Job Description P21517 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:38:27 GMT 2012 Rank 2 Aligned Residues 553 % Identity 35% Template c1ea9D_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: D: PDB Molecule:cyclomaltodextrinase; PDBTitle: cyclomaltodextrinase Resolution 3.2 Å

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		1	.	.	.		.	.	.	.	.	10	.	.		.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.				.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.									.																																		.	.	.
Query SS confidence						.									.																																		.	.	.
Query Sequence		M	L	N	A	.	W	H	L	P	V	P	P	F	.	V	K	Q	S	K	D	Q	L	L	I	T	L	W	L	T	G	E	D	P	P	Q	R	I	M	L	R	T	E	H	D	N	E	E	.	.	.	M	S	V	P	M	H	K	Q	R	S	Q	P	Q	P	G	V	T	A	W	R	A	A	I	D	L	S	S	G	Q	P
Query Conservation						.									.																																		.	.	.
Alig confidence						.									.																																		.	.	.																.	.	.	.
Template Conservation																																																																			.	.	.	.
Template Sequence		F	L	E	A	V	Y	H	R	P	R	K	N	F	S	Y	A	Y	N	G	T	T	V	H	L	R	I	R	T	K	K	D	D	M	T	A	V	Y	A	L	A	G	D	K	Y	M	W	D	H	T	M	E	Y	V	P	M	T	K	L	A	T	D	E	L	F	D	.	.	.	.	Y	W	E	C	E	V	T	P	P	Y	R
Template Known Secondary structure			G	G	G		B			S	B	T	T	T						T	T							B		B	T	T			S							B		T	T	S		T	T	T													S	S	B		.	.	.	.									G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																																																			.	.	.	.
Template SS confidence
		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.					.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.
		76	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.							.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																							.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																							.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	R	R	Y	S	F	K	L	L	W	H	D	R	Q	R	W	F	T	P	Q	G	F	S	R	M	P	P	A	R	L	E	Q	F	A	V	D	V	.	.	.	.	.	.	P	D	I	G	P	Q	W	A	A	D	Q	I	F	Y	Q	I	F	P	D	R	F	A	R	S	L	P	R	E	A	E	Q	D	H	V	Y	Y	H
Query Conservation																																							.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																							.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	V	K	Y	G	F	L	L	Q	Q	G	H	E	K	R	W	M	T	E	Y	D	F	L	T	E	P	P	A	N	P	D	R	L	F	E	Y	P	F	I	N	P	V	D	V	F	Q	P	P	A	W	V	K	D	A	I	F	Y	Q	I	F	P	E	R	F	A	N	G	D	T	R	N	D	P	E	G	T	L	P	W	G
Template Known Secondary structure							B				S	S	S					B		S	S				S	S			S	S	S	S	S	S								G	G	G	S					T	T	T	T	S								G	G	G	T					S		S		S	S						S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		78	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.
		150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	A	A	G	Q	E	I	I	L	R	D	W	D	E	P	V	T	A	Q	A	G	G	S	T	F	Y	G	G	D	L	D	G	I	S	E	K	L	P	Y	L	K	K	L	G	V	T	A	L	Y	L	N	P	V	F	K	A	P	S	V	H	K	Y	D	T	E	D	Y	R	H	V	D	P	Q	F	G	G	D	G	A	L
Query Conservation
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	D	P	T	P	S	C	F	F	G	G	D	L	Q	G	V	I	D	H	L	D	H	L	S	K	L	G	V	N	A	V	Y	F	T	P	L	F	K	A	T	T	N	H	K	Y	D	T	E	D	Y	F	Q	I	D	P	Q	F	G	D	K	D	T	L
Template Known Secondary structure		S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S				S	S							S						T		T	T	T	T	T	T	T														S	S	S	T	T	S		S							T	T	T
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		158																	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.
		230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.									.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.
Predicted Secondary structure																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	R	L	R	H	N	T	Q	Q	L	G	M	R	L	V	L	D	G	V	F	N	H	S	G	D	S	H	A	W	F	D	R	H	N	R	G	T	G	G	A	C	H	N	P	E	S	P	W	R	D	W	Y	S	F	S	D	.	.	.	.	.	.	.	.	D	G	T	A	L	D	W	L	G	Y	A	S	L	P	K	L
Query Conservation																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																					.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																					.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	K	L	V	D	L	C	H	E	R	G	I	R	V	L	L	D	A	V	F	N	H	S	G	R	T	F	P	P	F	V	D	V	L	K	.	.	.	.	.	.	N	G	E	K	S	K	Y	K	D	W	F	H	I	R	S	L	P	L	E	V	V	D	G	I	P	T	Y	D	T	F	A	F	E	P	L	M	P	K	L
Template Known Secondary structure										T	T	T										S	B			T	T	S									.	.	.	.	.	.		T	T	T		G	G	G	G	G	B		B	S	S	S	S				S	S	S	S		S	B		B	S	S	S		T	T		B	B	B
Template Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		222	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.							.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.
