Job Description P09152 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:02:00 GMT 2012 Rank 8 Aligned Residues 777 % Identity 21% Template c1ogyA_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:periplasmic nitrate reductase; PDBTitle: crystal structure of the heterodimeric nitrate reductase2 from rhodobacter sphaeroides Resolution 3.2 Å

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		44	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	I	V	R	S	T	H	G	V	N	C	T	G	S	C	S	W	K	I	Y	V	K	N	G	L	V	T	W	E	T	Q	Q	T	D	Y	P	R	T	R	P	D	L	P	N	H	E	P	R	G	C	P	R	G	A	S	Y	S	W	Y	L	Y	S	A	N	R	L	K	Y	P	M	M	R	K	R	L	M	K	M	W	R
Query Conservation
Alig confidence										.																																.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation										.																																.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	W	S	K	A	P	C	R	.	F	C	G	T	G	C	G	V	M	V	G	T	R	D	G	Q	V	V	A	T	H	G	D	T	Q	A	E	V	N	R	G	.	.	.	.	.	.	.	L	N	C	V	K	G	Y	F	L	S	K	I	M	Y	G	E	D	R	L	T	T	P	L	L	R	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure									S	.	S		S	S										T	T									T	T		T	T	T	S	S	.	.	.	.	.	.	.								G	G	G	G	S	T	T		T	T				S				S	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure										.																																.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		13	.	.	.	.	.	.	20		.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.								.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.
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Predicted Secondary structure																															.	.	.
Query SS confidence																															.	.	.
Query Sequence		E	A	K	A	L	H	S	D	P	V	E	A	W	A	S	I	I	E	D	A	D	K	A	K	S	F	K	Q	A	.	.	.	R	G	R	G	G	F	V	R	S	S	W	Q	E	V	N	E	L	I	A	A	S	N	V	Y	T	I	K	N	Y	G	P	D	R	V	A	G	F	S	P	I	P	A	M	S	M	V	S	Y
Query Conservation																															.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	K	D	G	V	Y	H	K	E	G	E	F	A	P	V	S	W	D	E	A	F	D	V	M	A	A	Q	A	K	L	V	L	K	E	K	A	P	E	A	V	G	M	F	G	S	G	Q	W	T	I	W	E	G	Y
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S	S				T	T																										T		G	G	G							T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																												77	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130
		201	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.			.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.			.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																											.	.																																															.	.
Query SS confidence																											.	.																																															.	.
Query Sequence		A	S	G	A	R	Y	L	S	L	I	G	G	T	C	L	S	F	Y	D	W	Y	C	D	L	P	.	.	P	A	S	P	Q	T	W	G	E	Q	T	D	V	P	E	S	A	D	W	Y	N	S	S	Y	I	I	A	W	G	S	N	V	P	Q	T	R	T	P	D	A	H	F	F	T	E	V	.	.	R	Y	K	G	T
Query Conservation																											.	.																																															.	.
Alig confidence																											.	.																																															.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	A	S	K	L	M	R	A	G	F	R	S	N	N	L	D	P	N	A	R	H	C	M	A	S	A	A	T	A	F	M	R	T	F	G	M	D	E	P	M	G	C	Y	D	D	F	E	A	A	D	A	F	V	L	W	G	S	N	M	A	E	M	H	P	I	L	W	S	R	L	T	D	R	R	L	S	H	E	H	V
Template Known Secondary structure									T	T	S								T					T												S	S		S		S	S		T	T						S						S							S														S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		131	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210
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Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	T	V	A	V	T	P	D	Y	A	E	I	A	K	L	C	D	L	W	L	A	P	K	Q	G	T	D	A	A	M	A	L	A	M	G	H	V	M	L	R	E	F	H	L	D	N	P	S	Q	Y	F	T	D	Y	V	R	R	Y	T	D	M	P	M	L	V	M	L	E	E	R	D	G	Y	Y	A	A	G	R	M	L
Query Conservation
Alig confidence																																																.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	V	A	V	L	S	T	F	T	H	R	S	S	D	L	S	D	T	P	I	I	F	R	P	G	T	D	R	A	I	L	N	Y	I	A	H	H	I	I	S	T	G	R	V	N	R	.	.	.	.	.	.	D	F	V	D	R	H	T	N	F	A	L	G	A	T	D	I	G	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure								S	S	B		G	G	G	G	S		S							T	T	T															T	T					.	.	.	.	.	.														S	S			T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		211	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.							.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.
