Job Description P06149 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 10:59:07 GMT 2012 Rank 20 Aligned Residues 382 % Identity 17% Template c2vfvA_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:xylitol oxidase; PDBTitle: alditol oxidase from streptomyces coelicolor a3(2): complex2 with sulphite Resolution 1.72 Å

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		35	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																																	.
Query SS confidence																																																																																	.
Query Sequence		Y	R	K	G	F	R	S	G	Q	G	D	A	L	A	V	V	F	P	G	S	L	L	E	L	W	R	V	L	K	A	C	V	T	A	D	K	I	I	L	M	Q	A	A	N	T	G	L	T	E	G	S	T	P	N	G	N	D	Y	D	R	D	V	V	I	I	S	T	L	R	L	D	K	L	H	V	L	G	K	G	.
Query Conservation																																																																																	.
Alig confidence																																		.	.	.	.																				.	.	.	.	.																				.
Template Conservation																																		.	.	.	.																				.	.	.	.	.
Template Sequence		V	T	N	W	A	G	N	I	T	Y	T	A	K	E	L	L	R	P	H	S	L	D	A	L	R	A	L	V	A	D	S	A	.	.	.	.	R	V	R	V	L	G	S	G	H	S	F	N	E	I	A	E	P	G	D	.	.	.	.	.	G	G	V	L	L	S	L	A	G	L	P	S	V	V	D	V	D	T	A	A
Template Known Secondary structure			B		S	S	S	S		B		S		S	S		B			S	S												S	.	.	.	.	S					S	S					S	S	T	T				T	.	.	.	.	.	T						S	T	T	S								T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.																				.	.	.	.	.
Template SS confidence
		6	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.					.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.						.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.
		114	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	Q	V	L	A	Y	P	G	T	T	L	Y	S	L	E	K	A	L	K	P	L	G	R	E	P	H	S	V	I	G	S	S	C	I	G	A	S	V	I	G	G	I	C	N	N	S	G	G	S	L	V	Q	R	G	P	A	Y	T	E	M	S	L	F	A	R	I	N	E	D	G	K	L	T	L	V	N	H	L	G	I
Query Conservation
Alig confidence																															.					.														.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																															.					.														.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	T	V	R	V	G	G	G	V	R	Y	A	E	L	A	R	V	V	H	A	R	G	L	A	L	P	N	M	A	.	S	L	P	H	.	I	S	V	A	G	S	V	A	T	G	T	H	G	.	S	G	V	G	N	G	S	L	A	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	V	R	E	V
Template Known Secondary structure		T						T	T		B											T	T				S				.	S	S	S		.	S	B								T				.			T	T				G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G
Template Predicted Secondary structure																															.					.														.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		77	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.		.	.	.	.		110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.		.	.	.	.	.	.	.	130	.	.																	.	.	.	.	.
		194	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	L	G	E	T	P	E	Q	I	L	S	K	L	D	D	D	R	I	K	D	D	D	V	R	H	D	G	R	H	A	H	D	Y	D	Y	V	H	R	V	R	D	I	E	A	D	T	P	A	R	Y	N	A	D	P	D	R	L	F	E	S	S	G	C	A	G	K	L	A	V	F	A	V	R	L	D	T	F	E	A	E
Query Conservation
Alig confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.
Template Conservation													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.
Template Sequence		E	L	V	T	A	D	G	S	T	V	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	A	R	G	D	E	R	F	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	A	V	T	S	L	G	A	L	G	.	.	V	V	T	S	L	T	L	D	L	E	P	A	Y
Template Known Secondary structure						T	T	S					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T	S	T	T	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	T	S	S	S	T	T	T	T		.	.
Template Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.
Template SS confidence
		138	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	150	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	160	.	.	.	.	.	.	.			.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
		274	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	N	Q	Q	V	F	Y	I	G	T	N	Q	P	E	V	L	T	E	I	R	R	H	I	L	A	N	F	E	N	L	P	V	A	G	E	Y	M	H	R	D	I	Y	D	I	A	E	K	Y	G	K	D	T	F	L	M	I	D	K	L	G	T	D	K	M	P	F	F	F	N	L	K	G	R	T	D	A	M	L	E	K
Query Conservation
Alig confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	M	E	Q	H	V	F	T	E	L	P	L	A	G	L	D	P	A	T	F	E	T	V	M	A	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	Y	S	V	S	L	F	T	D	W	R	A	P	G	F	R	Q	V	W	L	K	R	R	T	D	R	P	L	D	G	F	P	Y	A
Template Known Secondary structure													S	T	T											T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S								S	S	S	S	S										T	T	S						T	T	S
Template Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		181	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
		354	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	K	F	F	R	P	H	F	T	D	R	A	M	Q	K	F	G	H	L	F	P	S	H	L	P	P	R	M	K	N	W	R	D	K	Y	E	H	H	L	L	L	K	M	A	G	D	G	V	G	E	A	K	S	W	L	V	D	Y	F	K	Q	A	E	G	D	F	F	V	C	T	P	E	E	G	S	K	A	F	L	H
Query Conservation
Alig confidence																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	P	A	A	E	K	M	H	P	V	P	G	M	P	A	V	N	C	T	E	Q	F	G	V	P	G	P	W	H	E	R	L	P	H	F	R	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure					S	S				S	S	T	T	S		G	G	G	B				T	T					G	G	G	T	S	S	S	B		T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		241	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.
		434	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.															.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	F	A	A	A	G	A	A	I	R	Y	Q	A	V	H	S	D	E	V	E	D	I	L	A	L	D	I	A	L	R	R	N	D	T	E	W	Y	E	H	L	P	P	E	I	D	S	Q	L	V	H	K	L	Y	Y	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	F	M	C	Y	V	F	H	Q	D	Y
Query Conservation																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	F	T	P	S	S	G	A	E	L	Q	S	E	Y	L	M	P	R	E	H	A	L	A	A	L	H	A	M	D	A	I	R	E	T	L	A	P	V	L	Q	T	C	E	I	R	T	V	A	A	D	A	Q	W	L	S	P	A	Y	G	R	D	T	V	A	A	H	F	T
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T				S			S										G	G	G											T					G	G	G												B		S	T	T		T	T	B	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
														278	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.
		500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.			.	.	.	.	.	.	530	.	.						.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.		.	.
Predicted Secondary structure																										.	.										.	.	.	.	.																							.
Query SS confidence																										.	.										.	.	.	.	.																							.
Query Sequence		I	V	K	K	G	V	D	V	H	A	L	K	E	Q	M	L	E	L	L	Q	Q	R	G	A	.	.	Q	Y	P	A	E	H	N	V	G	.	.	.	.	.	H	L	Y	K	A	P	E	T	L	Q	K	F	Y	R	E	N	D	P	T	N	S	M	.	N	P
Query Conservation																										.	.										.	.	.	.	.																							.
Alig confidence																										.	.										.	.	.	.	.																							.
Template Conservation
Template Sequence		W	V	E	D	T	A	A	V	L	P	V	V	R	R	L	E	E	A	L	V	P	F	A	A	R	P	H	W	G	K	V	F	T	V	P	A	G	E	L	R	A	L	Y	P	R	L	A	D	F	G	A	L	A	G	A	L	D	P	A	G	K	F	T	N	A
Template Known Secondary structure				S																	G	G	G	T					T	T	S											T	T		T	T													T	T		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		346	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410