		302	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	Y	Q	S	E	S	L	V	N	E	I	Y	R	G	E	D	S	I	V	R	H	W	L	K	A	P	W	N	M	D	G	W	R	L	D	V	V	H	M	L	G	E	A	G	G	A	R	N	N	M	Q	H	V	A	G	I	T	E	A	A	K	E	T	Q	P	E	A	Y	I	V	G	E	H	F	G	D	A	R	Q	W
Query Conservation
Alig confidence																.	.	.	.								.																.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																.	.	.	.								.																.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	T	E	H	P	D	V	K	E	Y	L	L	K	A	.	.	.	.	A	E	Y	W	I	R	E	.	T	G	I	D	G	W	R	L	D	V	A	N	E	V	S	.	.	.	.	.	.	.	.	H	Q	F	W	R	E	F	R	R	V	V	K	Q	A	N	P	D	A	Y	I	L	G	E	V	W	H	E	S	S	I	W
Template Known Secondary structure			T	T	S											.	.	.	.								.		T							T	T	G	G	G	S		.	.	.	.	.	.	.	.																T	T									S			S	G	G
Template Predicted Secondary structure																.	.	.	.								.																.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		296	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.					310	.	.	.	.	.	.		.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.									.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.
		382	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	Q	A	D	V	E	D	A	A	M	N	Y	R	G	F	T	F	P	L	W	G	F	L	A	N	T	D	I	S	Y	D	P	Q	Q	I	D	A	Q	T	C	M	A	W	M	D	N	Y	R	A	G	L	S	H	Q	Q	Q	L	R	M	F	N	Q	L	D	S	H	D	T	A	R	F	K	T	L	L	G	R	D	I	A
Query Conservation
Alig confidence															.												.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation															.												.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	E	G	D	Q	F	D	A	V	M	N	Y	P	.	F	T	N	A	V	L	D	F	F	I	H	.	.	.	.	.	.	.	Q	I	A	D	A	E	K	F	S	F	M	L	G	K	Q	L	A	G	Y	P	R	Q	A	S	E	V	M	F	N	L	L	D	S	H	D	T	A	R	L	L	T	Q	A	D	G	D	K	R
Template Known Secondary structure		G	S	S	S	S		S	S					T	.	T									S	S	.	.	.	.	.	.	.			S		T	T													S												S	S		T	T	S							T	T	S
Template Predicted Secondary structure															.												.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		363	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.		.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.								.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.
		462	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Predicted Secondary structure																																																																																	.
Query SS confidence																																																																																	.
Query Sequence		R	L	P	L	A	V	V	W	L	F	T	W	P	G	V	P	C	I	Y	Y	G	D	E	V	G	L	D	G	K	N	D	P	F	C	R	K	P	F	P	W	Q	V	E	K	Q	D	T	A	L	F	A	L	Y	Q	R	M	I	A	L	R	K	K	S	Q	A	L	R	H	G	G	C	Q	V	L	Y	A	E	D	N	.
Query Conservation																																																																																	.
Alig confidence																																																																																	.
Template Conservation
Template Sequence		K	M	K	L	A	V	L	F	Q	F	T	Y	F	G	T	P	C	I	Y	Y	G	D	E	V	G	L	D	G	G	H	D	P	G	C	R	K	C	M	E	W	D	E	T	K	H	D	K	D	L	F	A	F	Y	Q	T	V	I	R	L	R	Q	A	H	A	A	L	R	T	G	T	F	K	F	L	T	A	E	K	N	S
Template Known Secondary structure													S	S	S						T	T	T	T	T			S			S	T	T	S	S								T	T	T																				T					S									T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		435	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.
			541	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.				.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.
Predicted Secondary structure		.																								.	.	.
Query SS confidence		.																								.	.	.
Query Sequence		.	V	V	V	F	V	R	V	L	N	Q	Q	R	V	L	V	A	I	N	R	G	E	A	C	.	.	.	E	V	V	L	P	A	S	P	F	L	N	A	V	Q	W	Q	C	K	E	G	H	G	Q	L	T	D	G	I	L	A	L	P	A	I	S	A	T	V	W
Query Conservation		.																								.	.	.
Alig confidence		.																								.	.	.																										.	.
Template Conservation																																																						.	.
Template Sequence		R	Q	I	A	Y	L	R	E	D	D	Q	D	T	I	L	V	V	M	N	N	D	K	A	G	H	T	L	T	L	P	V	R	H	A	Q	W	T	H	L	W	Q	D	D	V	L	T	A	A	H	G	Q	L	.	.	T	V	K	L	P	A	Y	G	F	A	V	L
Template Known Secondary structure											T	T											T	T										S	S	S						S	S	S								S	S	.	.	S							T	T
Template Predicted Secondary structure																																																						.	.
Template SS confidence
		515	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.			.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.