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Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	A	A	D	L	V	D	A	L	G	Q	E	N	N	P	E	W	K	T	V	A	F	N	T	N	G	E	M	V	A	P	N	G	S	I	G	F	R	W	G	E	K	G	K	W	N	L	E	Q	R	D	G	K	T	G	E	E	T	E	L	Q	L	S	L	L	G	S	Q	D	E	I	A	E	V	G	F	P	Y	F	G
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		437	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	D	G	T	E	H	F	N	K	V	E	L	E	N	V	L	L	H	K	L	P	V	K	R	L	Q	L	A	D	G	S	T	A	L	V	T	T	V	Y	D	L	T	L	A	N	Y	G	L	E	R	G	L	N	D	V	N	C	A	T	S	Y	D	D	V	K	A	Y	T	P	A	W	A	E	Q	I	T	G	V	S	R
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	L	R	P	E	H	Q	L	Q	L	A	A	K	G	A	A	D	A	G	A	M	T	P	T	D	F	E	T	F	A	A	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	S	E	Y	T	L	E	K	A	A	E	I	S	G	V	E	P
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T			T	T	S					S		T	T		S	S		S				B										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
															275	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.
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Predicted Secondary structure																																																																																	.
Query SS confidence																																																																																	.
Query Sequence		S	Q	I	I	R	I	A	R	E	F	A	D	N	A	D	K	T	H	G	R	S	M	I	I	V	G	A	G	L	N	H	W	Y	H	L	D	M	N	Y	R	G	L	I	N	M	L	I	F	C	G	C	V	G	Q	S	G	G	G	W	A	H	Y	V	G	Q	E	K	L	R	P	Q	T	G	W	Q	P	L	A	F	.
Query Conservation																																																																																	.
Alig confidence														.	.	.	.																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.											.
Template Conservation														.	.	.	.																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	L	L	E	E	L	A	E	L	Y	A	D	.	.	.	.	P	D	R	K	W	M	S	L	W	T	M	G	F	N	Q	H	V	R	G	V	W	A	N	H	M	V	Y	N	L	H	L	L	T	G	K	I	S	E	P	G	N	S	P	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	L	T	G	Q	P	F	A	C	G	T
Template Known Secondary structure											T	T	S	.	.	.	.	T	T	S							S					S	S	T	T																T			S	B	T	T	B				.	.	.	.	.	.	.	.	.					S	T	T	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure														.	.	.	.																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		324	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.					.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.										380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390
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Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	L	D	W	Q	R	P	A	R	H	M	N	S	T	S	Y	F	Y	N	H	S	S	Q	W	R	Y	E	T	V	T	A	E	E	L	L	S	P	M	A	D	K	S	R	Y	T	G	H	L	I	D	F	N	V	R	A	E	R	M	G	W	L	P	S	A	P	Q	L	G	T	N	P	L	T	I	A	G	E	A	E	K
Query Conservation
Alig confidence																																		.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																		.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	R	E	V	G	T	F	A	H	R	L	P	A	D	M	V	V	T	N	P	E	H	R	A	H	A	E	E	I	W	K	L	.	.	.	.	P	A	G	L	L	P	D	W	V	G	A	H	A	V	E	Q	D	R	K	L	H	D	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure						T		S	T	T			T	T	T			S	S												T	T		.	.	.	.		T	T		S			S															T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		391	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.					.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.
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Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	G	M	N	P	V	D	Y	T	V	K	S	L	K	E	G	S	I	R	F	A	A	E	Q	P	E	N	G	K	N	H	P	R	N	L	F	I	W	R	S	N	L	L	G	S	S	G	K	G	H	E	F	M	L	K	Y	L	L	G	T	E	H	G	I	Q	G	K	D	L	G	Q	Q	G	G	V	K	P	E	E	V
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	I	N	F	Y	W	V	Q	V	N	N	N	M	Q	A	A	P	N	I	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S								S							S	T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																446	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.
		756	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	W	Q	D	N	G	L	E	G	K	L	D	L	V	V	T	L	D	F	R	L	S	S	T	C	L	Y	S	D	I	I	L	P	T	A	T	W	Y	E	K	D	D	M	N	T	S	D	M	H	P	F	I	H	P	L	S	A	A	V	D	P	A	W	E	A	K	S	D	W	E	I	Y	K	A	I	A	K	K	F	S
Query Conservation
Alig confidence																																												.
Template Conservation																																												.
Template Sequence		Q	E	T	Y	P	G	Y	R	N	P	E	N	F	I	V	V	S	D	A	Y	P	T	V	T	G	R	A	A	D	L	V	L	P	A	A	M	W	V	E	K	E	G	.	A	Y	G	N	A	E	R	R	T	H	F	W	H	Q	L	V	E	A	P	G	E	A	R	S	D	L	W	Q	L	M	E	F	S	K	R	F	T
Template Known Secondary structure											T	T								S	S							T	S	S					B			G	G	G	S			.					T	T	S							B		S			S	T	T		B											T	T
Template Predicted Secondary structure																																												.
