Job Description P00547 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 10:56:41 GMT 2012 Rank 19 Aligned Residues 299 % Identity 19% Template c2aj4B_ PDB info PDB header:transferase Chain: B: PDB Molecule:galactokinase; PDBTitle: crystal structure of saccharomyces cerevisiae galactokinase2 in complex with galactose and mg:amppnp Resolution 2.40 Å

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		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.						.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.																				.	.	.	.
Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence													.	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	Y	A	P	A	S	S	A	N	M	S	.	.	.	.	.	V	G	F	D	V	L	G	A	A	V	T	P	V	D	G	A	L	L	G	D	V	V	T	V	E	A	A	E	T	F	S	L	N	N	L	G	R	F	A	D	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	P	S	E
Query Conservation													.	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence													.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	R	S	P	G	R	V	N	L	I	G	E	H	I	D	Y	C	D	F	S	V	L	P	L	A	I	D	F	D	M	L	.	.	.	.	.	.	C	A	V	K	V	L	N	E	K	N	P	S	I	T	L	I	N	A	D	P	K	F	A	Q	R	K	F	D	L	P	L	D	G	S	Y	V	T	I	D	P	S	V	S
Template Known Secondary structure													T	T		G	G	G	T			B											.	.	.	.	.	.									S	S								S	S	T	T	S									T	T								T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		48	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.							.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.
		60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.											.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110				.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.
Query SS confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.
Query Sequence		P	R	E	N	I	V	Y	Q	C	W	E	R	F	C	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	L	G	K	Q	I	P	V	A	M	T	L	E	K	N	M	P	I	G	S	G	L	G	S	S	A	C	S	V	V	A	A	L	M	A	M	.	.	.	N	E	H	C	G	K	P	L	N	D	T	R	L	L	A	L
Query Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	W	S	N	Y	F	K	C	G	L	H	V	A	H	S	F	L	K	K	L	A	P	E	R	F	A	S	A	P	L	A	G	L	Q	V	F	C	E	G	D	V	P	T	G	S	G	L	S	S	S	A	A	F	I	C	A	V	A	L	A	V	V	K	A	N	M	G	P	G	Y	H	M	S	K	Q	N	L	M	R	I
Template Known Secondary structure																											S	S	S													S		T	T	S	S	S																					T	T				B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		122	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.
		127	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.				.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.					.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.																					.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																								.	.	.																					.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	G	E	L	E	G	R	I	S	G	S	I	H	Y	D	N	V	A	P	C	F	L	.	.	.	G	G	M	Q	L	M	I	E	E	N	D	I	I	S	Q	Q	V	P	G	F	.	.	.	.	D	E	W	L	W	V	L	A	Y	P	G	I	K	V	S	T	A	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																								.	.	.																					.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																								.	.	.																					.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	V	V	A	E	H	Y	V	G	V	N	N	G	G	M	D	Q	A	A	S	V	C	G	E	E	D	H	A	L	Y	V	E	F	K	P	Q	L	K	A	T	P	F	K	F	P	Q	L	K	N	H	E	I	S	F	V	I	A	N	T	L	V	V	S	N	K	F	E	T	A	P	T	N	Y	N	L	R	V	V	E	V
Template Known Secondary structure			T	T	G	G	G	G	G	T					S										B	T	T	B							S	S	S												S	S																T	T	T	T	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		202	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.
				187	.	.	190	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	A	R	A	I	L	P	A	Q	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	T	A	A	N	V	L	A	A	T	Y	G	V	V	L	L	N	K	G	N	L	R	D	F	M	N	V	Y	Y	A	R	Y	H	N	I	S	T	P	W	N	G	D	I	E	S	G	I	E	R	L	T	K	M	L	V	L	V	E	E	S	L	A	N	K	K	Q	G	F	S	V	D	D	V	A	Q	S	L	N	C	S
Template Known Secondary structure													T																				T	S				S																								T	G	G	G	T	T		B										T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		282	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.
																									196	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.			.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.			.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.																			.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.																			.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	R	Q	D	C	I	A	H	G	R	H	L	A	G	F	I	H	A	C	Y	S	R	Q	.	.	P	E	L	A	A	K	L	M	K	D	V	I	A	E	P	Y	R	E	.	.	R	L	L	P	G	F	R	Q	A	R	Q	A
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.																			.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.																			.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	E	E	F	T	R	D	Y	L	T	T	S	P	V	R	F	Q	V	L	K	L	Y	Q	R	A	K	H	V	Y	S	E	S	L	R	V	L	K	A	V	K	L	M	T	T	D	E	D	F	F	K	Q	F	G	A	L	M	N	E	S	Q	A	S	C	D	K	L	Y	E	C	S	C	P	E	I	D	K	I	C	S	I
Template Known Secondary structure											S	S	S					S		B																																															T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		249	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.			.	.	.	.	.	.	.	270	.			.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.										.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.										.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																.	.										.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	A	E	I	G	A	V	A	S	G	I	S	G	S	.	.	G	P	T	L	F	A	L	C	D	.	.	K	P	E	T	A	Q	R	V	A	D	W	L	G	K	N	Y	L	Q	N	Q	E	G	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	H	I	C	R	L	D	T	A	G	A	R	V	L	E
Query Conservation																.	.										.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.										.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.							.
Template Conservation																																																																			.
Template Sequence		A	L	S	N	G	S	Y	G	S	R	L	T	G	A	G	W	G	G	C	T	V	H	L	V	P	G	G	P	N	G	N	I	E	K	V	K	E	A	L	A	N	E	F	Y	K	V	K	Y	P	K	I	T	D	A	E	L	E	N	A	I	I	V	S	K	P	.	A	L	G	S	C	L	Y	E
Template Known Secondary structure				T	T	T		S						T	T		S	S	S									S	T	T														T					S	T	T																.				S
Template Predicted Secondary structure																																																																			.
Template SS confidence
		455	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.		520	.	.	.	.	.	.	.