Job Description P09152 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:02:00 GMT 2012 Rank 10 Aligned Residues 725 % Identity 28% Template c1h5nC_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: C: PDB Molecule:dmso reductase; PDBTitle: dmso reductase modified by the presence of dms and air Resolution 2.0 Å

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		48	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.		60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure														.
Query SS confidence														.
Query Sequence		S	T	H	G	V	N	C	T	G	S	C	S	.	W	K	I	Y	V	K	N	G	L	V	T	W	E	T	Q	Q	T	D	Y	P	R	T	R	P	D	L	P	N	H	E	P	R	G	C	P	R	G	A	S	Y	S	W	Y	L	Y	S	A	N	R	L	K	Y	P	M	M	R	K	R	L	M	K	M	W	R	E	A	K
Query Conservation														.
Alig confidence														.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	N	G	T	V	M	S	G	S	H	W	G	V	F	T	A	T	V	E	N	G	R	A	T	A	F	T	P	W	E	K	D	P	H	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	P	M	L	A	G	V	L	D	S	I	Y	S	P	T	R	I	K	Y	P	M	V	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure											T	T									T	T									T	T		S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T										S	T	T	B			S					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.												.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.
		127	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200				.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																												.	.	.
Query SS confidence																																																																												.	.	.
Query Sequence		A	L	H	S	D	P	V	E	A	W	A	S	I	I	E	D	A	D	K	A	K	S	F	K	Q	A	R	G	R	G	G	F	V	R	S	S	W	Q	E	V	N	E	L	I	A	A	S	N	V	Y	T	I	K	N	Y	G	P	D	R	V	A	G	F	S	P	I	P	A	M	S	M	V	S	Y	.	.	.	A	S	G
Query Conservation																																																																												.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																															.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	E	F	L	E	K	G	V	N	A	D	R	S	T	R	G	N	G	D	F	V	R	V	S	W	D	Q	A	L	D	L	V	A	A	E	V	K	R	V	E	E	T	Y	G	P	E	G	V	F	G	G	S	Y	G	W	K	S	P	G	R	L	H	N	C	T	T	L	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							G	G	G	S		G	G	G	T	T	S																												G	G	G													S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
														62	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		204	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.		.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.					.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.									.	.	.	.	.	.	.	270
Predicted Secondary structure																				.														.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																				.														.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	R	Y	L	S	L	I	G	G	T	C	L	S	F	Y	D	W	Y	.	C	D	L	P	P	A	S	P	Q	T	W	G	E	.	.	.	.	Q	T	D	V	P	E	S	A	D	W	Y	N	S	S	Y	I	I	A	W	G	S	N	V	P	Q	T	R	T	.	.	.	.	.	.	.	.	P	D	A	H	F	F	T	E
Query Conservation																				.														.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																				.														.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	R	M	L	T	L	A	G	G	Y	V	N	G	A	G	D	Y	S	T	G	A	A	Q	V	I	M	P	H	V	V	G	T	L	E	V	Y	E	Q	Q	T	A	W	P	V	L	A	E	N	T	E	V	M	V	F	W	A	A	D	P	I	K	T	S	Q	I	G	W	V	I	P	E	H	G	A	Y	P	G	L	E	A
Template Known Secondary structure								T	T			B	B			S		S	S	S	T	T									T	S	S			T	T	S			S										S						S							T	T			S	S	B				T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		271	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290		.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.
Query SS confidence																						.
Query Sequence		V	R	Y	K	G	T	K	T	V	A	V	T	P	D	Y	A	E	I	A	K	.	L	C	D	L	W	L	A	P	K	Q	G	T	D	A	A	M	A	L	A	M	G	H	V	M	L	R	E	F	H	L	D	N	P	S	Q	Y	F	T	D	Y	V	R	R	Y	T	D	M	P	M	L	V	M	L	E	E	R	D	G	Y
Query Conservation																						.
Alig confidence																						.																																	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																							.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	K	A	K	G	T	K	V	I	V	I	D	P	V	R	T	K	T	V	E	F	F	G	A	E	H	I	T	P	K	P	Q	T	D	V	A	I	M	L	G	M	A	H	T	L	V	A	E	D	L	Y	D	K	.	.	.	.	.	.	D	F	I	A	N	Y	T	S	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure					T	T								S	B									T								T	T																T	T		S			.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																							.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.							.	.	.	.	.	.	.	270	.
