Job Description P06149 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 10:59:07 GMT 2012 Rank 15 Aligned Residues 414 % Identity 13% Template c3popD_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: D: PDB Molecule:gilr oxidase; PDBTitle: the crystal structure of gilr, an oxidoreductase that catalyzes the2 terminal step of gilvocarcin biosynthesis Resolution 1.65 Å

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		27	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	D	P	A	K	T	A	R	Y	R	K	G	F	R	S	G	Q	G	D	A	L	A	V	V	F	P	G	S	L	L	E	L	W	R	V	L	K	A	C	V	T	A	D	K	I	I	L	M	Q	A	A	N	T	G	L	T	E	G	S	T	P	N	G	N	D	Y	D	R	D	V	V	I	I	S	T	L	R	L	D	K
Query Conservation
Alig confidence																																																																	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	D	P	R	Y	I	E	L	S	H	S	D	N	H	R	F	V	V	E	P	E	E	F	F	L	P	A	T	P	D	D	V	V	A	S	L	Q	K	A	V	T	E	G	R	G	V	A	C	R	S	G	G	H	C	G	Q	D	F	V	G	T	P	R	.	.	.	.	.	R	D	L	V	L	D	L	H	N	L	H	A
Template Known Secondary structure		T	S	T	T					T			S	S	T	T	S					S						S	S														T	T							S	S				S	S	S	T	T	T	S	S		.	.	.	.	.		S						T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		13	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.						.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.
		107	.	.	110	.	.	.		.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.
Query SS confidence									.
Query Sequence		L	H	V	L	G	K	G	.	E	Q	V	L	A	Y	P	G	T	T	L	Y	S	L	E	K	A	L	K	P	L	G	R	E	P	H	S	V	I	G	S	S	C	I	G	A	S	V	I	G	G	I	C	N	N	S	G	G	S	L	V	Q	R	G	P	A	Y	T	E	M	S	L	F	A	R	I	N	E	D	G	K	L
Query Conservation									.
Alig confidence			.						.																																		.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation			.																																								.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	.	G	P	A	A	D	G	A	G	V	R	V	G	S	G	A	T	V	D	Q	V	Q	K	A	L	F	R	R	W	N	A	A	L	P	L	G	A	C	S	A	.	.	V	G	M	G	G	L	V	A	G	G	G	Y	G	P	L	S	R	Q	L	G	L	V	V	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			.				S	S	S	S	S					T	T		B													S	B						S	B	T	T	.	.		B												T	T							G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure			.																																								.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		88		.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.			.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.
		186	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	L	V	N	H	L	G	I	D	L	G	E	T	P	E	Q	I	L	S	K	L	D	D	D	R	I	K	D	D	D	V	R	H	D	G	R	H	A	H	D	Y	D	Y	V	H	R	V	R	D	I	E	A	D	T	P	A	R	Y	N	A	D	P	D	R	L	F	E	S	S	G	C	A	G	K	L	A	V	F	A	V
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.
Template Conservation		.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.
Template Sequence		.	.	.	H	L	H	A	V	E	V	A	V	V	D	E	S	R	T	V	R	L	V	T	A	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	D	D	T	G	D	L	G	E	L	F	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	H	T	G	G	G	G	G	N	F	G	.	.	V	V	T	A	Y
Template Known Secondary structure		.	.	.	G											T	T	S									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T	T	S		T	T	S	S		.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.
Template SS confidence
					152	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.												.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.															.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.			.	.	.	200	.
		266	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	L	D	T	F	E	A	E	K	N	Q	Q	V	F	Y	I	G	T	N	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	E	V	L	T	E	I	R	R	H	I	L	A	N	F	E	N	L	P	V	A	G	E	Y	M	H	R	D	I	Y	D	I	A	E	K	Y	G	K	D	T	F	L
Query Conservation																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	F	R	S	P	E	H	L	A	T	E	P	V	G	L	P	R	A	A	G	R	L	H	V	Q	K	V	V	F	P	W	A	M	I	D	E	T	S	F	V	T	V	M	R	R	F	F	E	W	H	E	R	H	S	E	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	S	P	E	S	S	L	F	A	T	F
Template Known Secondary structure							T	T	T		B	T	T	T	T	B		B			S											G	G	G																				S			T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T		G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		202	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.														.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.
		328	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	I	D	K	L	G	T	D	K	M	P	F	F	F	N	L	K	G	R	T	D	A	M	L	E	K	V	K	F	F	R	P	H	F	T	D	R	A	M	Q	K	F	G	H	L	F	P	S	H	L	P	P	R	M	K	N	W	R	D	K	Y	E	H	H	L	L	L	K	M	A	G	D	G	V	G	E	A	K	S	W
Query Conservation
Alig confidence																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	V	N	H	V	S	S	G	V	L	Q	L	M	V	Q	Q	D	A	D	V	D	P	E	G	E	I	L	A	R	F	V	A	S	L	T	E	G	T	G	V	V	G	I	P	R	G	G	V	M	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure						G	G	G											T	T	T		T	T													S	S	S	S												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		269	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.
		408	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	V	D	Y	F	K	Q	A	E	G	D	F	F	V	C	T	P	E	E	G	S	K	A	F	L	H	R	F	A	A	A	G	A	A	I	R	Y	Q	A	V	H	S	D	E	V	E	D	I	L	A	L	D	I	A	L	R	R	N	D	T	E	W	Y	E	H	L	P	P	E	I	D	S	Q	L	V	H	K	L	Y	Y
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	L	T	G	T	R	Y	M	S	Q	A	D	C	G	D	V	M	G	A	R	S	A	S	K	S	A	Y	H	R	A	A	P	T	D	E	Q	L	S	V	L	H	R	H	L	H	A	D	H	P	G	Q	A	S	Y	V	M	F
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								T		B		S		G	G	G	T	T											S	S															T	S	S	S			T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																									319	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.
		488	.	490	.																	.	.	.	.	.	.	.	.						500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	H	F	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	Y	V	F	H	Q	D	Y	.	.	.	.	.	I	V	K	K	G	V	D	V	H	A	L	K	E	Q	M	L	E	L	L	Q	Q	R	G	A	Q	Y	P	A	E	H	N	V	G	H	L	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	S	Y	G	G	E	I	N	R	R	G	P	S	D	A	A	V	P	Q	R	D	S	V	V	K	S	S	W	F	S	A	W	Q	D	A	E	L	D	E	L	H	L	G	W	L	R	G	L	Y	E	E	F	F	A	G	T	G	G	V	P	V	T	G	G	R	T	D	G	C	Y	I	N	Y	P	D	A	D	L	L	D
Template Known Secondary structure						G	G	G	G	G	S		T	T	T	S	S					S		S										S		G	G	G																T	G	G	G	T	T	S			T	T	S	S	B					T	T	S			G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		376	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.
																		536	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	A	P	E	T	L	Q	K	F	Y	R	E	N	D	P	T	N	S	M	N	P	G
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	A	R	N	R	S	G	E	P	W	H	H	L	Y	Y	K	D	N	Y	A	R	L	R	S	A	K	R	A	W	D	P	L	N	T	F	H	H	S
Template Known Secondary structure		T	T	T			S	S									G	G	G													T	T			S			T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		456	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.