Template SS confidence
		466	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.		.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.
		836	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	V	C	V	G	H	L	G	K	E	T	D	I	V	T	L	P	I	Q	H	D	S	A	A	E	L	A	Q	P	L	D	V	K	D	W	K	K	G	E	C	D	L	I	P	G	K	T	A	P	H	I	M	V	V	E	R	D	Y	P	A	T	Y	E	R	F	T	S	I	G	P	L	M	E	K	I	G	N	G	G	K
Query Conservation
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	D	E	V	W	P	E	E	I	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure						S						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		545	.	.	.	.	550	.	.	.	.
		916	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960	.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	I	A	W	N	T	Q	S	E	M	D	L	L	R	K	L	N	Y	T	K	A	E	G	P	A	K	G	Q	P	M	L	N	T	A	I	D	A	A	E	M	I	L	T	L	A	P	E	T	N	G	Q	V	A	V	K	A	W	A	A	L	S	E	F	T	G	R	D	H	T	H	L	A	L	N	K	E	D	E	K	I
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	S	A	A	P	A	Y	R	G	K	T	L	F	E	V	L	F	A	N	G	S	V	D	R	F	P	A	S	D	V	N	P	D	H	A	N	H	E	A	A	L	F	G	F	Y	P	Q	K	G	L	F	E	E	Y	A	A	F	G	R	G	H	G	H	D	L	A	P	F	D	T	Y	H	E	V	R	G	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.				S	S	S	S	S			T	T	T	T	T	T		S	S	S	S	S		S	B	S	S	S	S		S	S	S	B						S	S	S	B												T	T	S	S	S	S	S						T	T					S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.
Template SS confidence
						555	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630
		996	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1070	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	F	R	D	I	Q	A	Q	P	R	K	I	I	S	S	P	T	W	S	G	L	E	D	E	H	V	S	Y	N	A	G	Y	T	N	V	H	E	L	I	P	W	R	T	L	S	G	R	Q	Q	L	Y	Q	D	H	Q	W	M	R	D	F	G	E	S	L	L	V	Y	R	P	P	I	D	T	R	S	V	K	E	V	I
Query Conservation
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.
Template Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.
Template Sequence		H	W	P	V	V	E	G	E	E	T	R	W	R	Y	R	E	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	D	P	Y	V	K	P	G	E	G	L	R	F	Y	G	K	P	D	G	R	A	V	I	L	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	P	Y	E	P	P	A	E	S	P	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			S			B	T	T	B			S	S	S	S	B	B	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	B	T	T	S		S	S		S	B			T	T	S	S	S								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							S	S			.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		631	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.											.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.													.	.	.	.	.	.	.	680	.	.
		1076	.	.	.	1080	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1100	.		.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1150	.			.
Predicted Secondary structure																												.																																																			.	.
Query SS confidence																												.																																																			.	.
Query Sequence		G	Q	K	S	N	G	N	Q	E	K	A	L	N	F	L	T	P	H	Q	K	W	G	I	H	S	T	.	Y	S	D	N	L	L	M	L	T	L	G	R	G	G	P	V	V	W	L	S	E	A	D	A	K	D	L	G	I	A	D	N	D	W	I	E	V	F	N	S	N	G	A	L	T	A	R	A	V	V	.	.	S
Query Conservation																												.																																																			.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																					.																																																			.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	D	E	E	F	G	F	W	L	V	T	G	R	V	L	E	H	W	H	S	G	S	M	T	L	R	W	P	E	L	Y	K	A	F	P	G	A	V	C	F	M	H	P	E	D	A	R	S	R	G	L	N	R	G	S	E	V	R	V	I	S	R	R	G	E	I	R	T	R	L	E	T	R	G	R
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.		S	S	S									B	T	T	B		T	T		T	T	G	G	G	S							S		S													T	T			T	T								S	S									S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
								683	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.
		1153	.	.	.	.	.	.	1160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1220	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	R	V	P	A	G	M	T	M	M	Y	H	A	Q	E	R	I	V	N	L	P	G	S	E	I	T	Q	Q	R	G	G	I	H	N	S	V	T	R	I	T	P	K	P	T	H	M	I	G	G	Y	A	H	L	A	Y	G	F	N	Y	Y	G	T	V	G	S	N	R	D	E	F	V	V	V	R
Query Conservation
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	R	M	P	R	G	V	V	F	V	P	W	F	D	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	Q	L	I	N	K	V	T	L	D	A	N	D	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	S	R	Q	T	D	F	K	K	C	A	V	K	I	E
Template Known Secondary structure		S	B			T	T									S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S		G	G	G	T	S				B		T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T			B			S
Template Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		757	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.															.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800