		350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	A	A	G	R	M	L	R	A	A	D	L	V	D	A	L	G	Q	E	N	N	P	E	W	K	T	V	A	F	N	T	N	G	E	M	V	A	P	N	G	S	I	G	F	R	W	G	E	K	G	K	W	N	L	E	Q	R	D	G	K	T	G	E	E	T	E	L	Q	L	S	L	L	G	S	Q	D	E	I	A	E
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	G	F	P	Y	F	G	G	D	G	T	E	H	F	N	K	V	E	L	E	N	V	L	L	H	K	L	P	V	K	R	L	Q	L	A	D	G	S	T	A	L	V	T	T	V	Y	D	L	T	L	A	N	Y	G	L	E	R	G	L	N	D	V	N	C	A	T	S	Y	D	D	V	K	A	Y	T	P	A	W	A	E
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	D	K	F	L	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	L	D	G	E	T	D	S	T	P	K	T	A	E	W	A	E
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T	T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																															272	.	.	.	.	.													.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.
		510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	I	T	G	V	S	R	S	Q	I	I	R	I	A	R	E	F	A	D	N	A	D	K	T	H	G	R	S	M	I	I	V	G	A	G	L	N	H	W	Y	H	L	D	M	N	Y	R	G	L	I	N	M	L	I	F	C	G	C	V	G	Q	S	G	G	G	W	A	H	Y	V	G	Q	E	K	L	R	P	Q	T	G
Query Conservation
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.																																																						.
Template Conservation																						.	.	.	.	.	.																																																						.
Template Sequence		G	I	S	G	V	P	A	E	T	I	K	E	L	A	R	L	F	E	S	K	.	.	.	.	.	.	R	T	M	L	A	A	G	W	S	M	Q	R	M	H	H	G	E	Q	A	H	W	M	L	V	T	L	A	S	M	L	G	Q	I	G	L	P	G	G	G	F	G	L	S	Y	H	Y	S	G	G	G	T	P	S	.
Template Known Secondary structure						S															S	.	.	.	.	.	.								S	G	G	G	S	S	T	T	T															T		T	T	S	T	T					S		T	T	S	T	T	T	T	S			.
Template Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.																																																						.
Template SS confidence
		295	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.							.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.
		590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	Q	P	L	A	F	A	L	D	W	Q	R	P	A	R	H	M	N	S	T	S	Y	F	Y	N	H	S	S	Q	W	R	Y	E	T	V	T	A	E	E	L	L	S	P	M	A	D	K	S	R	Y	T	G	H	L	I	D	F	N	V	R	A	E	R	M	G	W	L	P	S	A	P	Q	L	G	T	N	P	L	T	I
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S	G	P	A	L	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																																											368	.	370	.	.	.	.
		670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	G	E	A	E	K	A	G	M	N	P	V	D	Y	T	V	K	S	L	K	E	G	S	I	R	F	A	A	E	Q	P	E	N	G	K	N	H	P	R	N	L	F	I	W	R	S	N	L	L	G	S	S	G	K	G	H	E	F	M	L	K	Y	L	L	G	T	E	H	G	I	Q	G	K	D	L	G	Q	Q	G	G
Query Conservation
Alig confidence																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	I	T	D	G	G	A	S	V	I	P	V	A	R	V	V	D	M	L	E	N	P	G	A	E	F	D	F	N	G	T	R	S	K	F	P	D	V	K	M	A	Y	W	V	G	G	N	P	F	V	H	H	Q	D	R	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure										B			G	G	G								T	T						T	T															S							S	S				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		375	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430
		750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.			.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																							.	.
Query SS confidence																																																							.	.
Query Sequence		V	K	P	E	E	V	D	W	Q	D	N	G	L	E	G	K	L	D	L	V	V	T	L	D	F	R	L	S	S	T	C	L	Y	S	D	I	I	L	P	T	A	T	W	Y	E	K	D	D	M	N	T	S	D	.	.	M	H	P	F	I	H	P	L	S	A	A	V	D	P	A	W	E	A	K	S	D	W	E	I	Y
Query Conservation																																																							.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																																														.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	R	M	V	K	A	W	E	K	L	E	T	F	V	V	H	D	F	Q	W	T	P	T	A	R	H	A	D	I	V	L	P	A	T	T	S	Y	E	R	N	D	I	E	T	I	G	D	Y	S	N	T	G	I	L	A	M	K	K	I	V	E	P	L	Y	E	A	R	S	D	Y	D	I	F
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.						G	G	G		S							S	B							T		S					B			G	G	G	S								T	T	T											S				T	T		B
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
										444	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.
