Job Description P21517 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:38:27 GMT 2012 Rank 89 Aligned Residues 403 % Identity 22% Template c1iv8A_ PDB info PDB header:isomerase Chain: A: PDB Molecule:maltooligosyl trehalose synthase; PDBTitle: crystal structure of maltooligosyl trehalose synthase Resolution 1.90 Å

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		174	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.			.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.
Predicted Secondary structure																																			.	.
Query SS confidence																																			.	.
Query Sequence		F	Y	G	G	D	L	D	G	I	S	E	K	L	P	Y	L	K	K	L	G	V	T	A	L	Y	L	N	P	V	F	K	A	P	.	.	S	V	H	K	Y	D	T	E	D	Y	R	H	V	D	P	Q	F	G	G	D	G	A	L	L	R	L	R	H	N	T	Q	Q	L	G	M	R	L	V	L	D	G	V	F	N	H
Query Conservation																																			.	.
Alig confidence																		.																	.	.
Template Conservation																		.
Template Sequence		N	K	N	F	N	F	G	D	V	I	D	N	L	W	Y	F	.	D	L	G	V	S	H	L	Y	L	S	P	V	L	M	A	S	P	G	S	N	H	G	Y	D	V	I	D	H	S	R	I	N	D	E	L	G	G	E	K	E	Y	R	R	L	I	E	T	A	H	T	I	G	L	G	I	I	Q	D	I	V	P	N	H
Template Known Secondary structure		B	T	T	B								T	T	T	T		.																	T	T		S	S			S									T	T	T	T															T	T										S
Template Predicted Secondary structure																		.
Template SS confidence
		11	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.		.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.
				252	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	S	G	D	S	H	A	W	F	D	R	H	N	R	G	T	G	G	A	C	H	N	P	E	S	P	W	R	D	W	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	F	S	D	D	G	T	A	L	D	W	L	G	Y	A	S	L	P	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.														.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.
Template Conservation																	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		M	A	V	N	S	L	N	W	R	L	M	D	V	L	M	.	.	.	.	.	.	.	G	S	Y	Y	T	Y	F	D	F	F	P	E	D	D	K	I	R	L	P	I	L	G	E	D	L	D	T	V	I	S	K	G	L	L	K	I	V	K	D	G	D	E	Y	F	L	E	Y	F	K	W	K	L	P	L	T	E	V	G
Template Known Secondary structure						T	T										.	.	.	.	.	.	.				G	G	G	B		B		T	T		S	S							S	S								T	T								S	S							T	T						S
Template Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		91	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.								.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.
																														300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	L	D	Y	Q	S	E	S	L	V	N	E	I	Y	R	G	E	D	S	I	V	R	H	W	L	K	A	P	W	N	M	D	G	W	R	L	D	V	V	H	M	L	G	E	A	G	G	A	R	N	N	M
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.						.	.																			.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																														.	.	.	.						.	.																			.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	D	I	Y	D	T	L	Q	K	Q	N	Y	T	L	M	S	W	K	N	P	P	S	Y	R	R	F	F	D	V	N	T	L	I	G	V	N	V	E	D	H	V	F	Q	E	.	.	.	.	S	H	S	I	L	.	.	D	L	D	V	D	G	Y	R	I	D	H	I	D	G	L	Y	D	P	.	.	.	.	.	.	E
Template Known Secondary structure		S	S						T	T	S	S						T	T	S			S	B				T	T							B										.	.	.	.		T			T	.	.	T	S			S					T	T	G	G	G		S			.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																														.	.	.	.						.	.																			.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		168	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.					.	.	.	.	.			.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.							.
		352	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.														.	.	380	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	H	V	A	G	I	T	E	A	A	K	E	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	P	E	A	Y	I	V	G	E	H	F	G	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	R	Q	W	L	Q	A	D
Query Conservation															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	Y	I	N	D	L	R	S	I	I	K	N	I	I	I	V	E	K	I	L	G	F	Q	E	E	L	K	L	N	S	D	G	T	T	G	Y	D	F	L	N	Y	S	N	L	L	F	N	F	N	Q	E	I	M	D	S	I	Y	E	N	F	T	A	E	K	I	S	I	S	E	S	I	K	I	K	A	Q	I	I	D	E
Template Known Secondary structure																							T	T					S	S	S	S			S	S									G	G	G															T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		238	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.
