Job Description P06149 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 10:59:07 GMT 2012 Rank 21 Aligned Residues 425 % Identity 11% Template c1i19B_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: B: PDB Molecule:cholesterol oxidase; PDBTitle: crystal structure of cholesterol oxidase from b.sterolicum Resolution 1.70 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		27	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	D	P	A	K	T	A	R	Y	R	K	G	F	R	S	G	Q	G	D	A	L	A	V	V	F	P	G	S	L	L	E	L	W	R	V	L	K	A	C	V	T	A	D	K	I	I	L	M	Q	A	A	N	T	G	L	T	E	G	S	T	P	N	G	N	D	Y	D	R	D	V	V	I	I	S	T	L	R	L	D	K
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		D	I	A	L	F	Q	Q	A	Y	Q	N	W	S	K	E	I	M	L	D	A	T	W	V	C	S	P	K	T	P	Q	D	V	V	R	L	A	N	W	A	H	E	H	D	Y	K	I	R	P	R	G	A	M	H	G	W	T	P	L	T	V	E	K	G	A	N	V	E	K	V	I	L	A	D	T	M	T	H	L	N	G
Template Known Secondary structure		T	S										T	T	S	S	S											S	S															T								S					S	S	S	S			T	T				T	T						S	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		69	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.
		107		.	.	110	.	.	.		.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.
Predicted Secondary structure			.							.
Query SS confidence			.							.
Query Sequence		L	.	H	V	L	G	K	G	.	E	Q	V	L	A	Y	P	G	T	T	L	Y	S	L	E	K	A	L	K	P	L	G	R	E	P	H	S	V	I	G	S	S	C	I	G	A	S	V	I	G	G	I	C	N	N	S	G	G	S	L	V	Q	R	G	P	A	Y	T	E	M	S	L	F	A	R	I	N	E	D	G	K
Query Conservation			.							.
Alig confidence			.							.																														.					.																																			.	.
Template Conservation																																								.					.																																			.	.
Template Sequence		I	T	V	N	T	G	G	P	V	A	T	V	T	A	G	A	G	A	S	I	E	A	I	V	T	E	L	Q	K	H	D	L	G	W	A	N	L	P	.	A	P	G	V	.	L	S	I	G	G	A	L	A	V	N	A	H	G	A	A	L	P	A	V	G	Q	T	T	L	P	G	H	T	Y	G	S	L	S	N	.	.
Template Known Secondary structure								S	S	S							T	T	S	B										T	T	T				S	S			.	S		T	T	.	S	B							T	T				S					T	T					T	T			S	S		G	G	G	.	.
Template Predicted Secondary structure																																								.					.																																			.	.
Template SS confidence
		149	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.		.	.	.	190		.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.
		185	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	T	L	V	N	H	L	G	I	D	L	G	E	T	P	E	Q	I	L	S	K	L	D	D	D	R	I	K	D	D	D	V	R	H	D	G	R	H	A	H	D	Y	D	Y	V	H	R	V	R	D	I	E	A	D	T	P	A	R	Y	N	A	D	P	D	R	L	F	E	S	S	G	C	A	G	K	L	A	V	F	A
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.
Template Conservation		.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.
Template Sequence		.	.	.	.	L	V	T	E	L	T	A	V	V	W	N	G	T	T	Y	A	L	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	Y	Q	R	N	D	P	R	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	P	L	L	T	N	L	G	R	C	.	.	F	L	T	S
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	G											S	S	S					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T		T	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					S		T	T	S	S	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.
Template SS confidence
						225	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.																.	.	.	.	.	.	.	250	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	260	.			.	.	.	.
		265	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.							.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																					.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	R	L	D	T	F	E	A	E	K	N	Q	Q	V	F	Y	I	G	T	.	.	.	.	.	.	N	Q	P	E	V	L	T	E	I	R	R	H	I	L	A	N	F	E	N	L	P	V	A	G	E	Y	M	H	R	D	I	Y	D	I	A	E	K	Y	G	K	D	T	F	L	M	I	D	K	L	G	T	D	K	M	P
Query Conservation																					.	.	.	.	.	.