		828	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	A	I	A	K	K	F	S	E	V	C	V	G	H	L	G	K	E	T	D	I	V	T	L	P	I	Q	H	D	S	A	A	E	L	A	Q	P	L	D	V	K	D	W	K	K	G	E	C	D	L	I	P	G	K	T	A	P	H	I	M	V	V	E	R	D	Y	P	A	T	Y	E	R	F	T	S	I	G	P	L	M
Query Conservation
Alig confidence																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	A	V	A	E	R	L	G	K	G	A	E	F	T	E	G	K	D	E	M	G	W	I	K	S	F	Y	D	D	A	A	K	Q	G	K	A	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure								T	T							T	T																					T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		516	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.
		908	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960	.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	K	I	G	N	G	G	K	G	I	A	W	N	T	Q	S	E	M	D	L	L	R	K	L	N	Y	T	K	A	E	G	P	A	K	G	Q	P	M	L	N	T	A	I	D	A	A	E	M	I	L	T	L	A	P	E	T	N	G	Q	V	A	V	K	A	W	A	A	L	S	E	F	T	G	R	D	H	T	H	L	A
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	V	Q	M	P	A	F	D	A	F	W	A	E	G	I	V	E	F	P	V	T	D	G	A	D	F	V	R	Y	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T													S							S	S	G	G	G			T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																				553	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.
		988	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.	.	.	.	.			.	.	1060	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																								.	.
Query SS confidence																																																																								.	.
Query Sequence		L	N	K	E	D	E	K	I	R	F	R	D	I	Q	A	Q	P	R	K	I	I	S	S	P	T	W	S	G	L	E	D	E	H	V	S	Y	N	A	G	Y	T	N	V	H	E	L	I	P	W	R	T	L	S	G	R	Q	Q	L	Y	Q	D	H	Q	W	M	R	D	F	G	E	.	.	S	L	L	V	Y	R	P	P
Query Conservation																																																																								.	.
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.
Template Conservation								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	F	R	E	D	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	L	N	P	L	G	T	P	T	G	L	I	E	I	Y	S	K	N	I	E	K	M	G	Y	D	D	C	P	A	H	P	T	W	M	E	P
Template Known Secondary structure							T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	S			S	S	T	T	S	S			S	S								T		T	T	S		S	S
Template Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		583	.	.	.	.	.																																							.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.
		1066	.	.	.	1070	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1080	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1100	.	.	.	.	.		.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1140	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																										.
Query SS confidence																																										.
Query Sequence		I	D	T	R	S	V	K	E	V	I	G	Q	K	S	N	G	N	Q	E	K	A	L	N	F	L	T	P	H	Q	K	W	G	I	H	S	T	Y	S	D	N	.	L	L	M	L	T	L	G	R	G	G	P	V	V	W	L	S	E	A	D	A	K	D	L	G	I	A	D	N	D	W	I	E	V	F	N	S	N	G	A
Query Conservation																																										.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.
Template Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	E	R	L	D	G	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	A	K	Y	P	L	H	I	A	A	S	H	P	F	N	R	L	H	S	Q	L	N	G	T	V	L	R	E	G	Y	A	V	Q	G	H	E	P	C	L	M	H	P	D	D	A	A	A	R	G	I	A	D	G	D	V	V	R	V	H	N	D	R	G	Q
Template Known Secondary structure		S	S		T	T		T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T			S	S									S	S	S	B	T	T	B	T	T	T	S	G	G	G	G	G	T		B	T	T	B													T	T			T	T								S	S
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		625	.	.	.	.	630	.										.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.
		1145	.	.	.	.	1150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1190	.	.		.	.	.	.	.	.	.	1200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1220	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																		.
Query SS confidence																																																		.
Query Sequence		L	T	A	R	A	V	V	S	Q	R	V	P	A	G	M	T	M	M	Y	H	A	Q	E	R	I	V	N	L	P	G	S	E	I	T	Q	Q	R	G	G	I	H	N	S	V	T	R	I	T	.	P	K	P	T	H	M	I	G	G	Y	A	H	L	A	Y	G	F	N	Y	Y	G	T	V	G	S	N	R	D	E	F	V
Query Conservation																																																		.
Alig confidence																																																		.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	L	T	G	V	K	V	T	D	A	V	M	K	G	V	I	Q	I	Y	E	G	G	W	Y	D	P	S	D	V	T	E	P	G	T	L	D	K	Y	G	D	V	N	V	L	S	A	D	I	G	T	S	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	A	Q	G	N	C	G	Q	T	V	L	A
Template Known Secondary structure										T	T	B		T	T						T	T					B	S		T	T	S	T	T			B	S	S			G	G	G	S	S					S		T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T					T	T
Template Predicted Secondary structure																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		696	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		1224	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	V	R	K	M	K
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		E	V	E	K	Y	T
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		760	.	.	.	.	.