A	L	D	W	L	G	Y	A	S	L	P	K	L	D	Y	Q	S	E	S	L	V	N	E	I	Y	R	G	E	D	S	I	V	R	H	W	L	K	A
Query Conservation				.
Alig confidence				.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	A	G	T	A	T	C	A	G	Y	P	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	L	G	Y	E	D	V	D	A	A	D	F	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			S	S	S	B		T	T	S		B		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		98	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.
		327	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.
Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	W	N	M	D	G	W	R	L	D	V	V	H	M	L	G	E	A	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	A	R	N	N	M	Q	H	V	A	G	I	T	E	A	A	K	E	T	Q	P	E	A	Y	I	V	G
Query Conservation																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	W	G	V	D	Y	L	K	Y	D	N	C	N	V	P	S	D	W	Q	D	E	Y	V	A	C	N	P	D	F	V	K	T	G	P	N	G	T	C	T	T	A	L	D	P	T	L	A	P	P	G	Y	D	W	S	T	S	K	S	A	E	R	F	G	A	M	R	N	A	L	A	K	Q	S	H	E	I	V	L	S	M
Template Known Secondary structure				T													G	G	G	S		S	S	B				T	T	T	S				G	G	G				T	T	T		T	T	B			T	T			G	G	G	S															T	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		123	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.
		373	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	H	F	G	D	A	R	Q	W	L	Q	A	D	V	E	D	A	A	M	N	Y	R	G	F	T	F	P	L	W	G	F	L	A	N	T	D	I	S	Y	D	P	Q	Q	I	D	A	Q	T	C	M	A	W	M	D	N	Y	R	A	G	L	S	H	Q	Q	Q	L	R	M	F	N	Q	L	D	S	H	D	T	A	R	F
Query Conservation
Alig confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		C	I	W	G	Q	A	D	V	F	S	W	G	N	S	T	G	I	S	W	R	M	S	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	I	S	P	N	W	G	S	V	T	R	I	L	N	L	N	S	F	K	L	N	S	V	D	F	W	G	H	N	D	A	D	M	L	E	V	G	N	G
Template Known Secondary structure				T	T		T	T					G	G	G	T		S					S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				S	S													T		G	G	G		B	T	T	B									T	T		T
Template Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		203	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.
		453	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	T	L	L	G	R	D	I	A	R	L	P	L	A	V	V	W	L	F	T	W	P	G	V	P	C	I	Y	Y	G	D	E	V	G	L	D	G	K	N	D	P	F	C	R	K	P	F	P	W	Q	V	E	K	Q	D	T	A	L	F	A	L	Y	Q	R	M	I	A	L	R	K	K	S	Q	A	L	R	H	G	G	C
Query Conservation
Alig confidence			.	.																	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation			.	.																	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	.	.	L	T	A	A	E	T	R	T	H	F	A	L	W	A	A	M	.	.	.	K	S	P	L	L	I	G	T	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	A	Q	L	S	Q	N	N	I	N	L	L	K	N	K	H	L	L	A	F	N	Q	D	S	V	Y	G	Q	P	A
Template Known Secondary structure		T	.	.																T	.	.	.	T							S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	T	S									T									T		S	S			S
Template Predicted Secondary structure			.	.																	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		265			.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.				.	.	.	.	.	.	.	.	290																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320
		533	.	.	.	.											.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.		.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.								580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.
Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.																.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.																.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	V	L	Y	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	D	N	V	V	V	F	V	R	V	L	N	Q	Q	R	V	L	V	A	I	N	R	G	E	A	C	E	.	V	V	L	P	A	S	P	F	L	N	A	V	Q	W	Q	.	.	.	.	.	.	.	C	K	E	G	H	G	Q	L	T	D	G	I	L	A	L
Query Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.																.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.																.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	P	Y	K	W	G	I	N	P	D	W	T	F	N	V	T	Y	P	A	E	F	W	A	G	P	S	S	K	G	H	L	V	L	M	V	N	T	L	D	I	T	A	T	K	E	A	K	W	N	E	I	P	G	L	S	A	G	H	Y	E	V	R	D	V	W	S	D	K	D	L	G	C	L	S	S	Y	K	A	A	V
Template Known Secondary structure							S	S	S		T	T				S	S	S										T	T										S	S	S								G	G	G	S	T	T			S	S							T	T	T								S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		321	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400
		595	.	.	.	.	600	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	A	I	S	A	T	V	W
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		A	A	H	D	T	A	V	I
Template Known Secondary structure			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		401	.	.	.	.	.	.	.