Job Description P06149 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 10:59:07 GMT 2012 Rank 11 Aligned Residues 407 % Identity 13% Template c2bvfA_ PDB info PDB header:oxidase Chain: A: PDB Molecule:6-hydroxy-d-nicotine oxidase; PDBTitle: crystal structure of 6-hydoxy-d-nicotine oxidase from2 arthrobacter nicotinovorans. crystal form 3 (p1) Resolution 1.92 Å

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		22	.	.	.	.	.			.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure								.	.
Query SS confidence								.	.
Query Sequence		S	S	H	L	L	T	.	.	D	P	A	K	T	A	R	Y	R	K	G	F	R	S	G	Q	G	D	A	L	A	V	V	F	P	G	S	L	L	E	L	W	R	V	L	K	A	C	V	T	A	D	K	I	I	L	M	Q	A	A	N	T	G	L	T	E	G	S	T	P	N	G	N	D	Y	D	R	D	V	V	I	I
Query Conservation								.	.
Alig confidence								.	.																																																														.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																							.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	G	E	V	I	Y	P	D	D	S	G	F	D	A	I	A	N	I	W	D	G	R	H	L	Q	R	P	S	L	I	A	R	C	L	S	A	G	D	V	A	K	S	V	R	Y	A	C	D	N	G	L	E	I	S	V	R	S	G	G	H	N	P	N	G	Y	A	T	N	D	.	.	.	.	.	.	G	G	I	V	L
Template Known Secondary structure		S	S					T	T	S	T	T								S		T	T						S							S															T							S	S				T	T		T	T			S	.	.	.	.	.	.	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																																							.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		13	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.							.	.	.	.	.
		100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.		.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.
Query SS confidence																.
Query Sequence		S	T	L	R	L	D	K	L	H	V	L	G	K	G	.	E	Q	V	L	A	Y	P	G	T	T	L	Y	S	L	E	K	A	L	K	P	L	G	R	E	P	H	S	V	I	G	S	S	C	I	G	A	S	V	I	G	G	I	C	N	N	S	G	G	S	L	V	Q	R	G	P	A	Y	T	E	M	S	L	F	A	R
Query Conservation																.
Alig confidence										.						.																														.	.	.																												.	.	.	.	.	.
Template Conservation										.																																				.	.	.																												.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	L	R	L	M	N	S	I	.	H	I	D	T	A	G	S	R	A	R	I	G	G	G	V	I	S	G	D	L	V	K	E	A	A	K	F	G	L	A	A	V	T	G	M	.	.	.	H	P	K	V	G	F	C	G	L	A	L	N	G	G	V	G	F	L	T	P	K	Y	G	L	A	S	D	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure				T	T					.				T	T	T	T						T	T		B										T	T	T							S	.	.	.		T	T	S	B						T	T					T	T							G	G	G	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure										.																																				.	.	.																												.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		87	.	.	90	.	.	.	.		.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.				130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.
		179	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	N	E	D	G	K	L	T	L	V	N	H	L	G	I	D	L	G	E	T	P	E	Q	I	L	S	K	L	D	D	D	R	I	K	D	D	D	V	R	H	D	G	R	H	A	H	D	Y	D	Y	V	H	R	V	R	D	I	E	A	D	T	P	A	R	Y	N	A	D	P	D	R	L	F	E	S	S	G	C	A	G
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	I	L	G	A	T	L	V	T	A	T	G	D	V	I	Y	C	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	D	E	R	P	E	L	F	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	V	R	G	A	G	P	N	F	G
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G									T	T	S							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	S	S						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						G	G	G	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
												157	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.																.	.	.	.	.	180	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	190	.	.	.
		259	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	L	A	V	F	A	V	R	L	D	T	F	E	A	E	K	N	Q	Q	V	F	Y	I	G	T	N	Q	P	E	V	L	T	E	I	R	R	H	I	L	A	N	F	E	N	L	P	V	A	G	E	Y	M	H	R	D	I	Y	D	I	A	E	K	Y	G	K	D	T	F	L	M	I	D	K	L	G	T	D	K	M	P
Query Conservation
Alig confidence		.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	V	V	T	E	V	E	V	Q	L	Y	E	L	P	R	K	M	L	A	G	F	I	T	W	A	P	S	V	S	E	L	A	G	L	L	T	S	L	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
				194	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.
		339	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	F	F	N	L	K	G	R	T	D	A	M	L	E	K	V	K	F	F	R	P	H	F	T	D	R	A	M	Q	K	F	G	H	L	F	P	S	H	L	P	P	R	M	K	N	W	R	D	K	Y	E	H	H	L	L	L	K	M	A	G	D	G	V	G	E	A	K	S	W	L	V	D	Y	F	K	Q	A	E	G	D
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	A	L	N	E	M	A	D	H	I	Y	P	S	V	F	V	G	V	D	E	N	R	A	P	S	V	T	V	C	V	G	H	L	G	G	L	D	I	A	E	R	D	I	A	R	L	R	G	L	G	R	T	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						T	T	T	T											T	T													S														T	T	S			S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																													232	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.
		419	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.		.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																				.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																				.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	F	V	C	T	P	E	E	G	S	K	A	F	L	H	R	F	A	A	A	G	A	A	I	R	Y	Q	A	V	H	S	D	E	V	E	D	I	L	A	L	D	I	A	L	R	R	N	D	T	E	.	W	Y	E	H	L	P	P	E	I	D	S	Q	L	V	H	K	L	Y	Y	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																				.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.	.																													.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	D	S	I	A	V	R	S	Y	D	E	V	V	A	L	.	.	.	.	.	.	.	N	A	E	V	G	S	F	E	D	G	M	S	N	L	W	I	D	R	E	I	A	M	P	N	A	R	F	A	E	A	I	A	G	N	L	D	K	F	V	S	E	P	A	S	G	G	S	V	K	L	E	I	E	G	M	P	F	G
Template Known Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.					S					S												S											T	T	G	G	G					T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		285	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.								300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.
									489	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.						.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.				.	.	530	.	.	.	.	.											.	.	.	.	540	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.																											.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.																											.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	H	F	M	C	Y	V	F	H	Q	D	Y	I	V	.	.	.	.	.	K	K	G	V	D	V	H	A	L	K	E	Q	M	L	E	L	L	Q	Q	R	G	A	Q	Y	P	A	.	.	.	E	H	N	V	G	H	L	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	A	P	E	T	L	Q	K
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.																											.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.																											.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	P	K	R	T	P	A	R	H	R	D	A	M	G	V	L	A	L	A	E	W	S	G	A	A	P	G	S	E	K	Y	P	E	L	A	R	E	L	D	A	A	L	L	R	A	G	V	T	T	S	G	F	G	L	L	N	N	N	S	E	V	T	A	E	M	V	A	E	V	Y	K	P	E	V	Y	S	R	L	A	A
Template Known Secondary structure			T	T			S	S				S	S											T	T	S	T	T	T	T																T	T									G	G	G		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		358	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.
		544	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	Y	R	E	N	D	P	T	N	S	M	N	P	G	I	G	K	T	S	K	R
Query Conservation
Alig confidence																.
Template Conservation																.
Template Sequence		V	K	R	E	Y	D	P	E	N	R	F	R	H	N	.	Y	N	I	D	P	E
Template Known Secondary structure								T	T					S	S	.	S
Template Predicted Secondary structure																.
Template SS confidence
		438	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.		.	.	.	.	.	.