Job Description P21517 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:38:27 GMT 2012 Rank 29 Aligned Residues 494 % Identity 21% Template c1ehaA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:glycosyltrehalose trehalohydrolase; PDBTitle: crystal structure of glycosyltrehalose trehalohydrolase2 from sulfolobus solfataricus Resolution 3.00 Å

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		12	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	V	K	Q	S	K	D	Q	L	L	I	T	L	W	L	T	G	E	D	P	P	Q	R	I	M	L	R	T	E	H	D	N	E	E	M	S	V	P	M	H	K	Q	R	S	Q	P	Q	P	G	V	T	A	W	R	A	A	I	D	L	S	S	G	Q	P	R	R	R	Y	S	F	K	L	L	W	H	D	R	Q	R	W
Query Conservation
Alig confidence																											.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.							.	.																		.	.
Template Conservation																											.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.							.	.																		.	.
Template Sequence		A	Y	K	I	D	G	N	E	V	I	F	T	L	W	A	P	Y	Q	K	S	V	K	L	K	V	.	.	.	.	.	.	L	E	K	G	L	Y	E	M	E	R	.	.	.	.	.	.	D	E	K	G	Y	F	.	.	T	I	T	L	N	N	V	K	V	R	D	R	Y	K	Y	V	L	.	.	D	D	A	S	E	I
Template Known Secondary structure		S					S	S									T	T		S			B		B	B	.	.	.	.	.	.	S	S	S		B						.	.	.	.	.	.		T	T	S			.	.					S	S			S									.	.	T	T	S
Template Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.							.	.																		.	.
Template SS confidence
		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.							.	.	30	.	.	.	.	.	.	.							.	.	40	.	.	.			.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60			.	.	.	.	.	.
		92	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.					.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.	.
Query Sequence		F	T	P	Q	G	F	S	R	M	P	P	A	R	L	E	Q	F	A	V	D	V	P	D	I	.	.	.	.	G	P	Q	W	A	A	D	Q	I	F	Y	Q	I	F	P	D	R	F	A	R	S	L	P	R	E	A	E	Q	D	H	V	Y	Y	H	H	A	A	G	Q	E	I	I	L	R	D	W	D	E	P	V	T	A
Query Conservation																										.	.	.	.
Alig confidence																										.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	D	P	A	S	R	Y	Q	P	E	G	V	H	G	P	S	Q	I	I	Q	E	S	K	E	F	N	N	E	T	F	L	K	K	E	D	L	I	I	Y	E	I	H	V	G	T	F	T	P	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure				T	T		S			S	S	S	T	T	S													S			S			S	S	S								T	T	T	S	S	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		67	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.
		168	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.			.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																										.	.
Query SS confidence																																										.	.
Query Sequence		Q	A	G	G	S	T	F	Y	G	G	D	L	D	G	I	S	E	K	L	P	Y	L	K	K	L	G	V	T	A	L	Y	L	N	P	V	F	K	A	P	S	.	.	V	H	K	Y	D	T	E	D	Y	R	H	V	D	P	Q	F	G	G	D	G	A	L	L	R	L	R	H	N	T	Q	Q	L	G	M	R	L	V	L
Query Conservation																																										.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	T	F	E	G	V	I	R	K	L	D	Y	L	K	D	L	G	I	T	A	I	E	I	M	P	I	A	Q	F	P	G	K	R	D	W	G	Y	D	G	V	Y	L	Y	A	V	Q	N	S	Y	G	G	P	E	G	F	R	K	L	V	D	E	A	H	K	K	G	L	G	V	I	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.		S							T								T										B			S	S	S				S	T	T				T	T	S	B		S	T	T																	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
											116	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.
		246	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	G	V	F	N	H	S	G	D	S	H	A	W	F	D	R	H	N	R	G	T	G	G	A	C	H	N	P	E	S	P	W	R	D	W	Y	S	F	S	D	D	G	T	A	L	D	W	L	G	Y	A	S	L	P	K	L	D	Y	Q	S	E	S	L	V	N	E	I	Y	R	G	E	D	S	I	V	R	H	W	L	K
Query Conservation
Alig confidence																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.
Template Conservation																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.
Template Sequence		D	V	V	Y	N	H	V	G	P	E	G	N	Y	M	V	K	L	G	P	Y	F	S	Q	K	Y	K	T	P	W	G	L	T	F	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	D	D	A	E	S	D	E	V	R	K	F	I	L	E	N	.	.	.	.	V	E	Y	W	I	K
Template Known Secondary structure						S				S	S	S			S	T	T	T	S			S		S	S				S	S	S					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	S	T	T	T	T	T									.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.
Template SS confidence
		187	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.					.	.	.	240	.	.
		326	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.						.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400
Predicted Secondary structure																																																														.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																														.	.	.	.	.