Alig confidence																					.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	T	M	Q	A	G	P	N	F	R	Q	R	C	Q	S	Y	T	D	I	P	W	R	E	L	F	A	P	K	G	A	D	G	R	T	F	E	K	F	V	A	E	S	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure																				S						T			T	T		S	S	S										S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		266	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.
		339	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	F	F	N	L	K	G	R	T	D	A	M	L	E	K	V	K	F	F	R	P	H	F	T	D	R	A	M	Q	K	F	G	H	L	F	P	S	H	L	P	P	R	M	K	N	W	R	D	K	Y	E	H	H	L	L	L	K	M	A	G	D	G	V	G	E	A	K	S	W	L	V	D	Y	F	K	Q	A	E	G	D
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	A	E	A	I	W	Y	P	F	T	E	K	P	W	M	K	V	W	T	V	S	V	G	K	P	P	Q	A	R	E	V	S	G	P	Y	N	Y	I	F	S	D	N	L	P	E	P	I	T	D	M	I	G	A	I	N	A	G	N	P	G	I
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								T	T		S	S														T	T	S				S	S	S								S														T	T		G	G	G
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																					309	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		419	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440						.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																								.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	F	V	C	T	P	E	E	G	S	K	A	F	L	H	R	F	A	A	A	G	A	.	.	.	.	.	A	I	R	Y	Q	A	V	H	S	D	E	V	E	D	I	L	A	L	D	I	A	L	R	R	N	D	T	E	W	Y	E	H	L	P	P	E	I	D	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																								.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																								.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	P	L	F	G	P	A	M	Y	E	I	T	K	L	G	L	A	A	T	N	A	N	D	I	W	G	W	S	K	D	V	Q	F	Y	I	K	A	T	T	L	R	L	T	E	G	G	G	A	V	V	T	S	R	A	N	I	A	T	V	I	N	D	F	T	E	W	F	H	E	R	I	E	F	Y	R	A	K	G	E	F
Template Known Secondary structure																				T	T		S															T	T	S														G	G	G																						T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		389	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.
																																						480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	L	V	H	K	L	Y	Y	G	H	F	M	C	Y	V	F	H	Q	D	Y	I	V	K	K	G	V	D	V	H	A	L	K	E	Q	M	L	E	L	L	Q	Q	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.																									.	.	.
Template Conservation																																																	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	L	N	G	P	V	E	I	R	C	C	G	L	D	Q	A	A	D	V	K	V	P	S	V	G	P	P	T	I	S	A	T	R	P	R	P	D	H	P	D	W	D	V	A	I	W	L	.	.	.	.	.	.	N	V	L	G	V	P	G	T	P	G	M	F	E	F	Y	R	E	M	E	Q	W	M	R	S	H	Y	N
Template Known Secondary structure					S												G	G	G			S			S		S		T	T		T	T				T	T		T	T								.	.	.	.	.	.						T	T		T	T																S	B
Template Predicted Secondary structure																																																	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		469	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.							.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.
																			521	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.											.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.		.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	G	A	Q	Y	P	A	E	H	N	V	G	H	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	K	A	P	E	T	L	Q	K	F	Y	R	E	N	D	P	T	N	S	M	.	N	P
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.
Template Conservation
Template Sequence		N	D	D	A	T	F	R	P	E	W	S	K	G	W	A	F	G	P	D	P	Y	T	D	N	D	I	V	T	N	K	M	R	A	T	Y	I	E	G	V	P	T	T	E	N	W	D	T	A	R	A	R	Y	N	Q	I	D	P	H	R	V	F	T	N	G
Template Known Secondary structure		S	S	S							T	T	S			S		S	S	S	T	T								T						T	T	T	T	S		T	T	S	S													T	T			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		543	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.