Job Description P06149 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 10:59:07 GMT 2012 Rank 19 Aligned Residues 438 % Identity 13% Template c2y3rC_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: C: PDB Molecule:taml; PDBTitle: structure of the tirandamycin-bound fad-dependent2 tirandamycin oxidase taml in p21 space group Resolution 1.79 Å

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		25	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40		.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.
Query SS confidence																		.
Query Sequence		L	L	T	D	P	A	K	T	A	R	Y	R	K	G	F	R	.	S	G	Q	G	D	A	L	A	V	V	F	P	G	S	L	L	E	L	W	R	V	L	K	A	C	V	T	A	D	K	I	I	L	M	Q	A	A	N	T	G	L	T	E	G	S	T	P	N	G	N	D	Y	D	R	D	V	V	I	I	S	T	L	R
Query Conservation																		.
Alig confidence																		.																																																		.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																				.	.	.	.	.
Template Sequence		V	A	P	G	D	I	R	Y	E	D	L	R	R	G	E	N	L	R	F	V	G	D	P	E	E	I	H	L	V	G	S	A	A	E	I	E	Q	V	L	S	R	A	V	R	S	G	K	R	V	A	V	R	S	G	G	H	C	Y	E	D	F	V	A	N	S	D	.	.	.	.	.	V	R	V	V	M	D	M	S	R
Template Known Secondary structure				T	T	S	T	T					T			S		T	T						S							S														T	T							S	S				S	S	S	T	T	T		T	T	.	.	.	.	.								T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																				.	.	.	.	.
Template SS confidence
		7	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.						.	.	.	.	.	.	.	80	.
		104	.	.	.	.	.	110	.	.	.		.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.
Predicted Secondary structure												.
Query SS confidence												.
Query Sequence		L	D	K	L	H	V	L	G	K	G	.	E	Q	V	L	A	Y	P	G	T	T	L	Y	S	L	E	K	A	L	K	P	L	G	R	E	P	H	S	V	I	G	S	S	C	I	G	A	S	V	I	G	G	I	C	N	N	S	G	G	S	L	V	Q	R	G	P	A	Y	T	E	M	S	L	F	A	R	I	N	E	D
Query Conservation												.
Alig confidence						.						.																														.					.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation						.																																				.					.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	S	A	V	.	G	F	D	E	E	R	G	A	F	A	V	E	A	G	A	T	L	G	A	V	Y	K	T	L	F	R	V	W	G	V	T	L	P	G	G	.	A	C	P	D	.	V	G	A	G	G	H	I	L	G	G	G	Y	G	P	L	S	R	M	H	G	S	I	V	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure						.				T	T	T	T						T	T		B													S							.	S		T	T	.		B							T	T				T	T							G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure						.																																				.					.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		82	.	.	.		.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120		.	.	.	.		.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.
		183	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	K	L	T	L	V	N	H	L	G	I	D	L	G	E	T	P	E	Q	I	L	S	K	L	D	D	D	R	I	K	D	D	D	V	R	H	D	G	R	H	A	H	D	Y	D	Y	V	H	R	V	R	D	I	E	A	D	T	P	A	R	Y	N	A	D	P	D	R	L	F	E	S	S	G	C	A	G	K	L	A	V
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	Y	L	H	A	V	E	V	V	V	V	D	A	S	G	D	A	R	T	V	I	A	T	.	.	.	.	.	.	.	.	R	E	P	S	D	P	N	H	D	L	W	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	H	T	G	G	G	G	G	N	F	G	.	.	V	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	G											T	T	S									.	.	.	.	.	.	.	.	S		T	T		T	T						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T	T	S		T	T	S	S		.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.
Template SS confidence
								149	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170									.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.			.	.
		263	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	A	V	R	L	D	T	F	E	A	E	K	N	Q	Q	V	F	Y	I	G	T	N	Q	P	E	V	L	T	E	I	R	R	H	I	L	A	N	F	E	N	L	P	V	A	G	E	Y	M	H	R	D	I	Y	D	I	A	E	K	Y	G	K	D	T	F	L	M	I	D	K	L	G	T	D	K	M	P	F	F	F	N
Query Conservation
Alig confidence																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	R	Y	W	L	R	T	A	E	P	P	E	P	G	R	L	L	P	R	P	P	A	E	V	L	L	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	V
Template Known Secondary structure														G	G	G	T	S					S						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		196	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.																																																			.	.	.
		343	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	K	G	R	T	D	A	M	L	E	K	V	K	F	F	R	P	H	F	T	D	R	A	M	Q	K	F	G	H	L	F	P	S	H	L	P	P	R	M	K	N	W	R	D	K	Y	E	H	H	L	L	L	K	M	A	G	D	G	V	G	E	A	K	S	W	L	V	D	Y	F	K	Q	A	E	G	D	F	F	V	C
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		W	P	W	E	G	L	D	E	A	A	F	A	R	L	V	R	N	H	G	R	W	F	E	Q	N	S	G	P	D	S	P	W	C	D	L	Y	S	V	L	A	L	T	R	S	Q	S	G	A	L	A	M	T	T	Q	L	D	A	T	G	P	D	A	E	K	R	L	E	T	Y	L	A	A	V	S	E	G	V	G	V	Q
Template Known Secondary structure				S	T	T																				S		S	T	T		G	G	G	G										G	G	G	S												S	T	T														T	T		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		229	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.
		423	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.
Predicted Secondary structure																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	P	E	E	G	S	K	A	F	L	H	R	F	A	A	A	G	A	A	I	R	Y	Q	A	V	H	S	D	E	V	E	D	I	L	A	L	D	I	A	L	R	R	N	D	T	E	W	Y	E	H	L	P	P	E	I	D	S	Q	L	V	H	K	L	Y	Y	G	H	F	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	H	S	D	T	R	R	L	P	W	L	H	S	T	R	W	P	G	I	A	G	D	G	D	M	T	G	R	A	K	I	K	A	A	Y	A	R	R	S	F	D	D	R	Q	I	G	T	L	Y	T	R	L	T	S	T	D	D	N	P	A	G	V	V	A	L	I	A	Y	G	G	K	V	N	A	V	P	A	D	R	T
Template Known Secondary structure																T	S											S										S	S																					T	T										G	G	G	G	G	S		T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		309	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.
							492	.	.	.	.	.	.	.	500	.						.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.											.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.											.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	C	Y	V	F	H	Q	D	Y	I	V	.	.	.	.	.	K	K	G	V	D	V	H	A	L	K	E	Q	M	L	E	L	L	Q	Q	R	G	A	Q	Y	P	A	E	H	N	V	G	H	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.											.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.											.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	V	A	Q	R	D	S	I	L	K	I	V	Y	V	T	T	W	E	D	P	A	Q	D	P	V	H	V	R	W	I	R	E	L	Y	R	D	V	Y	A	D	T	G	G	V	P	V	P	G	G	A	A	D	G	A	Y	V	N	Y	P	D	V	D	L	A	D	E	E	W	N	T	S	G	V	P	W	S	E	L	Y	Y
Template Known Secondary structure		S					S		S												T	T																	T	G	G	G	T	T	S			T	T	T	T	B					T	T	S			G	G	G	G		T	T	T			S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		535	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	K	A	P	E	T	L	Q	K	F	Y	R	E	N	D	P	T	N	S	M	N	P	G	I	G	K	T	S	K
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		K	D	A	Y	P	R	L	Q	A	V	K	A	R	W	D	P	R	N	V	F	R	H	A	L	S	V	R	V	P
Template Known Secondary structure		G	G	G													T	T			S			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.