Query Sequence		A	P	W	N	M	D	G	W	R	L	D	V	V	H	M	L	G	E	A	G	G	A	R	N	N	M	Q	H	V	A	G	I	T	E	A	A	K	E	T	Q	P	E	A	Y	I	V	G	E	H	F	G	D	A	R	Q	W	L	Q	A	D	.	.	.	.	.	V	E	D	A	A	M	N	Y	R	G	F	T	F	P	L
Query Conservation																																																														.	.	.	.	.
Alig confidence			.																			.	.	.	.														.	.																						.	.	.	.	.										.
Template Conservation			.																			.	.	.	.														.	.																																				.
Template Sequence		E	.	Y	N	V	D	G	F	R	L	D	A	V	H	A	I	I	D	T	S	.	.	.	.	P	K	H	I	L	E	E	I	A	D	V	V	H	.	.	K	Y	N	R	I	V	I	A	E	S	D	L	N	D	P	R	V	V	N	P	K	E	K	V	G	Y	N	I	D	A	Q	W	V	D	D	.	F	H	H	S	I
Template Known Secondary structure			.	S								T	T	G	G	G					S	.	.	.	.	S	S												.	.			T									S			T	T	T	T			T	T	T	T					S							.
Template Predicted Secondary structure			.																			.	.	.	.														.	.																																				.
Template SS confidence
		243		.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.					.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.			.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.		310	.	.	.	.
		401	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.																.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.						.	460
Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.
Query SS confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.
Query Sequence		W	G	F	L	A	N	T	D	I	S	Y	D	P	Q	Q	I	D	A	Q	T	C	M	A	W	M	D	N	Y	R	A	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	S	H	Q	Q	Q	L	R	M	F	N	Q	L	D	S	H	D	T	A	R	F	K	T	L	L	G	R	.	.	.	.	.	D	I
Query Conservation																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.
Alig confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		H	A	Y	L	T	G	E	R	Q	G	Y	Y	T	D	F	G	N	L	D	D	I	V	K	S	Y	K	D	V	F	V	Y	D	G	K	Y	S	N	F	R	R	K	T	H	G	E	P	V	G	E	L	D	G	C	N	F	V	V	Y	I	Q	N	H	D	Q	V	G	N	R	G	K	G	E	R	I	I	K	L	V	D	R
Template Known Secondary structure						S				S	G	G	G	G	G													S	S		S							T	T	T	T									S			G	G	G					S								T	T	S	S				S	G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		315	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.
		461	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.																.	.	.	.	500	.	.	.	.															.	.	.	.	.	510	.
Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	R	L	P	L	A	V	V	W	L	F	T	W	P	G	V	P	C	I	Y	Y	G	D	E	V	G	L	D	G	K	N	D	P	F	C	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	K	P	F	P	W	Q	V	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	Q	D	T	A	L	F
Query Conservation																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	S	Y	K	I	A	A	A	L	Y	L	L	S	P	Y	I	P	M	I	F	M	G	E	E	Y	G	E	E	N	P	F	Y	F	F	S	D	F	S	D	S	K	L	I	Q	G	V	R	E	G	R	K	K	E	N	G	Q	D	T	D	P	Q	D	E	S	T	F	N	A	S	K	L	S	W	K	I	D	E	E	I	F
Template Known Secondary structure													T	S	S	S						T	T	G	G	G	T													S	T	T																	S		T	T	S						T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		395	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.
		512	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	L	Y	Q	R	M	I	A	L	R	K	K	S	Q	A	L	R	H	G	G	C	Q	V	L	Y	A	E	D	N	V	V	V	F	V	R	V	L	N	Q	Q	R	V	L	V	A	I	N	R	G	E	A	C	E	V	V	L	P	A	S	P	F	L	N	A	V	Q	W	Q	C	K	E	G	H	G	Q	L	T	D	G	I
Query Conservation
Alig confidence																														.						.	.	.	.																																		.	.	.
Template Conservation																														.						.	.	.	.																																		.	.	.
Template Sequence		S	F	Y	K	I	L	I	K	M	R	K	E	L	S	I	A	C	D	R	R	V	N	V	V	N	G	E	N	.	W	L	I	I	K	.	.	.	.	G	R	E	Y	F	S	L	Y	V	F	S	K	S	S	I	E	V	K	Y	S	G	T	L	L	L	S	S	N	N	S	F	P	Q	.	.	.	H	I	E	E	G	K
Template Known Secondary structure															T		S	S										S	S	.						.	.	.	.		S	S							S	S	S										B					S	S	S				S	.	.	.	B			S	S
Template Predicted Secondary structure																														.						.	.	.	.																																		.	.	.
Template SS confidence
		475	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.		.	.	.	.	.					.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540				.	.	.	.	.	.
		592	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	A	L	P	A	I	S	A	T	V	W
Query Conservation
Alig confidence					.
Template Conservation					.
Template Sequence		Y	E	F	.	D	K	G	F	A	L	Y
Template Known Secondary structure					.		S
Template Predicted Secondary structure					.
Template SS confidence
		547	.	.		550	.	.	.	.	.	.