		386	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.							410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	E	D	A	A	M	N	Y	R	G	F	T	F	P	L	W	G	F	L	A	N	T	D	I	.	.	.	.	.	.	S	Y	D	P	Q	Q	I	D	A	Q	T	C	M	A	W	M	D	N	Y	R	A	G	L	S	H	Q	Q	Q	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																										.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	F	S	Y	E	V	R	L	A	S	Q	L	G	I	S	Y	D	I	L	R	D	Y	L	S	C	I	D	V	Y	R	T	Y	A	N	Q	I	V	K	E	C	D	K	T	N	E	I	E	E	A	T	K	R	N	P	E	A	Y	T	K	L	Q	Q	Y	M	P	A	V	Y	A	A	Y	E	D	T	F	L	F	R	Y	N
Template Known Secondary structure			S	T	T	T								T	S														S	S			S	T	T				G	G	G	T	T	T	S																		T	T								T	T	T	T	G	G	G	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.
																																		439	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	M	F	N	Q	L	D	S	H	D	T	A	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	L	I	S	I	N	E	V	G	S	D	L	R	Y	Y	K	I	S	P	D	Q	F	H	V	F	N	Q	K	R	R	G	K	I	T	L	N	A	T	S	T	H	D	T	K	F	S	E	D	V	R	M	K	I	S	V	L	S	E	F	P	E	E	W	K	N	V	E	E	W	H	S	I	I	N	P	K	V	S	R	N
Template Known Secondary structure		S	S	G	G	G			T	T			T	T																	T	T							S			S	S		S	S										G	G	G	G	S														S			S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		402	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.
																																																																						452	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	K	T	L	L	G	R	D	I	A	R	L
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	E	Y	R	Y	Y	Q	V	L	V	G	S	F	Y	E	G	F	S	N	D	F	E	R	I	Q	H	M	I	S	V	R	E	A	I	N	T	S	W	R	N	Q	N	K	E	Y	E	N	R	V	M	E	L	V	E	E	T	F	T	N	K	D	F	I	K	S	F	M	K	F	E	S	I	R	R	I	G	M	I	K	S
Template Known Secondary structure															T	T		S		S											T	T	T						S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		483	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.
		464	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	L	A	V	V	W	L	F	T	W	P	G	V	P	C	I	Y	Y	G	D	E	V	G	L	D	G	K	N	D	P	F	C	R	K	P	F	P	W	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	E	K	Q	D	T	A	L	F	A	L	Y	Q	R	M	I	A	L	R	K	K	S	Q	A	L
Query Conservation																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	S	L	V	A	L	K	I	M	S	A	G	I	P	D	F	Y	Q	G	T	E	I	W	R	Y	L	L	T	D	P	D	N	R	V	P	V	D	F	K	K	L	H	E	I	L	E	K	S	K	F	E	K	N	M	L	E	S	M	D	D	G	R	I	K	M	Y	L	T	Y	L	L	S	L	R	K	Q	L	A	E	D
Template Known Secondary structure											S	S	S						T	T	T	T	S						S	T	T	G	G	G														T					T						G	G	G	S																T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		568	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.
			528	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.		.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.
Predicted Secondary structure		.																																													.
Query SS confidence		.																																													.
Query Sequence		.	R	H	G	G	C	Q	V	L	Y	A	E	D	N	V	V	V	F	V	R	V	L	N	Q	Q	R	V	L	V	A	I	N	R	G	E	A	C	E	V	V	L	P	A	S	P	.	F	L	N	A	V	Q	W	Q	C	K	E	G	H	G	Q	L	T	D	G	I	L	A	L	P	A	I	S	A	T	V
Query Conservation		.																																													.
Alig confidence		.																				.																									.																			.	.	.	.
Template Conservation																						.																																												.	.	.	.
Template Sequence		F	L	K	G	E	Y	K	G	L	D	L	E	E	G	L	C	G	F	I	R	.	F	N	K	I	L	V	I	I	K	T	K	G	S	V	N	Y	K	L	K	L	E	E	G	A	I	Y	T	D	V	L	T	G	E	E	I	K	K	E	V	Q	I	N	E	.	.	.	.	L	P	R	I	L	V	R	M
Template Known Secondary structure					S									T	T							.	T	T	T							S		T	T									S	S						T	T	T						S						S	.	.	.	.	S
Template Predicted Secondary structure																						.																																												.	.	.	.
Template SS confidence
		650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.		670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.					.	.	.	.	.	.	.	720