Job Description P06149 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 10:59:07 GMT 2012 Rank 2 Aligned Residues 486 % Identity 12% Template c1ahuB_ PDB info PDB header:flavoenzyme Chain: B: PDB Molecule:vanillyl-alcohol oxidase; PDBTitle: structure of the octameric flavoenzyme vanillyl-alcohol2 oxidase in complex with p-cresol Resolution 2.70 Å

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.														.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	S	M	T	T	T	D	N	K	A	F	L	N	E	L	A	R	L	V	G	S	S	H	L	L	T	D	P	A	K	T	A	R	Y	R	K	G	F	R	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	Q	G	D	A	L	A	V	V	F	P	G	S	L	L	E	L	W	R	V	L	K	A	C	V	T	A
Query Conservation																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	K	L	S	L	S	D	F	N	E	F	I	Q	D	I	I	R	I	V	G	S	E	N	V	E	V	I	S	S	K	D	Q	I	V	D	G	S	Y	M	K	P	T	H	T	H	D	P	H	H	V	M	D	Q	D	Y	F	L	A	S	A	I	V	A	P	R	N	V	A	D	V	Q	S	I	V	G	L	A	N	K	F
Template Known Secondary structure		T	T																			G	G	G						S	G	G	G						S	S	S			S	S	S		S	S		S	S		G	G	G	S			S						S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		14	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.
		69	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.		.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.		.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.		.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure															.																					.													.
Query SS confidence															.																					.													.
Query Sequence		D	K	I	I	L	M	Q	A	A	N	T	G	L	.	T	E	G	S	T	P	N	G	N	D	Y	D	R	D	V	V	I	I	S	T	.	L	R	L	D	K	L	H	V	L	G	K	G	.	E	Q	V	L	A	Y	P	G	T	T	L	Y	S	L	E	K	A	L	K	P	L	G	R	E	P	H	S	V	I	G	S	S
Query Conservation															.																					.													.
Alig confidence															.								.	.	.	.										.													.																														.
Template Conservation																							.	.	.	.																																																					.
Template Sequence		S	F	P	L	W	P	I	S	I	G	R	N	S	G	Y	G	G	A	A	P	R	.	.	.	.	V	S	G	S	V	V	L	D	M	G	K	N	M	N	R	V	L	E	V	N	V	E	G	A	Y	C	V	V	E	P	G	V	T	Y	H	D	L	H	N	Y	L	E	A	N	N	L	R	D	K	L	W	L	.	D	V
Template Known Secondary structure		T							S	S	S			T	T	T	T	T	T			S	.	.	.	.	S	T	T							T	T	T									T	T	T	T						T	T		B										T	T	T	G	G	G	T				.
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.	.																																																					.
Template SS confidence
		94	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.					.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.		.	.
		146	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.																.	.	.	210
Predicted Secondary structure																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		C	I	G	A	S	V	I	G	G	I	C	N	N	S	G	G	S	L	V	Q	R	G	P	A	Y	T	E	M	S	L	F	A	R	I	N	E	D	G	K	L	T	L	V	N	H	L	G	I	D	L	G	E	T	P	E	Q	I	L	S	K	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	D	D	R
Query Conservation																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	D	L	G	G	G	S	V	L	G	N	A	V	E	R	G	V	G	Y	T	P	Y	G	D	H	W	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	H	S	G	M	E	V	V	L	A	N	G	E	L	L	R	T	G	M	G	A	L	P	D	P	K	R	P	E	T	M	G	L	K	P	E	D
Template Known Secondary structure			S		S	S	S	B								T		B		S	S	T	T		B	T	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G									T	T	S						G	G	G	G	S						T	T	T	T	T			T	T	T
Template Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		169	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.
		211	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	K	D	D	D	V	R	H	D	G	R	H	A	H	D	Y	D	Y	V	H	R	V	R	D	I	E	A	D	T	P	A	R	Y	N	A	D	P	D	R	L	F	E	S	S	G	C	A	G	K	L	A	V	F	A	V	R	L	D	T	F	E	A	E	K	N	Q	Q	V	F	Y	I	G	T	N	Q	P	E	V	L	T
Query Conservation
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.
Template Conservation																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.
