Job Description P06149 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 10:59:07 GMT 2012 Rank 16 Aligned Residues 417 % Identity 13% Template c2wdwB_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: B: PDB Molecule:putative hexose oxidase; PDBTitle: the native crystal structure of the primary hexose oxidase (2 dbv29) in antibiotic a40926 biosynthesis Resolution 3.21 Å

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		27	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.		.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.
Query SS confidence																	.
Query Sequence		T	D	P	A	K	T	A	R	Y	R	K	G	F	R	S	.	G	Q	G	D	A	L	A	V	V	F	P	G	S	L	L	E	L	W	R	V	L	K	A	C	V	T	A	D	K	I	I	L	M	Q	A	A	N	T	G	L	T	E	G	S	T	P	N	G	N	D	Y	D	R	D	V	V	I	I	S	T	L	R	L	D
Query Conservation																	.
Alig confidence																	.																																																	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																		.	.	.	.	.
Template Sequence		D	D	P	R	Y	L	N	L	K	L	R	G	A	N	S	R	F	N	G	E	P	D	Y	I	H	L	V	G	S	T	Q	Q	V	A	D	A	V	E	E	T	V	R	T	G	K	R	V	A	V	R	S	G	G	H	C	F	E	D	F	V	D	N	P	D	.	.	.	.	.	V	K	V	I	I	D	M	S	L	L	T
Template Known Secondary structure		T	S	T	T						S			S		T	T						S						S	S																						S	S				S	S	T	T	S	S	S	T	T	.	.	.	.	.								T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																		.	.	.	.	.
Template SS confidence
		38	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.						.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.
		106	.	.	.	110	.	.	.		.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.
Query SS confidence										.
Query Sequence		K	L	H	V	L	G	K	G	.	E	Q	V	L	A	Y	P	G	T	T	L	Y	S	L	E	K	A	L	K	P	L	G	R	E	P	H	S	V	I	G	S	S	C	I	G	A	S	V	I	G	G	I	C	N	N	S	G	G	S	L	V	Q	R	G	P	A	Y	T	E	M	S	L	F	A	R	I	N	E	D	G	K
Query Conservation										.
Alig confidence				.						.																																		.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.																																								.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	I	.	A	Y	D	P	S	M	N	A	F	L	I	E	P	G	N	T	L	S	E	V	Y	E	K	L	Y	L	G	W	N	V	T	I	P	G	G	V	C	G	G	.	.	V	G	V	G	G	H	I	C	G	G	G	Y	G	P	L	S	R	Q	F	G	S	V	V	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure				.				T	T	T	T						T	T		B													S							S		S	S	.	.		B							T	T				T	T							G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure				.																																								.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		113	.		.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.			.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.
		185	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	T	L	V	N	H	L	G	I	D	L	G	E	T	P	E	Q	I	L	S	K	L	D	D	D	R	I	K	D	D	D	V	R	H	D	G	R	H	A	H	D	Y	D	Y	V	H	R	V	R	D	I	E	A	D	T	P	A	R	Y	N	A	D	P	D	R	L	F	E	S	S	G	C	A	G	K	L	A	V	F	A
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.
Template Conservation		.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.
Template Sequence		.	.	.	.	Y	L	Y	A	V	E	V	V	V	V	N	K	Q	G	K	A	R	V	I	V	A	T	R	E	.	.	.	.	.	.	.	.	R	D	D	P	H	H	D	L	W	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	H	T	G	G	G	G	G	N	F	G	.	.	V	V	T	K
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	S											T	T	S									S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T		T	T						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T	T	S		S	S	S	S		.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.
Template SS confidence
						178	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.									.	.	.	.	.	.	.	.	210	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.			.	.	.	.
		265	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	R	L	D	T	F	E	A	E	K	N	Q	Q	V	F	Y	I	G	T	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	P	E	V	L	T	E	I	R	R	H	I	L	A	N	F	E	N	L	P	V	A	G	E	Y	M	H	R	D	I	Y	D	I	A	E	K	Y	G	K	D	T	F	L	M
Query Conservation																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	W	M	R	V	P	E	D	V	G	R	N	P	E	R	L	L	P	K	P	P	A	T	L	L	T	S	T	V	T	F	D	W	A	G	M	T	E	A	A	F	S	R	L	L	R	N	H	G	E	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure							S	S				S		G	G	G	S	S					S											G	G	G																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		227	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.
		329	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	D	K	L	G	T	D	K	M	P	F	F	F	N	L	K	G	R	T	D	A	M	L	E	K	V	K	F	F	R	P	H	F	T	D	R	A	M	Q	K	F	G	H	L	F	P	S	H	L	P	P	R	M	K	N	W	R	D	K	Y	E	H	H	L	L	L	K	M	A	G	D	G	V	G	E	A	K	S	W	L
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	E	R	N	S	G	P	D	S	P	Y	T	G	L	W	S	Q	L	M	I	G	N	E	V	P	G	M	G	E	S	G	F	M	M	P	I	Q	V	D	A	T	R	P	D	A	R	R	L	L	D	A	H	I
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				S		S	T	T		G	G	G	G												T	T		S	S		S									T	T	S	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																													278	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330
		409	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	D	Y	F	K	Q	A	E	G	D	F	F	V	C	T	P	E	E	G	S	K	A	F	L	H	R	F	A	A	A	G	A	A	I	R	Y	Q	A	V	H	S	D	E	V	E	D	I	L	A	L	D	I	A	L	R	R	N	D	T	E	W	Y	E	H	L	P	P	E	I	D	S	Q	L	V	H	K	L	Y	Y	G
Query Conservation
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	A	V	I	D	G	V	P	P	A	E	V	P	E	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	E	Q	R	W	L	A	S	T	P	G	R	G	G	R	G	P	A	S	K	T	K	A	G	Y	L	R	K	R	L	T	D	R	Q	I	Q	A	V	Y	E	N	M	T	H	M	D	G	I	D	Y	G	A	V
Template Known Secondary structure					S	T	T		T	T							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					T	T	S							S	S												S	S																		T	T		S
Template Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		331	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.													.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.
		489	490																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.						.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		H	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	C	Y	V	F	H	Q	D	Y	I	V	.	.	.	.	.	K	K	G	V	D	V	H	A	L	K	E	Q	M	L	E	L	L	Q	Q	R	G	A	Q	Y	P	A	E	H	N	V	G	H	L	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		W	L	I	G	Y	G	G	K	V	N	T	V	D	P	A	A	T	A	L	P	Q	R	D	A	I	L	K	V	N	Y	I	T	G	W	A	N	P	G	N	E	A	K	H	L	T	W	V	R	K	L	Y	A	D	V	Y	A	E	T	G	G	V	P	V	P	N	D	V	S	D	G	A	Y	I	N	Y	P	D	S	D	L
Template Known Secondary structure								G	G	G	G	G	S		T	T	T	S	S					S		S										S	S	G	G	G																T	G	G	G	T	T	S			S		S	S	B					T	T	S			G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		399	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.
																				536	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	A	P	E	T	L	Q	K	F	Y	R	E	N	D	P	T	N	S	M	N	P	G	I	G	K	T	S	K
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.
Template Conservation																																										.
Template Sequence		A	D	P	G	L	N	T	S	G	V	P	W	H	D	L	Y	Y	K	G	N	H	P	R	L	R	K	V	K	A	A	Y	D	P	R	N	H	F	H	H	A	.	L	S	I	R	P
Template Known Secondary structure		T	S	T	T	T			S	S								T	G	G	G													T	T			S			T	.	T
Template Predicted Secondary structure																																										.
Template SS confidence
		479	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.		.	520	.	.	.