Template Sequence		Q	P	W	S	K	I	A	H	L	F	P	Y	G	F	G	P	Y	I	D	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	F	S	Q	S	N	M	G	.	.	I	V	T	K	I	G	I	W	L	M	P	N	P	R	G	Y	Q	S	Y	L	I	T	L	P	K	D	G	D	L	K
Template Known Secondary structure						S	G	G	G	T		S			S	S				G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	S	S	S	S	S		.	.														S											S	T	T
Template Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.
Template SS confidence
		233	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	260			.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290
		291	.	.	.	.	.			.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure								.	.
Query SS confidence								.	.
Query Sequence		E	I	R	R	H	I	.	.	L	A	N	F	E	N	L	P	V	A	G	E	Y	M	H	R	D	I	Y	D	I	A	E	K	Y	G	K	D	T	F	L	M	I	D	K	L	G	T	D	K	M	P	F	F	F	N	L	K	G	R	T	D	A	M	L	E	K	V	K	F	F	R	P	H	F	T	D	R	A	M	Q	K
Query Conservation								.	.
Alig confidence								.	.																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	A	V	D	I	I	R	P	L	R	L	G	M	A	L	Q	N	V	P	T	I	R	H	I	L	L	D	A	A	V	L	G	D	K	R	S	Y	S	S	R	T	E	P	L	S	D	E	E	L	D	K	I	A	K	Q	L	N	L	G	R	W	N	F	Y	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure														T		S		S															S		S	T	T	T				S	S															T			S						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		291	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.
		369	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.					.	.	440	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																							.	.	.	.
Query SS confidence																																																																							.	.	.	.
Query Sequence		F	G	H	L	F	P	S	H	L	P	P	R	M	K	N	W	R	D	K	Y	E	H	H	L	L	L	K	M	A	G	D	G	V	G	E	A	K	S	W	L	V	D	Y	F	K	Q	A	E	G	D	F	F	V	C	T	P	E	E	G	S	K	A	F	L	H	R	F	A	A	.	.	.	.	A	G	A	A	I	R	Y
Query Conservation																																																																							.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																														.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	L	Y	G	P	E	P	I	R	R	V	L	W	E	T	I	K	D	A	F	S	A	I	P	G	V	K	F	Y	F	P	E	D	T	P	E	N	S	V	L	R	V	R	D	K	T	M	Q	G	I	P	T	Y	D	E	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				S																G	G	G	S	T	T						G	G	G	S		S	S										T	T	T					G	G	G
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																										356	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.
		445	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.				.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500								.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																						.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	A	V	H	S	D	E	V	E	D	I	L	A	L	D	I	A	L	R	R	.	.	.	N	D	T	E	W	Y	E	H	L	P	P	E	I	D	S	Q	L	V	H	K	L	Y	Y	G	H	F	M	C	Y	V	F	H	Q	D	Y	I	.	.	.	.	.	.	.	V	K	K	G	V	D	V	H	A	L	K	E	Q	M
Query Conservation																						.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																						.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	W	I	D	W	L	P	N	G	A	H	L	F	F	S	P	I	A	K	V	S	G	E	D	A	M	M	Q	Y	A	V	T	K	K	R	C	Q	E	A	G	L	D	F	I	G	T	F	T	V	G	M	R	E	M	H	H	I	V	C	I	V	F	N	K	K	D	L	I	Q	K	R	K	V	Q	W	L	M	R	T	L
Template Known Secondary structure		G	G	G	G	S	S	S	S								B				S																			T	T											S	S	S											T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		412	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.
		515	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.											.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570
Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	E	L	L	Q	Q	R	G	A	Q	Y	P	A	E	H	N	V	G	H	L	Y	K	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	E	T	L	Q	K	F	Y	R	E	N	D	P	T	N	S	M	N	P	G	I	G	K	T	S	K	R	K	N	W	Q	E	V
Query Conservation																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.
Template Conservation																																																													.
Template Sequence		I	D	D	C	A	A	N	G	W	G	E	Y	R	T	H	L	A	F	M	D	Q	I	M	E	T	Y	N	W	N	N	S	S	F	L	R	F	N	E	V	L	K	N	A	V	D	P	N	G	I	I	A	P	G	K	S	G	V	W	P	.	S	Q	Y	S	H	V
Template Known Secondary structure								T	T			B	S				G	G	G																												T	T			B		T	T	G	G	G				.	T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																																													.
Template SS confidence
		492	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550		.	.	.	.	.	.